ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aureococcus anophagefferens chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012898	ACC	4	5256	5267	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	242620016
2	NC_012898	ATT	4	5278	5289	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242620016
3	NC_012898	TAT	4	8687	8698	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242620023
4	NC_012898	ATT	4	18348	18358	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242620027
5	NC_012898	TCG	4	22149	22161	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	242620033
6	NC_012898	TTC	4	24816	24827	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242620036
7	NC_012898	TGC	4	25797	25808	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	242620036
8	NC_012898	ATA	4	32907	32917	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	242620041
9	NC_012898	TGG	4	35875	35886	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	242620045
10	NC_012898	GTT	4	40018	40029	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	242620055
11	NC_012898	TAA	4	44115	44126	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242620062
12	NC_012898	TGA	4	46567	46578	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	242620067
13	NC_012898	TAG	4	46699	46709	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	242620067
14	NC_012898	TAT	4	47732	47743	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012898	TAC	4	49578	49588	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_012898	TAG	4	49595	49606	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_012898	TGG	4	51256	51266	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	242620075
18	NC_012898	ATT	4	53050	53060	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242620077
19	NC_012898	ACA	4	58531	58543	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	242620083
20	NC_012898	GCT	5	60271	60285	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	242620086
21	NC_012898	TGC	4	60792	60803	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	242620086
22	NC_012898	AAT	4	62214	62224	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	242620088
23	NC_012898	CAA	4	65170	65181	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	242620091
24	NC_012898	TAA	4	68197	68207	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_012898	ACA	4	69320	69331	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	242620097
26	NC_012898	ATT	4	72575	72586	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242620102
27	NC_012898	AAT	4	74621	74632	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242620103
28	NC_012898	ATT	4	74839	74850	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242620103
29	NC_012898	GGT	4	80199	80210	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	242620112
30	NC_012898	TAT	4	80488	80500	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	242620112
31	NC_012898	ATA	4	84422	84434	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_012898	TGC	4	86337	86348	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	242620119
33	NC_012898	CTT	4	87119	87130	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242620119
34	NC_012898	AGC	4	88707	88718	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	242620120
35	NC_012898	AAG	4	88976	88987	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	242620120

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aureococcus anophagefferens chloroplast