ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mongoloraphidia harmandi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013251	ATT	4	208	218	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	258649575
2	NC_013251	TTTC	3	409	419	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	258649575
3	NC_013251	TTA	4	989	1001	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	258649575
4	NC_013251	ATT	4	1108	1119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649575
5	NC_013251	TTTAAA	3	1268	1286	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
6	NC_013251	TAC	4	1860	1871	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	258649576
7	NC_013251	TTA	7	1945	1965	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	258649576
8	NC_013251	GAAA	3	2156	2167	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	258649576
9	NC_013251	TCT	4	2795	2805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	258649576
10	NC_013251	ATA	4	4488	4499	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649579
11	NC_013251	TAT	4	4498	4509	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649579
12	NC_013251	ATT	4	4518	4528	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	258649579
13	NC_013251	AATTT	3	4752	4766	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	258649580
14	NC_013251	ATT	4	5481	5492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649581
15	NC_013251	TTTA	3	6114	6124	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_013251	TAAA	5	6203	6223	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	258649582
17	NC_013251	TA	8	6296	6311	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	258649582
18	NC_013251	TAAAA	4	6434	6453	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	258649582
19	NC_013251	AAATT	3	6474	6489	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	258649582
20	NC_013251	AAAT	3	6523	6533	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	258649582
21	NC_013251	ATA	4	6564	6574	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	258649582
22	NC_013251	TAAT	4	6905	6920	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	258649582
23	NC_013251	TAA	4	7163	7174	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649582
24	NC_013251	TGAA	3	7250	7260	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	258649582
25	NC_013251	ATT	5	7605	7619	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	258649582
26	NC_013251	TAAA	3	7640	7651	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	258649582
27	NC_013251	TTC	4	8167	8178	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	258649583
28	NC_013251	AATT	3	8393	8403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	258649583
29	NC_013251	A	14	8788	8801	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	258649583
30	NC_013251	ATT	4	8807	8818	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649583
31	NC_013251	AT	6	8872	8882	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	258649583
32	NC_013251	ATT	4	9050	9061	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649583
33	NC_013251	ATA	4	9062	9072	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	258649583
34	NC_013251	A	14	9197	9210	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	258649583
35	NC_013251	T	13	9237	9249	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	258649583
36	NC_013251	ATTAAA	3	9255	9272	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	258649583
37	NC_013251	TAAA	3	9436	9446	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	258649584
38	NC_013251	ATAAAA	3	9544	9562	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	258649584
39	NC_013251	ATAA	3	9564	9575	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	258649584
40	NC_013251	AT	12	9644	9666	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013251	ATT	4	9678	9688	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013251	TAT	4	9740	9750	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	258649585
43	NC_013251	TAT	8	9983	10005	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649585
44	NC_013251	TAA	5	10044	10057	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	258649585
45	NC_013251	TTACA	3	10157	10170	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	258649585
46	NC_013251	GAA	4	10855	10866	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	258649586
47	NC_013251	TAA	4	10927	10938	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649586
48	NC_013251	TTTA	3	11126	11136	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	258649586
49	NC_013251	AT	6	11313	11323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	258649586
50	NC_013251	TAAA	3	11461	11473	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	258649587
51	NC_013251	TCC	4	11727	11738	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	258649587
52	NC_013251	ATAAAA	3	11852	11870	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	258649587
53	NC_013251	AAAATA	3	11909	11926	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	258649587
54	NC_013251	AAAT	3	12065	12075	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	258649587
55	NC_013251	ATTA	3	12175	12186	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	258649587
56	NC_013251	CTA	4	12332	12343	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	258649587
57	NC_013251	ATA	5	12822	12836	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_013251	TAAA	3	12918	12928	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_013251	TA	6	13327	13338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_013251	AAATT	4	13438	13456	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_013251	TAA	4	13759	13770	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013251	AAAT	3	13945	13955	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_013251	TTAA	3	14014	14025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_013251	AAATA	4	14069	14088	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
65	NC_013251	AAAT	3	14567	14577	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_013251	A	13	14837	14849	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_013251	ATA	4	14858	14869	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_013251	ATA	4	15023	15034	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_013251	AATT	3	15061	15071	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_013251	ATA	4	15187	15198	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_013251	TAAAT	3	15308	15322	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_013251	ATA	4	15351	15362	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_013251	T	16	15452	15467	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_013251	TAT	7	15509	15529	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_013251	TA	8	15692	15707	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_013251	TA	6	15715	15726	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_013251	AT	9	15730	15747	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_013251	TA	6	15789	15801	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_013251	ATA	4	15806	15818	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_013251	TA	10	15813	15833	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_013251	TA	8	15846	15861	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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