Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Coix lacryma-jobi chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_013273CAG46826931233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %260677374
2NC_013273TAT5582958431533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
3NC_013273CTT467586768110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
4NC_013273GAA4898189921266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
5NC_013273TTG41131411324110 %66.67 %33.33 %0 %9 %260677380
6NC_013273ATT413128131401333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_013273AAT415402154121166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_013273AGA415757157671166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
9NC_013273TAA418149181591166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_013273ATA419057190681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_013273TAA419208192191266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_013273ATA420944209551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_013273ATA421037210471166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_013273CTA421375213861233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
15NC_013273CTT42140021411120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
16NC_013273AGA422456224671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %260677410
17NC_013273AGA429560295711266.67 %0 %33.33 %0 %8 %260677412
18NC_013273GAA430293303041266.67 %0 %33.33 %0 %8 %260677412
19NC_013273ATT432103321151333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_013273ATT432971329821233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_013273GTT53377233786150 %66.67 %33.33 %0 %6 %260677414
22NC_013273TGC43475034761120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %260677415
23NC_013273ATG440756407661133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %260677419
24NC_013273GCA442654426651233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %260677420
25NC_013273AAG444772447831266.67 %0 %33.33 %0 %8 %260677421
26NC_013273GAA448752487621166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
27NC_013273AAT448771487811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_013273TTC46274062751120 %66.67 %0 %33.33 %8 %260677431
29NC_013273ATA464974649841166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_013273TTA465511655221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_013273TTC56731667329140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
32NC_013273TCA469833698441233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %260677442
33NC_013273AGA476556765671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %260677442
34NC_013273TAT477613776231133.33 %66.67 %0 %0 %9 %260677442
35NC_013273TTC48108981101130 %66.67 %0 %33.33 %7 %260677442
36NC_013273TTC48155881569120 %66.67 %0 %33.33 %8 %260677442
37NC_013273CTT48268582696120 %66.67 %0 %33.33 %0 %260677442
38NC_013273AAT483193832051366.67 %33.33 %0 %0 %7 %260677442
39NC_013273ATA491596916061166.67 %33.33 %0 %0 %9 %260677442
40NC_013273TAC493413934241233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %260677442
41NC_013273AAG41043501043601166.67 %0 %33.33 %0 %9 %260677475
42NC_013273AAG41068531068641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %260677475
43NC_013273CAA41119971120071166.67 %0 %0 %33.33 %9 %260677475
44NC_013273TTA51128291128421433.33 %66.67 %0 %0 %7 %260677475
45NC_013273TTG4113280113290110 %66.67 %33.33 %0 %9 %260677475
46NC_013273ATT41149351149451133.33 %66.67 %0 %0 %9 %260677475
47NC_013273TTC5115112115126150 %66.67 %0 %33.33 %6 %260677475
48NC_013273TAA41181331181431166.67 %33.33 %0 %0 %9 %260677475
49NC_013273GTA41301141301251233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %260677475
50NC_013273ATT41403331403451333.33 %66.67 %0 %0 %7 %260677480