ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Brettanomyces custersianus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013145	ATA	4	1	13	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_013145	AGA	4	454	464	11	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_013145	AAT	4	697	709	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_013145	ATA	4	954	965	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_013145	ATT	4	1031	1041	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_013145	ATA	4	1155	1167	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_013145	AAT	5	1968	1981	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_013145	ATA	4	2175	2185	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_013145	TAA	4	2714	2726	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_013145	TAA	4	2772	2783	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_013145	TAA	4	3045	3057	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_013145	TAA	4	3166	3178	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_013145	ATA	5	3249	3263	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_013145	TAT	4	3269	3280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_013145	ATT	4	3445	3456	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642726
16	NC_013145	ATA	5	4601	4616	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	25642726
17	NC_013145	ATT	4	5609	5620	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642726
18	NC_013145	GAA	4	5941	5952	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	25642726
19	NC_013145	TAA	4	6682	6693	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642726
20	NC_013145	TAA	4	8547	8558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_013145	TTA	4	8797	8807	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	25642727
22	NC_013145	TAT	4	9740	9751	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642727
23	NC_013145	AAT	4	10395	10406	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642727
24	NC_013145	ATA	4	11373	11386	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_013145	ATT	5	11569	11582	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_013145	TAT	4	12135	12146	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642727
27	NC_013145	TTA	4	12499	12511	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	25642727
28	NC_013145	TAA	4	13472	13483	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642727
29	NC_013145	ATA	4	13569	13581	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_013145	ATA	4	13781	13793	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_013145	ATA	4	13806	13817	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_013145	ATA	4	13827	13839	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_013145	ATA	4	14790	14802	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	25642727
34	NC_013145	ATA	5	14914	14928	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	25642727
35	NC_013145	ATA	4	15037	15047	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	25642727
36	NC_013145	ATA	4	15385	15398	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	25642727
37	NC_013145	AAT	4	16784	16794	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_013145	AGA	5	16924	16938	15	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
39	NC_013145	TAA	5	16942	16955	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_013145	ATA	4	17483	17495	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_013145	ATA	4	18159	18169	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013145	TAA	4	18176	18189	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_013145	ATT	4	18720	18731	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_013145	TAA	4	20185	20196	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642727
45	NC_013145	TAT	4	20194	20205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642727
46	NC_013145	TAT	4	20773	20784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642727
47	NC_013145	ATT	4	21099	21109	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_013145	TAA	4	21109	21120	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_013145	ATA	4	21122	21135	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_013145	TTA	4	21271	21282	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642727
51	NC_013145	TTA	4	21526	21537	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642727
52	NC_013145	ATT	4	22410	22421	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642727
53	NC_013145	TAA	4	22680	22691	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642727
54	NC_013145	ATA	5	23331	23346	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_013145	ATA	12	23793	23826	34	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642728
56	NC_013145	ATT	6	24787	24804	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	25642728
57	NC_013145	ATA	4	24880	24891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642728
58	NC_013145	TAT	4	25433	25443	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	25642728
59	NC_013145	TAA	4	25869	25881	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	25642728
60	NC_013145	TAA	4	26712	26723	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642728
61	NC_013145	TAT	4	26754	26765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	25642728
62	NC_013145	TAT	5	28724	28738	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	25642728
63	NC_013145	TAA	5	28930	28943	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	25642728
64	NC_013145	ATT	4	28954	28966	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_013145	TAA	4	29268	29279	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	25642728
66	NC_013145	TAT	4	30041	30051	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Brettanomyces custersianus mitochondrion