ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhopalomyia pomum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013063	AAT	4	144	154	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	255506237
2	NC_013063	ATT	4	297	307	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506237
3	NC_013063	AAT	5	404	418	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	255506237
4	NC_013063	ATT	4	513	523	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506237
5	NC_013063	AAT	4	533	544	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	255506237
6	NC_013063	ATT	4	840	852	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	255506237
7	NC_013063	TAT	4	909	919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506237
8	NC_013063	ATA	4	1008	1019	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	255506237
9	NC_013063	ATT	5	1038	1051	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	255506237
10	NC_013063	ATT	4	2559	2569	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506238
11	NC_013063	AGA	4	3017	3028	12	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	255506239
12	NC_013063	TAA	4	3122	3133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	255506239
13	NC_013063	ATA	8	3642	3665	24	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	255506240
14	NC_013063	AAT	6	4032	4049	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	255506241
15	NC_013063	ATT	4	4775	4785	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506242
16	NC_013063	AAT	5	4858	4872	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	255506242
17	NC_013063	TTA	4	5232	5243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_013063	ATT	4	5429	5440	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	255506243
19	NC_013063	AAT	4	5488	5499	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	255506243
20	NC_013063	ATA	5	6321	6335	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	255506244
21	NC_013063	TTA	4	6744	6755	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	255506244
22	NC_013063	TAA	4	7065	7076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	255506244
23	NC_013063	TAA	4	7321	7331	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	255506244
24	NC_013063	AAT	7	7635	7656	22	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	255506245
25	NC_013063	TAA	4	7913	7925	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	255506245
26	NC_013063	AAT	4	8793	8803	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	255506245
27	NC_013063	ATA	4	8870	8880	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	255506245
28	NC_013063	TAT	4	8972	8982	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506246
29	NC_013063	ATA	5	9110	9124	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	255506246
30	NC_013063	TAT	4	9726	9736	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506247
31	NC_013063	ATT	4	9766	9777	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	255506247
32	NC_013063	TAA	4	9901	9912	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	255506247
33	NC_013063	TAT	4	10296	10306	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	255506248
34	NC_013063	TAT	4	10665	10676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	255506248
35	NC_013063	TAA	5	10934	10948	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	255506248
36	NC_013063	TAA	4	11353	11363	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	255506249
37	NC_013063	AAT	4	11835	11847	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	255506249
38	NC_013063	TTA	4	12229	12240	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013063	AAT	4	12311	12321	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013063	ATA	4	12565	12575	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_013063	TAA	4	12666	12677	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_013063	ATT	4	13571	13582	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_013063	TAA	4	13652	13664	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_013063	ATT	4	13732	13744	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_013063	ATA	4	13802	13813	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_013063	TAT	4	14150	14162	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_013063	TAT	4	14246	14258	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_013063	TTA	4	14325	14335	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_013063	TAT	4	14342	14354	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_013063	TTA	4	14420	14430	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Rhopalomyia pomum mitochondrion