ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Clavelina lepadiformis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012887	T	14	197	210	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242543523
2	NC_012887	TAGTT	3	1083	1098	16	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	242543523
3	NC_012887	T	26	1627	1652	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242543524
4	NC_012887	TTTAT	3	1656	1669	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	242543524
5	NC_012887	TTA	4	1842	1852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242543524
6	NC_012887	TA	7	1851	1863	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242543524
7	NC_012887	ATA	4	1879	1890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242543524
8	NC_012887	TAG	4	2244	2254	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	242543524
9	NC_012887	TTC	4	2264	2275	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242543524
10	NC_012887	T	13	3200	3212	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242543524
11	NC_012887	ATT	4	3213	3225	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	242543524
12	NC_012887	AT	7	3524	3537	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_012887	ATTTT	3	3598	3611	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_012887	ATT	4	3715	3726	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_012887	TGTT	3	3752	3763	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_012887	T	26	3833	3858	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_012887	ATTT	3	3909	3920	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_012887	TAT	4	3984	3994	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_012887	TAA	4	4003	4014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_012887	T	15	4602	4616	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	242543525
21	NC_012887	AGTT	3	4681	4692	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	242543525
22	NC_012887	TATT	4	4699	4714	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	242543525
23	NC_012887	AT	6	4819	4829	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242543525
24	NC_012887	T	14	5008	5021	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242543525
25	NC_012887	TTA	4	5151	5162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242543525
26	NC_012887	T	14	5190	5203	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242543525
27	NC_012887	ATA	4	5206	5217	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242543525
28	NC_012887	T	14	5306	5319	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242543525
29	NC_012887	TTTGTT	3	5501	5519	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	242543525
30	NC_012887	T	15	5539	5553	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242543525
31	NC_012887	TA	6	5871	5882	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242543526
32	NC_012887	TTATTT	3	6351	6369	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	242543526
33	NC_012887	TATT	3	6450	6460	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242543526
34	NC_012887	T	18	6704	6721	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	242543526
35	NC_012887	T	13	7312	7324	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_012887	T	14	7366	7379	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_012887	TA	6	7521	7532	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_012887	TTTA	3	7659	7669	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_012887	ATTT	3	7921	7932	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_012887	TTAA	3	7950	7962	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_012887	T	12	7975	7986	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012887	TTTA	3	8097	8108	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012887	T	12	8134	8145	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012887	TTGTT	3	8368	8382	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	242543527
45	NC_012887	TTTTA	3	8449	8462	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	242543527
46	NC_012887	TAT	6	8548	8565	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	242543527
47	NC_012887	T	15	9233	9247	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	242543527
48	NC_012887	ATT	4	9634	9644	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242543528
49	NC_012887	TAT	4	9654	9664	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242543528
50	NC_012887	T	16	9726	9741	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	242543528
51	NC_012887	TTTA	3	9834	9844	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242543528
52	NC_012887	T	13	10224	10236	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242543529
53	NC_012887	TA	8	10300	10315	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	242543529
54	NC_012887	TTTA	3	10556	10566	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242543530
55	NC_012887	GTAT	3	10654	10664	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	242543530
56	NC_012887	TTATT	3	10752	10767	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	242543530
57	NC_012887	T	13	10787	10799	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242543530
58	NC_012887	T	18	11004	11021	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	242543531
59	NC_012887	T	17	11199	11215	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	242543531
60	NC_012887	T	23	11439	11461	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	242543531
61	NC_012887	T	12	11536	11547	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	242543531
62	NC_012887	ATT	4	11709	11720	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242543531
63	NC_012887	TTTA	3	12676	12687	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_012887	T	24	12728	12751	24	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
65	NC_012887	T	17	12754	12770	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_012887	ATTTT	4	12811	12829	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	242543533
67	NC_012887	TATTAA	3	13070	13087	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	242543533
68	NC_012887	T	12	13338	13349	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012887	CTTT	3	13422	13432	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242543534
70	NC_012887	TAAT	3	13585	13596	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242543534
71	NC_012887	TTAT	3	14102	14113	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	242543534
72	NC_012887	ATT	4	14201	14211	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Clavelina lepadiformis mitochondrion