ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Parachlorella kessleri chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012978	TAA	4	1090	1102	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012978	TTAG	3	1274	1284	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	254798683
3	NC_012978	TTCCTT	3	2648	2665	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
4	NC_012978	TTTA	3	4309	4320	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_012978	TTTA	3	4783	4795	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_012978	AATTTT	3	4796	4814	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
7	NC_012978	TTGA	3	5268	5279	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	254798641
8	NC_012978	ACC	4	5468	5479	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	254798641
9	NC_012978	ATG	4	6335	6345	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	254798641
10	NC_012978	TTTTAT	4	7261	7284	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
11	NC_012978	AAGA	3	7294	7304	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_012978	TTTTTA	3	7476	7494	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
13	NC_012978	A	14	7591	7604	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_012978	ATT	5	8586	8600	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	254798640
15	NC_012978	ATG	4	8967	8977	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	254798640
16	NC_012978	TAAT	3	9180	9191	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	254798640
17	NC_012978	ACC	4	9459	9470	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	254798640
18	NC_012978	AGT	4	9720	9731	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	254798640
19	NC_012978	TTTA	3	10737	10747	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_012978	TGA	4	12013	12024	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	254798625
21	NC_012978	A	13	12643	12655	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_012978	TTTTTC	3	12692	12710	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
23	NC_012978	ATTTT	3	13006	13020	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_012978	TTA	4	13138	13149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254798655
25	NC_012978	TAAC	3	13592	13602	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_012978	CTTT	5	14013	14031	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
27	NC_012978	AAAT	3	14153	14163	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_012978	ATTT	3	14360	14371	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_012978	AAAAT	3	16005	16019	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	254798694
30	NC_012978	AAAC	5	16232	16251	20	75 %	0 %	0 %	25 %	10 %	254798694
31	NC_012978	CAAAAG	3	16379	16396	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	254798694
32	NC_012978	TTTA	3	16486	16496	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	254798694
33	NC_012978	TAA	4	17195	17206	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_012978	AAAT	3	17747	17757	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_012978	TTCT	3	18000	18010	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_012978	AAT	4	18109	18120	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_012978	TTTA	3	18538	18548	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_012978	AAAAT	3	18626	18639	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_012978	TTTG	3	19068	19078	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_012978	TAAA	3	19108	19119	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012978	ATT	4	19222	19233	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_012978	TCTT	3	19234	19245	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012978	AAAG	3	19258	19268	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012978	TAAA	3	19949	19960	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_012978	TTA	4	20891	20901	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012978	ATTAT	3	20961	20975	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_012978	AAATAA	3	21278	21296	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_012978	AATT	3	22774	22784	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	254798632
49	NC_012978	GAT	5	23832	23845	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	254798632
50	NC_012978	ATATTT	3	23920	23938	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	254798632
51	NC_012978	AAAT	3	24085	24095	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	254798632
52	NC_012978	AATT	3	26039	26050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012978	TTTA	3	26077	26088	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_012978	TTAT	3	26089	26100	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_012978	TTTC	3	26251	26262	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_012978	AAT	4	26425	26437	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	254798630
57	NC_012978	ATTT	3	27014	27024	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	254798630
58	NC_012978	TTTG	3	27748	27758	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	254798616
59	NC_012978	CTAGAA	3	29044	29061	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
60	NC_012978	TTAA	3	29244	29254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_012978	TTTA	3	29331	29341	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_012978	CATT	3	29728	29740	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
63	NC_012978	ATTT	3	30052	30063	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_012978	AAAT	3	30097	30108	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_012978	CAAA	3	30175	30185	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_012978	TTAA	5	30201	30220	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	254798675
67	NC_012978	ATAA	3	31366	31376	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	254798675
68	NC_012978	TTAA	3	31411	31423	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	254798675
69	NC_012978	TTG	4	31523	31533	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	254798675
70	NC_012978	TGT	4	31602	31613	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	254798675
71	NC_012978	ATTC	3	31624	31635	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	254798675
72	NC_012978	ATTTT	3	31781	31794	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	254798675
73	NC_012978	ATTT	3	32065	32075	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	254798675
74	NC_012978	TTTCCT	4	32107	32130	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	254798675
75	NC_012978	TA	6	32251	32261	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	254798675
76	NC_012978	AAT	4	32423	32433	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	254798675
77	NC_012978	TTTA	3	34004	34014	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	254798675
78	NC_012978	ATT	4	34328	34339	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	254798675
79	NC_012978	GAAA	3	34450	34461	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	254798675
80	NC_012978	TGT	4	35836	35847	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	254798674
81	NC_012978	GTT	4	36836	36848	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	254798674
82	NC_012978	TCCATT	3	36946	36963	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	254798674
83	NC_012978	CTT	4	38168	38178	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	254798673
84	NC_012978	GTT	4	38306	38316	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	254798673
85	NC_012978	ATA	4	39189	39201	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	254798673
86	NC_012978	TTTG	4	39473	39488	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	254798673
87	NC_012978	AAAT	3	39778	39789	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	254798673
88	NC_012978	AT	6	40244	40254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	254798673
89	NC_012978	ATT	5	41910	41924	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	254798673
90	NC_012978	TAT	4	41939	41949	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_012978	TTAA	3	42103	42115	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_012978	TTTG	3	42225	42235	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_012978	A	12	42311	42322	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_012978	CTTT	3	42814	42824	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_012978	ATTT	3	43458	43468	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_012978	CAC	5	43805	43819	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	6 %	254798636
97	NC_012978	TTTA	3	44338	44348	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_012978	ATT	4	45302	45313	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_012978	ATTT	3	45323	45333	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_012978	TTTC	3	45615	45625	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_012978	TTTA	3	45833	45844	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_012978	AAAT	3	45870	45881	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_012978	TTTA	3	45981	45992	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_012978	AAAT	3	47910	47920	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	254798659
105	NC_012978	AAAG	3	48268	48278	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	254798658
106	NC_012978	TTTA	3	48316	48326	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_012978	AATA	3	48375	48387	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_012978	TTCT	3	48469	48480	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
109	NC_012978	ATTT	3	49578	49589	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_012978	GTTT	3	49787	49797	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_012978	ATTT	3	50279	50289	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_012978	GTTA	3	51332	51342	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_012978	CTTTTG	3	51394	51417	24	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
114	NC_012978	GGAAAA	3	51431	51448	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_012978	CTTTTC	4	51764	51786	23	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	Non-Coding
116	NC_012978	T	12	52295	52306	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_012978	ATAA	3	52323	52334	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_012978	AATTA	3	52500	52514	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_012978	GAAAAA	4	52634	52657	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_012978	A	12	53300	53311	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012978	GAACTT	3	53461	53478	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
122	NC_012978	ATTT	3	53630	53640	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_012978	TTTTTA	3	54061	54079	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
124	NC_012978	AATA	3	54154	54164	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_012978	ATTT	3	54808	54819	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_012978	TTTA	3	54831	54841	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_012978	TTTA	3	56436	56447	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	254798684
128	NC_012978	ATTT	3	56456	56467	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_012978	AAAT	4	58720	58734	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	254798665
130	NC_012978	A	14	59540	59553	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_012978	TAT	4	59567	59578	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_012978	T	12	59672	59683	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_012978	AAAC	3	59684	59694	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_012978	GAAAAC	3	60208	60225	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	254798624
135	NC_012978	ATT	4	60631	60641	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	254798624
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143	NC_012978	AAAT	4	64810	64825	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
144	NC_012978	CAAA	3	64827	64837	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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257	NC_012978	TTCCT	3	116008	116022	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
258	NC_012978	TACC	3	118685	118696	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
259	NC_012978	TTCCTT	3	119161	119178	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
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261	NC_012978	TTTG	3	122133	122143	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
262	NC_012978	CAAA	3	122152	122162	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
263	NC_012978	A	16	123411	123426	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
264	NC_012978	T	12	123581	123592	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Parachlorella kessleri chloroplast