Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Aureoumbra lagunensis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_012903ATA4509151021266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_012903CTAA3543554451150 %25 %0 %25 %9 %242624261
3NC_012903TTC456955706120 %66.67 %0 %33.33 %8 %242624261
4NC_012903TTCC357785788110 %50 %0 %50 %9 %242624261
5NC_012903TAA4898889991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %242624262
6NC_012903AG6915191611150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
7NC_012903TAGT310691107031325 %50 %25 %0 %7 %242624264
8NC_012903CAC412370123811233.33 %0 %0 %66.67 %8 %242624265
9NC_012903CAA412610126211266.67 %0 %0 %33.33 %8 %242624265
10NC_012903ATA413673136831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %242624266
11NC_012903AT614272142831250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_012903TTA414284142951233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
13NC_012903TAAAA314907149211580 %20 %0 %0 %6 %242624267
14NC_012903AATT415227152431750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
15NC_012903CAA416005160161266.67 %0 %0 %33.33 %8 %242624270
16NC_012903AATA316037160471175 %25 %0 %0 %9 %242624270
17NC_012903TGG41697416985120 %33.33 %66.67 %0 %8 %242624271
18NC_012903ATA417103171141266.67 %33.33 %0 %0 %8 %242624271
19NC_012903AATT318431184431350 %50 %0 %0 %7 %242624274
20NC_012903AT619123191341250 %50 %0 %0 %8 %242624277
21NC_012903TTA419383193941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %242624277
22NC_012903ACA419640196501166.67 %0 %0 %33.33 %9 %242624278
23NC_012903TGGT32105821068110 %50 %50 %0 %9 %242624281
24NC_012903AT623710237201150 %50 %0 %0 %9 %242624286
25NC_012903AAG426564265741166.67 %0 %33.33 %0 %9 %242624292
26NC_012903TAAT326921269321250 %50 %0 %0 %8 %242624292
27NC_012903GTTA327022270321125 %50 %25 %0 %9 %242624292
28NC_012903TGA427524275351233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %242624293
29NC_012903AATA328451284611175 %25 %0 %0 %9 %242624294
30NC_012903AAAT328773287831175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_012903TAT429228292381133.33 %66.67 %0 %0 %9 %242624295
32NC_012903TTTAC331287313001420 %60 %0 %20 %7 %242624299
33NC_012903CGATT331462314761520 %40 %20 %20 %6 %242624299
34NC_012903TAA531528315411466.67 %33.33 %0 %0 %7 %242624300
35NC_012903TGAT332463324731125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
36NC_012903AAAT332868328791275 %25 %0 %0 %8 %242624303
37NC_012903AAT433858338691266.67 %33.33 %0 %0 %0 %242624303
38NC_012903ATT435713357231133.33 %66.67 %0 %0 %9 %242624308
39NC_012903CAT437612376221133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %242624309
40NC_012903CAG438203382141233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %242624309
41NC_012903GGT43846338474120 %33.33 %66.67 %0 %8 %242624309
42NC_012903ATTC340540405501125 %50 %0 %25 %9 %242624310
43NC_012903GGT44071040721120 %33.33 %66.67 %0 %8 %242624310
44NC_012903GTTA345113451231125 %50 %25 %0 %9 %242624316
45NC_012903TTTAGT346069460871916.67 %66.67 %16.67 %0 %10 %242624316
46NC_012903AAAT446443464571575 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
47NC_012903TTTA346942469521125 %75 %0 %0 %9 %242624318
48NC_012903TGCT34711047120110 %50 %25 %25 %9 %242624318
49NC_012903ATA447732477431266.67 %33.33 %0 %0 %8 %242624318
50NC_012903TA648537485471150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
51NC_012903ATGT349061490711125 %50 %25 %0 %9 %242624321
52NC_012903GCAC349183491941225 %0 %25 %50 %8 %242624321
53NC_012903ATAA349250492611275 %25 %0 %0 %8 %242624321
54NC_012903ATTT351149511601225 %75 %0 %0 %8 %242624323
55NC_012903ATA452594526051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_012903ATT452600526111233.33 %66.67 %0 %0 %8 %242624324
57NC_012903TTGA352646526571225 %50 %25 %0 %8 %242624324
58NC_012903CTA453175531861233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %242624325
59NC_012903TA653302533131250 %50 %0 %0 %8 %242624326
60NC_012903TGTT35480154812120 %75 %25 %0 %8 %242624327
61NC_012903ATTT355916559271225 %75 %0 %0 %0 %242624328
62NC_012903CAA456069560801266.67 %0 %0 %33.33 %8 %242624328
63NC_012903AATT356649566611350 %50 %0 %0 %7 %242624328
64NC_012903TAT457206572171233.33 %66.67 %0 %0 %8 %242624329
65NC_012903ATAA357516575271275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
66NC_012903TAAA357601576111175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_012903TAAA359374593841175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_012903ACTA360608606191250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
69NC_012903ATA460771607811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
70NC_012903AAAT360851608621275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
71NC_012903CTT46238162392120 %66.67 %0 %33.33 %8 %242624336
72NC_012903AATTT362715627291540 %60 %0 %0 %6 %242624338
73NC_012903TGT46280662817120 %66.67 %33.33 %0 %8 %242624338
74NC_012903AATTG363347633601440 %40 %20 %0 %7 %242624339
75NC_012903AGA564505645191566.67 %0 %33.33 %0 %6 %242624339
76NC_012903TAAA368947689581275 %25 %0 %0 %8 %242624341
77NC_012903CAA468961689721266.67 %0 %0 %33.33 %8 %242624341
78NC_012903AAAT369501695111175 %25 %0 %0 %9 %242624341
79NC_012903AAT470010700211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %242624341
80NC_012903TTATA372432724451440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
81NC_012903ATT472856728671233.33 %66.67 %0 %0 %8 %242624343
82NC_012903TTTATT373663736811916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
83NC_012903CTATA376883768971540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
84NC_012903TTTATT379243792611916.67 %83.33 %0 %0 %10 %242624352
85NC_012903ATAA379590796011275 %25 %0 %0 %0 %242624352
86NC_012903GAAA380277802871175 %0 %25 %0 %9 %242624353
87NC_012903TTG48126181272120 %66.67 %33.33 %0 %8 %242624355
88NC_012903TTGAA481406814241940 %40 %20 %0 %10 %242624355
89NC_012903ATTA382346823561150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_012903AATCCT383252832691833.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %242624356
91NC_012903ATA485379853901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_012903TAA487600876111266.67 %33.33 %0 %0 %8 %242624362
93NC_012903AATT388307883181250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
94NC_012903CTT49196291973120 %66.67 %0 %33.33 %8 %242624367
95NC_012903AAT492988929981166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
96NC_012903TCGGT39310693119140 %40 %40 %20 %7 %242624368
97NC_012903GCT49347193482120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %242624368
98NC_012903AAG493739937491166.67 %0 %33.33 %0 %9 %242624368
99NC_012903TA694222942331250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding