ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Millerozyma farinosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013255	TTA	4	401	411	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901918
2	NC_013255	TAT	4	575	587	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	25901918
3	NC_013255	TTTA	5	645	664	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	25901918
4	NC_013255	TAT	4	1208	1218	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901918
5	NC_013255	TA	6	1574	1584	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901918
6	NC_013255	TA	7	1837	1850	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_013255	AT	6	2059	2069	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_013255	TA	6	2074	2085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013255	AAAG	3	2088	2099	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_013255	TAAAA	3	2241	2254	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_013255	ATTTAT	3	2679	2696	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_013255	AT	6	2804	2815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_013255	ACTAA	3	3158	3172	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013255	ACTAA	3	3158	3172	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013255	AT	7	3173	3185	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_013255	TAAA	3	4071	4083	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	25901918
17	NC_013255	TAT	4	4212	4223	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901918
18	NC_013255	TAA	4	4632	4645	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	25901918
19	NC_013255	TAAA	4	4829	4845	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	25901918
20	NC_013255	ATAAAA	3	4868	4885	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	25901918
21	NC_013255	AT	10	5093	5113	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901918
22	NC_013255	AT	8	5093	5108	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	25901918
23	NC_013255	TAT	5	5274	5289	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	25901918
24	NC_013255	TAT	4	5274	5285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	25901918
25	NC_013255	GGAT	3	5724	5734	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	25901918
26	NC_013255	TTAAA	3	5906	5919	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	25901918
27	NC_013255	TAA	4	5965	5976	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901918
28	NC_013255	AT	6	6002	6013	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901918
29	NC_013255	AT	7	6016	6028	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25901918
30	NC_013255	AT	6	6016	6027	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	25901918
31	NC_013255	AAAT	3	6081	6092	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	25901918
32	NC_013255	AT	7	6091	6103	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25901918
33	NC_013255	AT	8	6322	6337	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	25901918
34	NC_013255	AT	6	6322	6333	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	25901918
35	NC_013255	TAT	4	6375	6386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901918
36	NC_013255	TA	6	6537	6547	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901918
37	NC_013255	ATA	5	6624	6637	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	25901918
38	NC_013255	GAT	4	6732	6742	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	25901918
39	NC_013255	AT	6	6897	6907	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901918
40	NC_013255	ATATA	3	6934	6947	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	25901918
41	NC_013255	TAAA	3	7060	7070	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	25901918
42	NC_013255	AAAT	3	7498	7508	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	25901918
43	NC_013255	TTA	7	8306	8326	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901918
44	NC_013255	AT	6	8434	8445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901918
45	NC_013255	TAT	4	8483	8494	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901918
46	NC_013255	ATA	5	8613	8627	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	25901918
47	NC_013255	ATTTAA	3	8628	8646	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	25901918
48	NC_013255	TCTAAT	3	8795	8812	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	25901918
49	NC_013255	ATT	5	9539	9553	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	25901918
50	NC_013255	TTC	4	9615	9626	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	25901918
51	NC_013255	AATAAA	3	9793	9810	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	25901918
52	NC_013255	AT	6	9918	9928	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_013255	AT	6	9933	9943	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_013255	AAT	4	10344	10354	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_013255	TA	7	11135	11147	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25901918
56	NC_013255	AAATAA	3	11207	11224	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_013255	AAT	4	11278	11288	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
58	NC_013255	TAT	4	11312	11323	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
59	NC_013255	AT	6	11338	11348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901919
60	NC_013255	TAT	4	11997	12008	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
61	NC_013255	ATA	4	12147	12159	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	25901919
62	NC_013255	ATATT	3	12461	12475	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	25901919
63	NC_013255	ATATT	3	12461	12475	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	25901919
64	NC_013255	ATA	4	12678	12689	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
65	NC_013255	TTAA	3	12891	12902	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901919
66	NC_013255	ATAAAA	3	13011	13028	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	25901919
67	NC_013255	TAA	4	13149	13160	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
68	NC_013255	TTAA	5	13164	13183	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	25901919
69	NC_013255	TAT	4	13534	13546	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	25901919
70	NC_013255	ATT	4	13650	13661	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
71	NC_013255	TTAT	3	13715	13726	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	25901919
72	NC_013255	TTAT	3	13715	13726	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	25901919
73	NC_013255	TTC	4	13760	13771	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	25901919
74	NC_013255	AGA	5	13787	13801	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	25901919
75	NC_013255	AGA	4	13790	13801	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	25901919
76	NC_013255	TA	6	14018	14028	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901919
77	NC_013255	AAAT	3	14134	14145	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	25901919
78	NC_013255	AT	7	14369	14381	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25901919
79	NC_013255	AATT	3	14392	14403	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901919
80	NC_013255	ATTAA	3	14456	14470	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	25901919
81	NC_013255	ATT	4	14528	14539	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
82	NC_013255	ATA	4	14892	14902	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
83	NC_013255	TAT	4	15235	15245	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901919
84	NC_013255	TAT	4	15349	15360	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
85	NC_013255	TA	9	15510	15527	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
86	NC_013255	TA	8	15510	15525	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013255	AAAAAT	4	15577	15601	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_013255	AT	6	18484	18494	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901919
89	NC_013255	TTA	7	18706	18726	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901919
90	NC_013255	TTA	4	18709	18720	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	25901919
91	NC_013255	ATT	4	18750	18761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
92	NC_013255	AGG	4	18795	18806	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	25901919
93	NC_013255	TATT	3	18842	18856	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	25901919
94	NC_013255	TATT	3	18842	18853	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	25901919
95	NC_013255	TTA	4	18872	18883	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
96	NC_013255	TTTTA	3	18929	18943	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	25901919
97	NC_013255	GTT	4	19019	19029	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	25901919
98	NC_013255	TTTA	3	19200	19210	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	25901919
99	NC_013255	AATT	3	19319	19329	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901919
100	NC_013255	ATT	4	19622	19632	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25901919
101	NC_013255	TAAA	4	19764	19779	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	25901919
102	NC_013255	TAAA	3	19768	19779	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	25901919
103	NC_013255	TA	7	19926	19940	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	25901919
104	NC_013255	AAT	4	19978	19989	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
105	NC_013255	TA	7	20077	20089	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25901919
106	NC_013255	TA	6	20078	20089	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	25901919
107	NC_013255	TA	11	20133	20153	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901919
108	NC_013255	AATATA	4	20142	20165	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	25901919
109	NC_013255	AT	6	20179	20190	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901919
110	NC_013255	TA	6	20533	20543	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25901919
111	NC_013255	TAA	4	20819	20830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
112	NC_013255	TAT	4	20975	20986	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25901919
113	NC_013255	ATA	4	21502	21512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
114	NC_013255	ATAA	3	21519	21530	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	25901919
115	NC_013255	TTCT	3	22931	22943	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	25901919
116	NC_013255	TAAT	3	23934	23945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901919
117	NC_013255	TAAG	3	24021	24031	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	25901919
118	NC_013255	TA	7	24360	24372	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25901919
119	NC_013255	AAT	4	24471	24482	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25901919
120	NC_013255	TAAA	3	24484	24496	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	25901919
121	NC_013255	AAT	4	24720	24730	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
122	NC_013255	TAAAA	3	24891	24905	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	25901919
123	NC_013255	AATA	3	25120	25130	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	25901919
124	NC_013255	TAAA	3	25204	25216	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	25901919
125	NC_013255	AAAT	3	25206	25217	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	25901919
126	NC_013255	TAAT	3	25234	25245	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901919
127	NC_013255	TAA	5	25435	25449	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	25901919
128	NC_013255	TTA	4	25709	25721	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	25901919
129	NC_013255	TAA	4	26128	26138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
130	NC_013255	AGAATA	3	26141	26159	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	25901919
131	NC_013255	ATA	4	26226	26236	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25901919
132	NC_013255	AT	6	26371	26382	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901919
133	NC_013255	TA	6	26517	26528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25901919
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151	NC_013255	AATA	3	28684	28695	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013255	TATT	4	28895	28910	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
153	NC_013255	TATT	3	28895	28906	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013255	GTG	4	28959	28971	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
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158	NC_013255	TA	7	31292	31305	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_013255	ATAA	5	39087	39106	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
181	NC_013255	ATAA	4	39087	39102	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Millerozyma farinosa mitochondrion