ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aureoumbra lagunensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012903	ATA	4	5091	5102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_012903	TTC	4	5695	5706	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242624261
3	NC_012903	TAA	4	8988	8999	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624262
4	NC_012903	CAC	4	12370	12381	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	242624265
5	NC_012903	CAA	4	12610	12621	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	242624265
6	NC_012903	ATA	4	13673	13683	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	242624266
7	NC_012903	TTA	4	14284	14295	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012903	CAA	4	16005	16016	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	242624270
9	NC_012903	TGG	4	16974	16985	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	242624271
10	NC_012903	ATA	4	17103	17114	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624271
11	NC_012903	TTA	4	19383	19394	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624277
12	NC_012903	ACA	4	19640	19650	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	242624278
13	NC_012903	AAG	4	26564	26574	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	242624292
14	NC_012903	TGA	4	27524	27535	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	242624293
15	NC_012903	TAT	4	29228	29238	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242624295
16	NC_012903	TAA	5	31528	31541	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	242624300
17	NC_012903	AAT	4	33858	33869	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	242624303
18	NC_012903	ATT	4	35713	35723	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242624308
19	NC_012903	CAT	4	37612	37622	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	242624309
20	NC_012903	CAG	4	38203	38214	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	242624309
21	NC_012903	GGT	4	38463	38474	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	242624309
22	NC_012903	GGT	4	40710	40721	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	242624310
23	NC_012903	ATA	4	47732	47743	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624318
24	NC_012903	ATA	4	52594	52605	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_012903	ATT	4	52600	52611	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624324
26	NC_012903	CTA	4	53175	53186	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	242624325
27	NC_012903	CAA	4	56069	56080	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	242624328
28	NC_012903	TAT	4	57206	57217	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624329
29	NC_012903	ATA	4	60771	60781	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_012903	CTT	4	62381	62392	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242624336
31	NC_012903	TGT	4	62806	62817	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	242624338
32	NC_012903	AGA	5	64505	64519	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	242624339
33	NC_012903	CAA	4	68961	68972	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	242624341
34	NC_012903	AAT	4	70010	70021	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624341
35	NC_012903	ATT	4	72856	72867	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624343
36	NC_012903	TTG	4	81261	81272	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	242624355
37	NC_012903	ATA	4	85379	85390	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_012903	TAA	4	87600	87611	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624362
39	NC_012903	CTT	4	91962	91973	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242624367
40	NC_012903	AAT	4	92988	92998	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_012903	GCT	4	93471	93482	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	242624368
42	NC_012903	AAG	4	93739	93749	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	242624368

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aureoumbra lagunensis chloroplast