ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Neopanorpa pulchra mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013180	CTT	4	187	198	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_013180	AATT	3	1148	1159	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	256985281
3	NC_013180	TAATTA	3	3104	3121	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	256985283
4	NC_013180	TAT	4	3903	3913	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	256985284
5	NC_013180	ATT	4	3924	3936	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	256985284
6	NC_013180	TTTA	3	4103	4114	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	256985285
7	NC_013180	ATT	4	4237	4247	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	256985285
8	NC_013180	TTTAAC	4	4296	4319	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	256985285
9	NC_013180	ATT	5	5529	5543	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	256985287
10	NC_013180	ATGA	3	5964	5974	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_013180	CTTT	3	6125	6135	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_013180	AATA	3	6295	6306	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	256985288
13	NC_013180	CAAA	3	6327	6337	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	256985288
14	NC_013180	TTA	4	7165	7176	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	256985288
15	NC_013180	TAA	4	7274	7284	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	256985288
16	NC_013180	AAG	4	7414	7425	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	256985288
17	NC_013180	ATA	5	7558	7571	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	256985288
18	NC_013180	TAA	4	7708	7720	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	256985288
19	NC_013180	TAA	4	7748	7758	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	256985288
20	NC_013180	ATAAAT	3	7980	7997	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	256985288
21	NC_013180	TTA	4	8558	8569	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	256985289
22	NC_013180	TAAA	3	8640	8651	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	256985289
23	NC_013180	AATT	3	8670	8682	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	256985289
24	NC_013180	AT	6	8918	8928	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	256985289
25	NC_013180	TTC	4	8936	8948	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	256985289
26	NC_013180	AAAT	3	9000	9010	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	256985289
27	NC_013180	AAAAT	3	9089	9102	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	256985289
28	NC_013180	TA	6	9213	9223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	256985289
29	NC_013180	ATA	4	9340	9352	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	256985289
30	NC_013180	TAT	5	9408	9422	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	256985289
31	NC_013180	TAA	4	9683	9693	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	256985290
32	NC_013180	TTTA	3	10141	10152	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	256985291
33	NC_013180	ATC	4	10397	10407	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	256985292
34	NC_013180	TTTA	3	10653	10664	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	256985292
35	NC_013180	TAT	4	10941	10951	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	256985292
36	NC_013180	AATT	3	11638	11649	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	256985293
37	NC_013180	CTA	4	12471	12482	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	256985293
38	NC_013180	AATT	3	12902	12913	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013180	TTCA	3	13119	13130	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_013180	TTA	4	13334	13345	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013180	TAAA	4	13543	13558	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013180	ATTT	3	14110	14121	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013180	AAC	4	14524	14534	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_013180	TAT	4	15219	15229	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_013180	ATAA	3	15389	15400	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_013180	TTAA	4	15483	15498	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Neopanorpa pulchra mitochondrion