ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Parachlorella kessleri chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012978	TAA	4	1090	1102	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012978	ACC	4	5468	5479	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	254798641
3	NC_012978	ATG	4	6335	6345	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	254798641
4	NC_012978	ATT	5	8586	8600	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	254798640
5	NC_012978	ATG	4	8967	8977	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	254798640
6	NC_012978	ACC	4	9459	9470	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	254798640
7	NC_012978	AGT	4	9720	9731	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	254798640
8	NC_012978	TGA	4	12013	12024	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	254798625
9	NC_012978	TTA	4	13138	13149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254798655
10	NC_012978	TAA	4	17195	17206	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012978	AAT	4	18109	18120	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_012978	ATT	4	19222	19233	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_012978	TTA	4	20891	20901	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_012978	GAT	5	23832	23845	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	254798632
15	NC_012978	AAT	4	26425	26437	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	254798630
16	NC_012978	TTG	4	31523	31533	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	254798675
17	NC_012978	TGT	4	31602	31613	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	254798675
18	NC_012978	AAT	4	32423	32433	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	254798675
19	NC_012978	ATT	4	34328	34339	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254798675
20	NC_012978	TGT	4	35836	35847	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	254798674
21	NC_012978	GTT	4	36836	36848	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	254798674
22	NC_012978	CTT	4	38168	38178	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	254798673
23	NC_012978	GTT	4	38306	38316	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	254798673
24	NC_012978	ATA	4	39189	39201	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	254798673
25	NC_012978	ATT	5	41910	41924	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	254798673
26	NC_012978	TAT	4	41939	41949	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_012978	CAC	5	43805	43819	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	6 %	254798636
28	NC_012978	ATT	4	45302	45313	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_012978	TAT	4	59567	59578	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_012978	ATT	4	60631	60641	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254798624
31	NC_012978	TTA	7	61021	61040	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
32	NC_012978	TGG	4	62531	62541	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	254798666
33	NC_012978	CAA	4	70552	70563	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	254798662
34	NC_012978	TAT	4	71692	71703	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_012978	TGG	4	77403	77414	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	254798648
36	NC_012978	TGT	4	78535	78545	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	254798697
37	NC_012978	ATA	4	80424	80435	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	254798691
38	NC_012978	ATT	4	81290	81300	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_012978	TTA	4	82478	82489	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254798681
40	NC_012978	ATA	4	84152	84163	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_012978	ATT	4	84666	84676	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_012978	ATT	4	85704	85715	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012978	TGC	4	98011	98022	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	254798661
44	NC_012978	ATA	4	98544	98554	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_012978	TAT	4	98688	98698	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254798696
46	NC_012978	TAA	4	103137	103147	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	254798631
47	NC_012978	TAT	4	103929	103940	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_012978	AAT	4	104057	104068	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_012978	AAT	4	104436	104446	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	254798623
50	NC_012978	ATT	4	104842	104852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254798623
51	NC_012978	TAT	4	107454	107464	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254798628
52	NC_012978	TAA	4	108161	108171	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	254798628
53	NC_012978	TAA	4	108592	108604	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_012978	ACA	5	109030	109044	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	254798634
55	NC_012978	ATT	4	109715	109725	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254798634
56	NC_012978	ATA	4	111517	111528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_012978	ATT	4	111901	111911	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_012978	CTT	4	112760	112770	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	254798646
59	NC_012978	AAG	4	112823	112834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	254798646
60	NC_012978	ATA	4	113596	113606	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	254798695
61	NC_012978	ATT	4	113733	113744	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_012978	AGC	4	114269	114280	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	254798698
63	NC_012978	CTG	4	115348	115359	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	254798698

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Parachlorella kessleri chloroplast