ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Mayetiola destructor mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013066	ATT	5	301	314	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506278
2	NC_013066	ATT	4	480	491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	255506278
3	NC_013066	AAT	4	513	524	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506278
4	NC_013066	AAT	4	537	548	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506278
5	NC_013066	AAT	4	873	884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506278
6	NC_013066	AAT	4	945	957	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506278
7	NC_013066	TAA	5	1037	1051	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506278
8	NC_013066	TAT	4	1467	1478	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	255506279
9	NC_013066	CTT	4	1718	1728	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	255506279
10	NC_013066	AGG	4	1807	1818	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	255506279
11	NC_013066	ATA	4	2842	2854	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506280
12	NC_013066	TAT	5	2935	2948	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506280
13	NC_013066	ATA	4	3587	3599	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506281
14	NC_013066	ATA	4	3632	3643	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506281
15	NC_013066	ATT	4	3850	3862	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506282
16	NC_013066	ATT	4	4755	4765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506283
17	NC_013066	TAA	4	5225	5236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_013066	TAT	7	5240	5261	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506284
19	NC_013066	ATT	5	5439	5453	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	255506284
20	NC_013066	ATT	4	5912	5922	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_013066	ATA	8	6010	6033	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506285
22	NC_013066	ATA	5	6409	6422	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506285
23	NC_013066	TAA	5	6557	6571	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506285
24	NC_013066	TAA	4	6939	6950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506285
25	NC_013066	ATA	5	8331	8344	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506286
26	NC_013066	ATA	5	8738	8752	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506286
27	NC_013066	AAT	4	8952	8963	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506286
28	NC_013066	ATT	4	9350	9360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_013066	TAA	4	9426	9437	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506288
30	NC_013066	ATT	4	9668	9678	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506288
31	NC_013066	ATA	5	9705	9719	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506288
32	NC_013066	TAA	4	9837	9848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506288
33	NC_013066	TAA	4	9922	9933	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506289
34	NC_013066	TAA	4	10468	10479	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506289
35	NC_013066	ATT	5	10564	10577	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506289
36	NC_013066	ATT	4	10865	10875	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506289
37	NC_013066	ATA	5	11099	11113	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506290
38	NC_013066	TAA	4	12432	12442	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_013066	ATA	4	12678	12689	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_013066	TAT	4	12876	12888	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_013066	AAT	4	12890	12900	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013066	AAT	5	12991	13006	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_013066	AAT	4	13648	13659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_013066	ATA	5	14024	14038	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Mayetiola destructor mitochondrion