ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Dunaliella salina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012930	TA	6	48	58	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_012930	AAT	4	62	74	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_012930	TAT	4	1138	1149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_012930	TGGAT	4	2787	2806	20	20 %	40 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_012930	TAT	4	3315	3325	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25403362
6	NC_012930	TAT	4	3341	3352	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25403362
7	NC_012930	TAT	4	3413	3424	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25403362
8	NC_012930	TAT	4	4280	4290	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25403362
9	NC_012930	ATA	4	4354	4365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25403362
10	NC_012930	ATAAAT	3	4465	4482	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	25403362
11	NC_012930	ATT	4	5474	5485	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	25403362
12	NC_012930	TAT	4	6185	6196	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_012930	ACTTTT	3	6527	6545	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
14	NC_012930	TAT	4	6962	6974	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_012930	TA	6	7071	7081	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_012930	AT	6	7532	7542	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_012930	ATA	4	8137	8147	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_012930	TAT	4	9785	9796	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25403362
19	NC_012930	ATT	5	10055	10069	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	25403362
20	NC_012930	GTAT	3	10305	10316	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	25403362
21	NC_012930	TA	6	10377	10388	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25403362
22	NC_012930	TTTGG	3	10560	10574	15	0 %	60 %	40 %	0 %	6 %	25403362
23	NC_012930	CTTTG	3	10785	10799	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	25403362
24	NC_012930	CTT	4	11738	11749	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	25403362
25	NC_012930	ATT	4	11784	11795	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25403362
26	NC_012930	TA	6	14087	14097	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25403362
27	NC_012930	TTAG	3	14517	14528	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	25403362
28	NC_012930	TATTTA	4	14691	14713	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25403362
29	NC_012930	ATAAAT	3	14946	14962	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	25403362
30	NC_012930	TTTATG	3	15919	15936	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	25403362
31	NC_012930	TAT	4	16351	16362	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25403362
32	NC_012930	TAT	6	16819	16836	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	25403362
33	NC_012930	TGTT	3	16914	16925	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	25403362
34	NC_012930	TTTA	3	17135	17145	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	25403362
35	NC_012930	TAT	4	17209	17221	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	25403362
36	NC_012930	ATA	4	19341	19353	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_012930	GTACAG	3	19486	19503	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012930	AGTACG	3	19564	19582	19	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
39	NC_012930	CTAA	3	20256	20266	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_012930	TAAA	7	20984	21011	28	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_012930	TAA	4	21492	21503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_012930	AAAG	3	21634	21645	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012930	ATAAAT	3	21649	21666	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_012930	TG	6	21818	21828	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_012930	AT	6	22363	22373	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012930	TTAA	3	22503	22513	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_012930	ATA	4	23694	23705	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_012930	TATT	3	23909	23920	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_012930	TAAATA	5	25068	25097	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	3 %	25403362
50	NC_012930	TTA	4	25116	25126	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25403362
51	NC_012930	TA	7	27876	27888	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25403362
52	NC_012930	TAAA	3	28294	28306	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	25403362

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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