ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rhopalomyia pomum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013063	T	21	113	133	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	255506237
2	NC_013063	AAT	4	144	154	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	255506237
3	NC_013063	TTTA	3	213	224	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	255506237
4	NC_013063	ATT	4	297	307	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506237
5	NC_013063	AAT	5	404	418	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506237
6	NC_013063	ATT	4	513	523	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506237
7	NC_013063	AAT	4	533	544	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506237
8	NC_013063	AT	11	672	694	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	255506237
9	NC_013063	ATT	4	840	852	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506237
10	NC_013063	TAT	4	909	919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506237
11	NC_013063	A	18	978	995	18	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	255506237
12	NC_013063	ATA	4	1008	1019	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506237
13	NC_013063	ATT	5	1038	1051	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	255506237
14	NC_013063	TAAA	3	1072	1082	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_013063	AAATT	4	1096	1116	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_013063	TA	8	1128	1143	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_013063	AATT	3	1404	1415	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	255506238
18	NC_013063	ATT	4	2559	2569	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506238
19	NC_013063	AT	16	2744	2774	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506239
20	NC_013063	AGA	4	3017	3028	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	255506239
21	NC_013063	TAA	4	3122	3133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506239
22	NC_013063	AATTA	3	3392	3406	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	255506239
23	NC_013063	TTAAT	3	3433	3446	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_013063	TA	12	3477	3501	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_013063	ATA	8	3642	3665	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506240
26	NC_013063	AAAT	3	3819	3831	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	255506241
27	NC_013063	TATTTT	3	3927	3944	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	255506241
28	NC_013063	AATT	3	3945	3955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506241
29	NC_013063	AAT	6	4032	4049	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	255506241
30	NC_013063	ATTT	3	4489	4499	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	255506242
31	NC_013063	T	15	4644	4658	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	255506242
32	NC_013063	ATT	4	4775	4785	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506242
33	NC_013063	AAT	5	4858	4872	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506242
34	NC_013063	TTA	4	5232	5243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_013063	AT	8	5248	5262	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	255506243
36	NC_013063	AGAA	3	5327	5337	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	255506243
37	NC_013063	ATT	4	5429	5440	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	255506243
38	NC_013063	AAT	4	5488	5499	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506243
39	NC_013063	AT	11	5759	5779	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013063	TA	12	5826	5849	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013063	TTAA	4	5920	5935	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	255506244
42	NC_013063	TTAA	3	5978	5988	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506244
43	NC_013063	TTTTAA	3	6000	6018	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	255506244
44	NC_013063	ATA	5	6321	6335	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506244
45	NC_013063	A	12	6332	6343	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	255506244
46	NC_013063	TTA	4	6744	6755	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	255506244
47	NC_013063	AAAAT	3	6891	6904	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	255506244
48	NC_013063	A	18	7046	7063	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	255506244
49	NC_013063	TAA	4	7065	7076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506244
50	NC_013063	TAA	4	7321	7331	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	255506244
51	NC_013063	AAAT	3	7405	7417	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	255506244
52	NC_013063	A	12	7439	7450	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	255506244
53	NC_013063	A	18	7514	7531	18	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	255506244
54	NC_013063	ATAA	8	7575	7605	31	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	255506244
55	NC_013063	AAT	7	7635	7656	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	255506245
56	NC_013063	TAA	4	7913	7925	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506245
57	NC_013063	ATAA	3	8094	8105	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	255506245
58	NC_013063	A	16	8244	8259	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	255506245
59	NC_013063	ATTAAA	3	8436	8453	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	255506245
60	NC_013063	AAAT	4	8526	8540	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	255506245
61	NC_013063	TTTA	3	8703	8713	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	255506245
62	NC_013063	AAT	4	8793	8803	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	255506245
63	NC_013063	ATA	4	8870	8880	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	255506245
64	NC_013063	A	29	8902	8930	29	100 %	0 %	0 %	0 %	3 %	255506245
65	NC_013063	TTAAA	3	8932	8947	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	255506245
66	NC_013063	TAT	4	8972	8982	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506246
67	NC_013063	ATA	5	9110	9124	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506246
68	NC_013063	AAATAT	3	9208	9226	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	255506246
69	NC_013063	ATTTTT	3	9512	9530	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	255506247
70	NC_013063	AATT	3	9543	9554	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	255506247
71	NC_013063	TAAAA	3	9712	9725	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	255506247
72	NC_013063	TAT	4	9726	9736	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506247
73	NC_013063	TTAA	3	9750	9760	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506247
74	NC_013063	ATT	4	9766	9777	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	255506247
75	NC_013063	TTAA	3	9799	9810	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	255506247
76	NC_013063	TTAAA	3	9831	9845	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	255506247
77	NC_013063	TA	6	9847	9857	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506247
78	NC_013063	AAATAT	3	9860	9877	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	255506247
79	NC_013063	ATTT	3	9888	9899	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	255506247
80	NC_013063	TAA	4	9901	9912	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	255506247
81	NC_013063	AATT	3	9923	9933	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255506247
82	NC_013063	TAATA	4	9960	9978	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	255506247
83	NC_013063	TAT	4	10296	10306	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	255506248
84	NC_013063	TAT	4	10665	10676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	255506248
85	NC_013063	TCTT	3	10848	10859	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	255506248
86	NC_013063	TTTA	3	10898	10909	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	255506248
87	NC_013063	TAA	5	10934	10948	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	255506248
88	NC_013063	AATATT	3	11144	11161	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	255506249
89	NC_013063	AAAT	6	11179	11202	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	255506249
90	NC_013063	TAA	4	11353	11363	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	255506249
91	NC_013063	TAAA	3	11524	11535	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	255506249
92	NC_013063	AAT	4	11835	11847	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	255506249
93	NC_013063	TA	7	12028	12040	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	255506249
94	NC_013063	TA	6	12139	12149	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_013063	TAAA	3	12205	12216	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_013063	TTA	4	12229	12240	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_013063	AAT	4	12311	12321	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_013063	TTTAAA	3	12443	12459	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_013063	ATA	4	12565	12575	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_013063	TTTA	3	12579	12591	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_013063	TAA	4	12666	12677	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_013063	AATT	3	12755	12765	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_013063	AAAATT	3	12798	12816	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_013063	TTTA	3	12826	12837	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_013063	ATTA	4	13256	13271	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013063	ATT	4	13571	13582	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_013063	TAA	4	13652	13664	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_013063	AATAA	4	13699	13719	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_013063	ATT	4	13732	13744	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_013063	ATA	4	13802	13813	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_013063	T	13	13964	13976	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_013063	T	18	14099	14116	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013063	AAAT	3	14118	14129	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_013063	TAT	4	14150	14162	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_013063	AAAT	3	14211	14222	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_013063	TAT	4	14246	14258	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_013063	AAAT	3	14307	14318	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_013063	TTA	4	14325	14335	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_013063	TAT	4	14342	14354	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_013063	TTTA	3	14390	14401	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_013063	AAAT	3	14402	14413	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_013063	TTA	4	14420	14430	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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