ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Radopholus similis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013253	ATT	4	303	314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_013253	TAT	4	1030	1042	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	258649589
3	NC_013253	ATT	4	1234	1246	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	258649589
4	NC_013253	ATT	4	1470	1480	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	258649589
5	NC_013253	TAT	5	1766	1780	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	258649589
6	NC_013253	ATT	4	3153	3163	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	258649591
7	NC_013253	ATA	4	3789	3800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258649591
8	NC_013253	TAT	4	4236	4248	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	258649592
9	NC_013253	TTA	4	4917	4929	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_013253	TAT	4	5509	5519	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_013253	TAT	4	5714	5725	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649593
12	NC_013253	TAT	6	5764	5784	21	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	258649593
13	NC_013253	ATT	4	6061	6072	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_013253	ATT	4	6370	6381	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649594
15	NC_013253	TAA	4	6450	6461	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	258649594
16	NC_013253	TAT	4	8003	8014	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649595
17	NC_013253	TTA	11	8339	8371	33	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	258649596
18	NC_013253	ATT	4	8527	8537	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_013253	TAG	4	8825	8835	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_013253	ATT	4	10603	10614	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_013253	TTA	4	11072	11084	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_013253	TTA	5	11395	11410	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_013253	TTA	5	11697	11712	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_013253	TTA	5	11999	12014	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_013253	TTA	5	12301	12316	16	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_013253	ATT	5	12940	12954	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258649597
27	NC_013253	TTA	4	13026	13036	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	258649597
28	NC_013253	ATT	4	13084	13094	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	258649597
29	NC_013253	TTA	4	14082	14093	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649598
30	NC_013253	TAT	4	14371	14382	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649598
31	NC_013253	TAT	4	14537	14548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649598
32	NC_013253	TAT	4	15236	15247	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649599
33	NC_013253	TAA	4	15492	15503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	258649599
34	NC_013253	TAT	4	15546	15556	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	258649599
35	NC_013253	TTA	4	15612	15623	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258649599
36	NC_013253	ATT	4	15822	15833	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	258649599
37	NC_013253	TAT	5	15928	15942	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	258649599
38	NC_013253	TAT	5	16259	16273	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	296863301
39	NC_013253	TTG	4	16736	16747	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	296863301

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Radopholus similis mitochondrion