ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Millerozyma farinosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013255	TTA	4	401	411	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901918
2	NC_013255	TAT	4	575	587	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	25901918
3	NC_013255	TAT	4	1208	1218	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901918
4	NC_013255	TAT	4	4212	4223	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901918
5	NC_013255	TAA	4	4632	4645	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	25901918
6	NC_013255	TAT	5	5274	5289	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	25901918
7	NC_013255	TAT	4	5274	5285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	25901918
8	NC_013255	TAA	4	5965	5976	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901918
9	NC_013255	TAT	4	6375	6386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901918
10	NC_013255	ATA	5	6624	6637	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	25901918
11	NC_013255	GAT	4	6732	6742	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	25901918
12	NC_013255	TTA	7	8306	8326	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901918
13	NC_013255	TAT	4	8483	8494	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901918
14	NC_013255	ATA	5	8613	8627	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	25901918
15	NC_013255	ATT	5	9539	9553	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	25901918
16	NC_013255	TTC	4	9615	9626	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	25901918
17	NC_013255	AAT	4	10344	10354	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_013255	AAT	4	11278	11288	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
19	NC_013255	TAT	4	11312	11323	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
20	NC_013255	TAT	4	11997	12008	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
21	NC_013255	ATA	4	12147	12159	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	25901919
22	NC_013255	ATA	4	12678	12689	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
23	NC_013255	TAA	4	13149	13160	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
24	NC_013255	TAT	4	13534	13546	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	25901919
25	NC_013255	ATT	4	13650	13661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
26	NC_013255	TTC	4	13760	13771	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	25901919
27	NC_013255	AGA	5	13787	13801	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	25901919
28	NC_013255	AGA	4	13790	13801	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	25901919
29	NC_013255	ATT	4	14528	14539	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
30	NC_013255	ATA	4	14892	14902	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
31	NC_013255	TAT	4	15235	15245	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901919
32	NC_013255	TAT	4	15349	15360	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
33	NC_013255	TTA	7	18706	18726	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901919
34	NC_013255	TTA	4	18709	18720	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	25901919
35	NC_013255	ATT	4	18750	18761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
36	NC_013255	AGG	4	18795	18806	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	25901919
37	NC_013255	TTA	4	18872	18883	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
38	NC_013255	GTT	4	19019	19029	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	25901919
39	NC_013255	ATT	4	19622	19632	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901919
40	NC_013255	AAT	4	19978	19989	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
41	NC_013255	TAA	4	20819	20830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
42	NC_013255	TAT	4	20975	20986	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
43	NC_013255	ATA	4	21502	21512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
44	NC_013255	AAT	4	24471	24482	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
45	NC_013255	AAT	4	24720	24730	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
46	NC_013255	TAA	5	25435	25449	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	25901919
47	NC_013255	TTA	4	25709	25721	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	25901919
48	NC_013255	TAA	4	26128	26138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
49	NC_013255	ATA	4	26226	26236	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
50	NC_013255	AAT	4	26829	26840	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
51	NC_013255	TAT	4	26985	26999	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	25901919
52	NC_013255	TAA	5	27059	27072	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	25901919
53	NC_013255	AAT	4	27529	27539	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
54	NC_013255	ATA	4	28451	28462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_013255	AGT	4	28623	28633	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_013255	GTG	4	28959	28971	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_013255	TAT	4	30056	30067	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_013255	ATT	4	32773	32784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901920
59	NC_013255	TTC	5	33409	33424	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	25901920
60	NC_013255	TAG	4	37198	37209	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	25901920
61	NC_013255	ATA	4	37499	37509	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901920
62	NC_013255	TAT	4	37547	37557	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901920
63	NC_013255	TAA	4	37884	37895	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901920
64	NC_013255	TAT	4	38270	38281	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901920
65	NC_013255	TAT	4	38973	38984	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901920

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Millerozyma farinosa mitochondrion