ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Selaginella moellendorffii plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_013086GGT14874915420 %33.33 %66.67 %0 %2 %Non-Coding
2NC_013086ACGG3183618461125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
3NC_013086TATC7192019472825 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
4NC_013086TCTA7194819752825 %50 %0 %25 %10 %Non-Coding
5NC_013086GATA3200020111250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
6NC_013086GATG7475947852725 %25 %50 %0 %7 %Non-Coding
7NC_013086AGT4580558171333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
8NC_013086CCGCTG362456262180 %16.67 %33.33 %50 %5 %Non-Coding
9NC_013086GCG463786388110 %0 %66.67 %33.33 %9 %Non-Coding
10NC_013086GGAT3764276521125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
11NC_013086ATGAA3800080141560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
12NC_013086CGA4920392131133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %255961294
13NC_013086CATT313304133141125 %50 %0 %25 %9 %255961295
14NC_013086TCGA314595146061225 %25 %25 %25 %8 %255961296
15NC_013086TGA415445154551133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %255961296
16NC_013086CCGG31581415824110 %0 %50 %50 %9 %255961296
17NC_013086TAA416098161081166.67 %33.33 %0 %0 %9 %255961296
18NC_013086ACAGAA316594166111866.67 %0 %16.67 %16.67 %5 %255961296
19NC_013086AAG516704167181566.67 %0 %33.33 %0 %6 %255961296
20NC_013086TGGAGT316857168741816.67 %33.33 %50 %0 %0 %255961296
21NC_013086GGCC31753317543110 %0 %50 %50 %9 %255961296
22NC_013086CAAAC317709177231560 %0 %0 %40 %6 %255961296
23NC_013086CCGG31918019190110 %0 %50 %50 %9 %Non-Coding
24NC_013086TA2119765198054150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_013086CG62203322043110 %0 %50 %50 %9 %Non-Coding
26NC_013086TCT42450824518110 %66.67 %0 %33.33 %9 %255961300
27NC_013086TA625343253541250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_013086TTTTA326214262271420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_013086AGC427221272321233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
30NC_013086AGCG327346273561125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
31NC_013086CCA427393274041233.33 %0 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
32NC_013086TCAA328419284301250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
33NC_013086GGAT328448284581125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
34NC_013086TC62853328543110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
35NC_013086GTCC32879528806120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
36NC_013086CGAC328904289151225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
37NC_013086GATC329949299601225 %25 %25 %25 %8 %255961304
38NC_013086GATG430715307342025 %25 %50 %0 %5 %Non-Coding
39NC_013086CTAT331287312981225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
40NC_013086CGA431777317891333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
41NC_013086GAA1432043320844266.67 %0 %33.33 %0 %4 %Non-Coding
42NC_013086CCAT332115321251125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
43NC_013086GCC43522435235120 %0 %33.33 %66.67 %8 %255961306
44NC_013086TCT43598135992120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
45NC_013086GCG73606236083220 %0 %66.67 %33.33 %9 %Non-Coding
46NC_013086AT636637366471150 %50 %0 %0 %9 %255961307
47NC_013086TCGG33683136842120 %25 %50 %25 %8 %255961307
48NC_013086CG63702337033110 %0 %50 %50 %9 %255961307
49NC_013086AT737051370661650 %50 %0 %0 %0 %255961307
50NC_013086TCAA337076370871250 %25 %0 %25 %8 %255961307
51NC_013086ATT438571385831333.33 %66.67 %0 %0 %7 %255961307
52NC_013086ACCC340274402851225 %0 %0 %75 %0 %255961307
53NC_013086CTCC94347443509360 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
54NC_013086CG104420844226190 %0 %50 %50 %10 %Non-Coding
55NC_013086TCC184471444767540 %33.33 %0 %66.67 %3 %Non-Coding
56NC_013086CGTA344851448611125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
57NC_013086GGC44495144963130 %0 %66.67 %33.33 %7 %Non-Coding
58NC_013086CCCT34591245922110 %25 %0 %75 %9 %Non-Coding
59NC_013086GATCG346367463821620 %20 %40 %20 %6 %255961309
60NC_013086TA1247021470432350 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_013086GGA1347057470964033.33 %0 %66.67 %0 %7 %Non-Coding
62NC_013086ACCA347172471821150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
63NC_013086GTC44727147282120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
64NC_013086ATC547277472911533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
65NC_013086TA747754477671450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_013086TAA448168481791266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
67NC_013086GCCC35069250702110 %0 %25 %75 %9 %Non-Coding
68NC_013086TCAT650794508172425 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
69NC_013086GCG55311353126140 %0 %66.67 %33.33 %7 %Non-Coding
70NC_013086TGAA353185531971350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
71NC_013086GCC55337253387160 %0 %33.33 %66.67 %6 %Non-Coding
72NC_013086TGAT353576535871225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
73NC_013086ATT455298553081133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_013086GAA456544565541166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
75NC_013086ATGA457452574671650 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
76NC_013086GCC45754857558110 %0 %33.33 %66.67 %9 %Non-Coding
77NC_013086GTA457578575891233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
78NC_013086TATGG1758785588698520 %40 %40 %0 %2 %Non-Coding
79NC_013086GCG55964159655150 %0 %66.67 %33.33 %6 %Non-Coding
80NC_013086GATA359746597561150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
81NC_013086CGGG35981859829120 %0 %75 %25 %8 %Non-Coding
82NC_013086ACG460221602311133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
83NC_013086CATG361448614581125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
84NC_013086TGC106151461543300 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %Non-Coding
85NC_013086CTGC46156161576160 %25 %25 %50 %0 %Non-Coding
86NC_013086CT66159561605110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
87NC_013086TCCAT362247622611520 %40 %0 %40 %6 %Non-Coding
88NC_013086ACG662636626531833.33 %0 %33.33 %33.33 %5 %Non-Coding
89NC_013086AGG563234632481533.33 %0 %66.67 %0 %6 %Non-Coding
90NC_013086TGAG663626636492425 %25 %50 %0 %4 %Non-Coding
91NC_013086CTGCCG46372263745240 %16.67 %33.33 %50 %8 %Non-Coding
92NC_013086AT1664227642573150 %50 %0 %0 %3 %Non-Coding
93NC_013086TA664607646171150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
94NC_013086TAC964929649552733.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
95NC_013086TCGG36505365063110 %25 %50 %25 %9 %Non-Coding
96NC_013086TAT465447654581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %255961321
97NC_013086GCGG36636866379120 %0 %75 %25 %0 %Non-Coding
98NC_013086CAC1066617666463033.33 %0 %0 %66.67 %3 %Non-Coding
99NC_013086TCGG86685766888320 %25 %50 %25 %9 %Non-Coding
100NC_013086CAT467271672811133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %255961322
101NC_013086TACCA1468608686777040 %20 %0 %40 %2 %Non-Coding
102NC_013086AGCG369424694341125 %0 %50 %25 %9 %255961323
103NC_013086AAT470758707681166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
104NC_013086GGGC37218172192120 %0 %75 %25 %8 %Non-Coding
105NC_013086GATG373287732971125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
106NC_013086TA773535735501650 %50 %0 %0 %6 %255961328
107NC_013086ATG473601736111133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %255961328
108NC_013086CAT474082740931233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %255961328
109NC_013086ATTG374783747941225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
110NC_013086GAA475099751101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
111NC_013086ACT478617786281233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %255961334
112NC_013086TTTG37984779857110 %75 %25 %0 %9 %255961334
113NC_013086AATG383429834401250 %25 %25 %0 %8 %255961339
114NC_013086TC68417284183120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
115NC_013086AATG784340843713250 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
116NC_013086ACGA384390844011250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
117NC_013086GA685664856741150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
118NC_013086GGT88646286485240 %33.33 %66.67 %0 %4 %Non-Coding
119NC_013086GCGACG386844868611816.67 %0 %50 %33.33 %0 %Non-Coding
120NC_013086GGAA388727887371150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
121NC_013086AGGT389159891701225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
122NC_013086ATC491043910551333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
123NC_013086AGCT391219912301225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
124NC_013086CTTA391301913111125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
125NC_013086TCG49133991349110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
126NC_013086TTTA391575915861225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
127NC_013086GGT69173091747180 %33.33 %66.67 %0 %5 %Non-Coding
128NC_013086ATA791892919122166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
129NC_013086CTA1192168922003333.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
130NC_013086CG69230092310110 %0 %50 %50 %9 %Non-Coding
131NC_013086TCCT149258792641550 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
132NC_013086AGG792660926802133.33 %0 %66.67 %0 %0 %Non-Coding
133NC_013086TGCC89277692807320 %25 %25 %50 %3 %Non-Coding
134NC_013086TCC189296193011510 %33.33 %0 %66.67 %7 %Non-Coding
135NC_013086AG3793482935527150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
136NC_013086TGC79359793617210 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
137NC_013086CCG119381893851340 %0 %33.33 %66.67 %5 %Non-Coding
138NC_013086ATCG393914939241125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
139NC_013086AT1694831948613150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
140NC_013086GCCT89573095761320 %25 %25 %50 %6 %Non-Coding
141NC_013086ATCG397945979561225 %25 %25 %25 %8 %255961341
142NC_013086GCA499016990271233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
143NC_013086TAT41004051004151133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
144NC_013086TTC4101040101050110 %66.67 %0 %33.33 %9 %255961343
145NC_013086AT111024731024932150 %50 %0 %0 %4 %Non-Coding
146NC_013086CGTA31027761027871225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
147NC_013086TA61037781037901350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
148NC_013086AGCA31039601039711250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
149NC_013086CGAA31050491050591150 %0 %25 %25 %9 %255961348
150NC_013086TCG4105754105764110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %255961348
151NC_013086TC7107641107654140 %50 %0 %50 %7 %255961349
152NC_013086TA121086661086872250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
153NC_013086ATA71087901088112266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
154NC_013086ACC41090371090481233.33 %0 %0 %66.67 %8 %255961350
155NC_013086TCA41094651094751133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %255961350
156NC_013086AT61099751099861250 %50 %0 %0 %8 %255961350
157NC_013086ATTC31102171102271125 %50 %0 %25 %9 %255961350
158NC_013086CCGC3110448110459120 %0 %25 %75 %8 %255961350
159NC_013086ATTC31118011118131325 %50 %0 %25 %7 %255961350
160NC_013086TCC8112318112341240 %33.33 %0 %66.67 %4 %255961350
161NC_013086ATTC31127841127941125 %50 %0 %25 %9 %255961350
162NC_013086AACC41135251135401650 %0 %0 %50 %6 %255961350
163NC_013086TCCC3115930115940110 %25 %0 %75 %9 %255961352
164NC_013086CAG61173151173321833.33 %0 %33.33 %33.33 %5 %Non-Coding
165NC_013086CTC20118063118120580 %33.33 %0 %66.67 %6 %Non-Coding
166NC_013086GGC4118185118195110 %0 %66.67 %33.33 %9 %Non-Coding
167NC_013086TATC231182371183289225 %50 %0 %25 %4 %Non-Coding
168NC_013086GAC41187831187941233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
169NC_013086CCGA31188051188161225 %0 %25 %50 %0 %Non-Coding
170NC_013086TCC4119909119921130 %33.33 %0 %66.67 %7 %255961353
171NC_013086TTC4121677121688120 %66.67 %0 %33.33 %8 %255961354
172NC_013086GGCT3121869121879110 %25 %50 %25 %9 %Non-Coding
173NC_013086CCGT3121922121932110 %25 %25 %50 %9 %Non-Coding
174NC_013086GAA41227971228071166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
175NC_013086CGG4122866122878130 %0 %66.67 %33.33 %7 %Non-Coding
176NC_013086CCTG3122901122911110 %25 %25 %50 %9 %Non-Coding
177NC_013086CCCTCC4122945122968240 %16.67 %0 %83.33 %8 %Non-Coding
178NC_013086TCC11122945122977330 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
179NC_013086ATTC31237681237801325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
180NC_013086TGGG3123943123953110 %25 %75 %0 %9 %Non-Coding
181NC_013086AAT41239771239871166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
182NC_013086TAT41247021247131233.33 %66.67 %0 %0 %8 %255961356
183NC_013086CATA41288581288731650 %25 %0 %25 %6 %Non-Coding
184NC_013086AGGC91316871317223625 %0 %50 %25 %5 %Non-Coding
185NC_013086GTA41325861325961133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
186NC_013086TA161325931326243250 %50 %0 %0 %9 %255961359
187NC_013086CGAT31335281335381125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
188NC_013086CGG11133601133634340 %0 %66.67 %33.33 %5 %Non-Coding
189NC_013086CAG71338361338562133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
190NC_013086CT36133900133970710 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
191NC_013086GAG171344401344884933.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
192NC_013086AGGC81346441346753225 %0 %50 %25 %6 %Non-Coding
193NC_013086CCT7134772134792210 %33.33 %0 %66.67 %0 %Non-Coding
194NC_013086GGAA131348151348675350 %0 %50 %0 %5 %Non-Coding
195NC_013086GC6135144135154110 %0 %50 %50 %9 %Non-Coding
196NC_013086TCAC31352091352191125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
197NC_013086TAG111352521352843333.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
198NC_013086ATT41355501355611233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
199NC_013086ACC61357051357221833.33 %0 %0 %66.67 %5 %Non-Coding
200NC_013086CGA41361031361131133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
201NC_013086GAT41363971364091333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
202NC_013086CTAC31382801382911225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
203NC_013086CTTC3138714138724110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
204NC_013086CCGTCG3140590140607180 %16.67 %33.33 %50 %0 %Non-Coding
205NC_013086GCC4140894140904110 %0 %33.33 %66.67 %9 %Non-Coding
206NC_013086ACC81409671409902433.33 %0 %0 %66.67 %4 %Non-Coding
207NC_013086CT6141777141787110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
208NC_013086CATT81430811431123225 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
209NC_013086GTG4143260143271120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding