ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Macrogyrus oblongus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013249	AAT	4	1116	1127	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649547
2	NC_013249	TCT	4	2043	2057	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	258649548
3	NC_013249	GGA	4	2137	2147	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	258649548
4	NC_013249	TAAA	3	2681	2691	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	258649548
5	NC_013249	TACA	3	4939	4950	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	258649552
6	NC_013249	TATTT	3	5002	5016	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	258649552
7	NC_013249	AAT	4	5190	5201	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649552
8	NC_013249	TA	6	5529	5539	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_013249	ATTT	3	5845	5855	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	258649553
10	NC_013249	AATTT	3	6289	6302	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_013249	TA	6	6348	6359	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	258649554
12	NC_013249	AAT	4	6363	6373	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	258649554
13	NC_013249	A	13	6593	6605	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	258649554
14	NC_013249	AAAAAT	3	6925	6943	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	258649554
15	NC_013249	AAATAA	3	7324	7342	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	258649554
16	NC_013249	AAT	4	7760	7772	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	258649554
17	NC_013249	ATA	4	7789	7800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649554
18	NC_013249	TTAA	3	8171	8181	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	258649555
19	NC_013249	AATT	3	8662	8672	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	258649555
20	NC_013249	AT	6	8928	8939	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	258649555
21	NC_013249	AAAT	3	9049	9059	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	258649555
22	NC_013249	A	15	9136	9150	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	258649555
23	NC_013249	ATT	4	9232	9243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649555
24	NC_013249	ATATAA	4	9390	9413	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649555
25	NC_013249	TAA	4	9537	9548	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649556
26	NC_013249	TAA	4	9678	9689	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649556
27	NC_013249	TAA	5	9914	9928	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	258649557
28	NC_013249	TAT	4	10002	10012	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	258649557
29	NC_013249	TTTTTA	3	10169	10186	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	258649557
30	NC_013249	ATAA	4	11685	11700	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	258649559
31	NC_013249	A	15	11815	11829	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	258649559
32	NC_013249	TAAA	3	12039	12050	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	258649559
33	NC_013249	AATTAA	5	12105	12134	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	258649559
34	NC_013249	TAA	4	12545	12557	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	258649559
35	NC_013249	TAA	4	12658	12669	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_013249	AT	7	12688	12700	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_013249	TAAAAT	3	12716	12734	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_013249	A	17	12969	12985	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_013249	AAATT	3	13030	13043	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_013249	TAAA	3	13064	13074	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_013249	TTA	4	13389	13400	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_013249	TTAA	6	13571	13592	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_013249	ATTA	7	13599	13624	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_013249	ATT	4	14299	14310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_013249	AAT	4	14673	14683	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_013249	AATT	3	14800	14811	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_013249	TA	7	15045	15057	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_013249	TAAT	3	15244	15255	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_013249	ATTT	3	15279	15290	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013249	T	13	15379	15391	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_013249	TAA	4	15516	15526	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_013249	TA	7	15533	15547	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_013249	TTA	4	15545	15557	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_013249	TAA	5	15558	15572	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_013249	TAAT	3	15577	15589	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_013249	AATT	3	15609	15620	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_013249	AATTAA	3	15646	15662	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_013249	TTTAA	3	15685	15700	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_013249	T	19	15743	15761	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_013249	TAT	4	15814	15826	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_013249	AT	13	15844	15868	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_013249	AT	6	15871	15882	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_013249	TA	9	16034	16050	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_013249	T	14	16121	16134	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013249	TTAT	4	16148	16163	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_013249	ATTT	3	16273	16284	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013249	AT	8	16292	16307	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_013249	AT	13	16332	16356	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_013249	AAGA	3	16447	16458	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_013249	TAA	5	16470	16484	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Macrogyrus oblongus mitochondrion