ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bambusa oldhamii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012927	CAG	5	684	698	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	253729538
2	NC_012927	TTC	4	1797	1808	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_012927	CTT	4	4513	4524	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	253729539
4	NC_012927	TAA	4	6386	6396	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_012927	TTG	4	10851	10861	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	253729543
6	NC_012927	TAC	4	15522	15532	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_012927	TAT	4	15568	15578	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_012927	TAA	4	17577	17587	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_012927	TAT	4	18336	18346	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_012927	ATA	4	20387	20397	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_012927	CTA	4	20728	20739	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_012927	ATT	4	20830	20840	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_012927	AGA	4	21823	21834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	253729547
14	NC_012927	AAC	4	24476	24487	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	253729548
15	NC_012927	AAT	5	26164	26178	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	253729548
16	NC_012927	GAA	4	29657	29668	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	253729549
17	NC_012927	ATT	4	31443	31455	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_012927	AGA	4	31927	31937	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	253729550
19	NC_012927	GTT	5	33120	33134	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	253729551
20	NC_012927	TGC	4	34094	34105	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	253729552
21	NC_012927	TAG	5	37811	37825	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_012927	AAG	4	44235	44246	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	253729558
23	NC_012927	AGT	4	44637	44647	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	253729558
24	NC_012927	GAA	4	46268	46279	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_012927	CTT	4	49831	49842	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_012927	TTC	4	62573	62584	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	253729569
27	NC_012927	TCT	4	63005	63015	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_012927	TTA	4	65411	65422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_012927	TTC	5	67318	67332	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
30	NC_012927	CAT	4	74116	74127	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	253729537
31	NC_012927	TAT	4	77623	77633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	253729537
32	NC_012927	ATT	4	78202	78212	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	253729537
33	NC_012927	TCT	4	81548	81559	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	253729537
34	NC_012927	TTC	4	82809	82823	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	253729537
35	NC_012927	TTC	4	83918	83928	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	253729537
36	NC_012927	ATA	4	90569	90579	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	253729537
37	NC_012927	TAC	4	92385	92396	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	253729537
38	NC_012927	AAG	4	106159	106170	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	253729601
39	NC_012927	ATA	4	108313	108323	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_012927	CAA	4	111630	111640	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	253729604
41	NC_012927	TTA	4	114447	114458	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_012927	TAA	4	117862	117872	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_012927	GTA	4	129844	129855	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bambusa oldhamii chloroplast