ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ramulus hainanense mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013185	TAAT	3	197	207	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	256985351
2	NC_013185	AATC	3	209	220	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	256985351
3	NC_013185	ATA	5	403	417	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	256985351
4	NC_013185	ATA	4	484	495	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985351
5	NC_013185	TAA	4	500	511	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985351
6	NC_013185	AAT	4	609	620	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985351
7	NC_013185	TAA	4	818	829	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985351
8	NC_013185	CAA	4	1133	1143	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	256985351
9	NC_013185	ATA	4	1150	1161	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985351
10	NC_013185	AAT	4	2797	2808	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985352
11	NC_013185	ATT	4	2810	2821	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	256985352
12	NC_013185	ATA	4	3795	3806	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_013185	AT	8	3847	3863	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	256985354
14	NC_013185	ATA	4	3862	3873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985354
15	NC_013185	AAAAC	3	3928	3942	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	256985354
16	NC_013185	TTCA	3	4187	4197	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	256985355
17	NC_013185	ATT	4	4533	4544	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	256985355
18	NC_013185	AT	6	5438	5448	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_013185	TAA	4	5515	5526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985357
20	NC_013185	AT	6	5950	5961	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_013185	AATA	3	6232	6243	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	256985358
22	NC_013185	TAAA	3	6749	6759	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	256985358
23	NC_013185	ATAAA	4	6796	6816	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	256985358
24	NC_013185	TTCAAA	3	7143	7159	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	256985358
25	NC_013185	TAAA	3	7193	7204	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	256985358
26	NC_013185	TAA	4	7636	7647	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985358
27	NC_013185	A	15	7887	7901	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	256985358
28	NC_013185	GCAAAA	3	8066	8083	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	256985359
29	NC_013185	TAA	4	8348	8360	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	256985359
30	NC_013185	TTA	4	8471	8482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	256985359
31	NC_013185	ATA	4	8855	8867	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	256985359
32	NC_013185	CAAA	3	8999	9009	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	256985359
33	NC_013185	AATAAA	3	9069	9087	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	256985359
34	NC_013185	ATA	6	9090	9110	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	256985359
35	NC_013185	TAAAA	3	9236	9250	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	256985359
36	NC_013185	A	14	9258	9271	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	256985359
37	NC_013185	AT	6	9447	9457	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	256985360
38	NC_013185	AAAT	3	9482	9493	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	256985360
39	NC_013185	ATTAA	3	9612	9625	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	256985360
40	NC_013185	ATT	4	9732	9742	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_013185	TAA	4	10010	10021	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985361
42	NC_013185	ATA	4	10027	10038	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985361
43	NC_013185	TAA	4	10095	10106	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985361
44	NC_013185	TAA	4	10606	10617	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	256985362
45	NC_013185	CCAA	3	11193	11204	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	256985362
46	NC_013185	TAAT	4	11362	11377	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	256985362
47	NC_013185	AATT	3	11500	11511	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	256985363
48	NC_013185	A	13	11624	11636	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	256985363
49	NC_013185	CAAA	3	11655	11665	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	256985363
50	NC_013185	ATAAAC	3	11829	11846	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	256985363
51	NC_013185	ATA	4	11855	11865	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	256985363
52	NC_013185	ACAA	3	11916	11927	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	256985363
53	NC_013185	TA	8	12090	12105	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	256985363
54	NC_013185	AAAT	3	12487	12498	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013185	AAAAAT	3	12865	12882	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_013185	AAAT	4	13233	13248	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_013185	TAAAT	3	13430	13444	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013185	ATAA	4	13557	13572	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013185	TAAA	3	13576	13587	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013185	AAATA	3	14056	14070	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_013185	TAA	4	14094	14104	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_013185	AAT	4	14359	14369	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_013185	AATA	3	14456	14466	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_013185	TAT	4	14797	14811	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_013185	ATAA	3	15448	15459	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_013185	TTAA	4	15542	15557	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ramulus hainanense mitochondrion