ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mayetiola destructor mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013066	AATT	3	201	213	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	255506278
2	NC_013066	TTTA	3	217	228	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	255506278
3	NC_013066	ATT	5	301	314	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506278
4	NC_013066	ATT	4	480	491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	255506278
5	NC_013066	AAT	4	513	524	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506278
6	NC_013066	AAT	4	537	548	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506278
7	NC_013066	TA	8	679	693	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	255506278
8	NC_013066	AAT	4	873	884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506278
9	NC_013066	AAT	4	945	957	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506278
10	NC_013066	ATTAAA	3	999	1017	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	255506278
11	NC_013066	TAA	5	1037	1051	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506278
12	NC_013066	ATTT	3	1133	1144	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_013066	TAT	4	1467	1478	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	255506279
14	NC_013066	AAATT	4	1653	1671	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	255506279
15	NC_013066	CTT	4	1718	1728	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	255506279
16	NC_013066	AGG	4	1807	1818	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	255506279
17	NC_013066	AT	10	2719	2739	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506280
18	NC_013066	ATA	4	2842	2854	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506280
19	NC_013066	TATT	3	2882	2892	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	255506280
20	NC_013066	TAT	5	2935	2948	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506280
21	NC_013066	TAATTT	3	3058	3075	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	255506280
22	NC_013066	AATT	3	3256	3267	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	255506280
23	NC_013066	A	13	3472	3484	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_013066	ATTT	3	3554	3565	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	255506281
25	NC_013066	ATA	4	3587	3599	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506281
26	NC_013066	ATA	4	3632	3643	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506281
27	NC_013066	A	14	3640	3653	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	255506281
28	NC_013066	ATT	4	3850	3862	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506282
29	NC_013066	AAAT	3	4350	4361	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	255506283
30	NC_013066	AAATAT	3	4465	4483	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	255506283
31	NC_013066	ACATT	3	4491	4504	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	255506283
32	NC_013066	ATT	4	4755	4765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506283
33	NC_013066	ATTT	4	5017	5032	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	255506283
34	NC_013066	TAA	4	5225	5236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_013066	TAT	7	5240	5261	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506284
36	NC_013066	ATT	5	5439	5453	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	255506284
37	NC_013066	AAAT	3	5507	5519	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	255506284
38	NC_013066	AT	10	5701	5721	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_013066	AT	7	5774	5786	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_013066	AT	13	5811	5835	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013066	ATT	4	5912	5922	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013066	AT	8	5948	5963	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_013066	ATA	8	6010	6033	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506285
44	NC_013066	TAAA	3	6038	6048	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	255506285
45	NC_013066	TAAA	3	6167	6178	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	255506285
46	NC_013066	TAAA	3	6218	6229	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	255506285
47	NC_013066	TTAAA	4	6346	6364	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	255506285
48	NC_013066	ATA	5	6409	6422	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506285
49	NC_013066	AAAT	3	6512	6523	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	255506285
50	NC_013066	A	18	6542	6559	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	255506285
51	NC_013066	TAA	5	6557	6571	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506285
52	NC_013066	TAA	4	6939	6950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506285
53	NC_013066	AAAT	3	7388	7398	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	255506285
54	NC_013066	AATAA	3	7522	7535	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	255506285
55	NC_013066	AAAT	3	7854	7864	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	255506286
56	NC_013066	ATA	5	8331	8344	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506286
57	NC_013066	AAAT	3	8610	8620	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	255506286
58	NC_013066	ATA	5	8738	8752	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506286
59	NC_013066	AAT	4	8952	8963	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506286
60	NC_013066	A	14	8997	9010	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	255506286
61	NC_013066	A	12	9284	9295	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	255506287
62	NC_013066	ATT	4	9350	9360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_013066	TAA	4	9426	9437	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506288
64	NC_013066	TA	6	9595	9605	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506288
65	NC_013066	ATT	4	9668	9678	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506288
66	NC_013066	ATA	5	9705	9719	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506288
67	NC_013066	TTAA	3	9732	9743	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	255506288
68	NC_013066	ATTT	3	9824	9835	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	255506288
69	NC_013066	TAA	4	9837	9848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506288
70	NC_013066	TAA	4	9922	9933	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506289
71	NC_013066	T	18	10163	10180	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	255506289
72	NC_013066	TAA	4	10468	10479	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506289
73	NC_013066	TTAT	3	10480	10491	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	255506289
74	NC_013066	ATT	5	10564	10577	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506289
75	NC_013066	TTTA	3	10799	10809	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	255506289
76	NC_013066	ATT	4	10865	10875	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506289
77	NC_013066	ATTT	3	10937	10949	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	255506289
78	NC_013066	ATA	5	11099	11113	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506290
79	NC_013066	TAAAA	3	11517	11531	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	255506290
80	NC_013066	AATT	3	12017	12028	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_013066	ATAAA	3	12059	12073	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_013066	TAAA	3	12181	12192	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_013066	TTAAT	3	12382	12396	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_013066	TAA	4	12432	12442	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_013066	TTTTA	3	12492	12506	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013066	TAAA	3	12517	12527	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_013066	AT	6	12533	12543	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_013066	ATA	4	12678	12689	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_013066	A	13	12748	12760	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_013066	A	15	12842	12856	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_013066	TAT	4	12876	12888	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_013066	AAT	4	12890	12900	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_013066	AATT	3	12958	12970	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_013066	AAT	5	12991	13006	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_013066	AATTTA	3	13009	13026	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
96	NC_013066	AATTT	4	13160	13178	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_013066	T	14	13299	13312	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_013066	AAAT	3	13502	13512	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_013066	AAT	4	13648	13659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_013066	AAATT	3	13705	13718	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_013066	TTAA	3	13941	13952	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_013066	ATA	5	14024	14038	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_013066	TTAA	3	14043	14053	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_013066	T	14	14117	14130	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013066	TA	6	14155	14168	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_013066	TA	7	14170	14182	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_013066	TA	8	14187	14202	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_013066	TA	9	14264	14281	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_013066	TA	9	14343	14360	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_013066	TA	9	14422	14439	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_013066	TA	9	14501	14518	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_013066	TA	9	14580	14597	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_013066	TA	8	14659	14674	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_013066	TA	8	14736	14751	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Mayetiola destructor mitochondrion