ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rhopaea magnicornis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013252	AATT	3	631	642	12	50 %	50 %	0 %	8 %	258650139
2	NC_013252	ACCC	3	3760	3770	11	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
3	NC_013252	CCAT	3	3771	3782	12	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_013252	A	12	3787	3798	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013252	TTTAAC	4	4297	4320	24	33.33 %	50 %	16.67 %	4 %	258650143
6	NC_013252	ATA	4	4793	4804	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	258650144
7	NC_013252	CATT	3	5367	5377	11	25 %	50 %	25 %	9 %	258650144
8	NC_013252	AAT	4	5526	5537	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	258650145
9	NC_013252	TATT	3	5538	5548	11	25 %	75 %	0 %	9 %	258650145
10	NC_013252	CCAATT	3	6585	6602	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	5 %	258650146
11	NC_013252	TAA	4	7678	7690	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	258650146
12	NC_013252	AT	6	7751	7761	11	50 %	50 %	0 %	9 %	258650146
13	NC_013252	CATA	3	8060	8070	11	50 %	25 %	25 %	9 %	258650147
14	NC_013252	TAA	4	8113	8127	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258650147
15	NC_013252	AACTA	3	8268	8281	14	60 %	20 %	20 %	7 %	258650147
16	NC_013252	TAA	5	8637	8652	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	258650147
17	NC_013252	AAT	4	8871	8882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	258650147
18	NC_013252	ATA	4	8902	8913	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	258650147
19	NC_013252	AAAAT	3	9042	9055	14	80 %	20 %	0 %	7 %	258650147
20	NC_013252	TAAAAA	3	9118	9136	19	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	258650147
21	NC_013252	TTAAAA	3	9541	9559	19	66.67 %	33.33 %	0 %	10 %	258650148
22	NC_013252	ATT	4	9772	9782	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_013252	T	14	10571	10584	14	0 %	100 %	0 %	7 %	258650150
24	NC_013252	ATA	4	11573	11585	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	258650151
25	NC_013252	TAA	4	12072	12084	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	258650151
26	NC_013252	CTAAAT	3	12161	12177	17	50 %	33.33 %	16.67 %	5 %	258650151
27	NC_013252	ATA	5	12538	12552	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_013252	TCAT	3	12824	12835	12	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_013252	ATTT	3	13289	13300	12	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_013252	ATCT	3	13721	13731	11	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_013252	TAATT	3	13998	14012	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013252	ATA	4	14128	14138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_013252	ACT	5	14292	14305	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_013252	TA	7	14803	14815	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_013252	TTCTAT	3	16082	16099	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
36	NC_013252	AT	7	16260	16273	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_013252	ATA	4	16334	16344	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_013252	AT	27	16442	16495	54	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_013252	ATAA	3	16563	16573	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013252	T	14	16599	16612	14	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_013252	TA	6	16747	16757	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013252	TTCTT	3	16812	16826	15	0 %	80 %	20 %	6 %	Non-Coding
43	NC_013252	TAAA	5	16964	16983	20	75 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Rhopaea magnicornis mitochondrion