ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nerthra sp. NKMT022 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012838	TCT	4	185	196	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_012838	TAT	4	1051	1061	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266731
3	NC_012838	TTA	4	1084	1094	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266731
4	NC_012838	ATA	4	1153	1164	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266731
5	NC_012838	ATA	4	3055	3065	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266733
6	NC_012838	ATT	4	3087	3098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266733
7	NC_012838	AATT	3	3209	3221	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	240266733
8	NC_012838	TA	6	3250	3260	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266733
9	NC_012838	AATC	3	3273	3284	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	240266733
10	NC_012838	TTA	4	3802	3813	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012838	AT	6	3889	3899	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266734
12	NC_012838	ATAAA	3	3923	3938	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	240266734
13	NC_012838	TTTA	3	4184	4194	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	240266735
14	NC_012838	ATA	4	4222	4232	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266735
15	NC_012838	AAAT	3	4652	4662	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266736
16	NC_012838	TCT	4	4922	4932	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	240266736
17	NC_012838	TAA	5	5502	5516	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266737
18	NC_012838	TTA	4	5712	5722	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266737
19	NC_012838	TAT	4	5781	5793	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	240266737
20	NC_012838	AATGA	3	6041	6054	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_012838	ATAA	3	6634	6645	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	240266738
22	NC_012838	AAT	4	6787	6797	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266738
23	NC_012838	ATAA	4	6848	6863	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	240266738
24	NC_012838	TAA	4	7424	7435	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266738
25	NC_012838	TAAAAA	3	7697	7714	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	240266738
26	NC_012838	AAAAT	3	9037	9050	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	240266739
27	NC_012838	TAA	4	9092	9103	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	240266739
28	NC_012838	ATA	4	9297	9308	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266739
29	NC_012838	AT	6	9975	9985	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266741
30	NC_012838	TTA	5	9986	9999	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	240266741
31	NC_012838	AACT	3	10184	10194	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	240266741
32	NC_012838	AAT	5	10230	10244	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266741
33	NC_012838	AATTAT	3	11216	11233	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	240266743
34	NC_012838	TCAAA	3	11244	11257	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	240266743
35	NC_012838	AT	6	11776	11787	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	240266742
36	NC_012838	AAAT	3	12149	12159	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266742
37	NC_012838	TAA	4	13315	13326	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_012838	TAAA	3	13426	13436	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_012838	TTAA	3	13472	13482	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_012838	TAAA	3	13596	13607	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012838	AAAT	3	13750	13760	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_012838	AAT	4	14025	14035	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_012838	TAA	4	14251	14262	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_012838	AAAATT	3	14347	14364	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_012838	CT	6	14890	14900	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012838	ATAC	3	14987	14998	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_012838	CTA	4	15370	15380	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nerthra sp. NKMT022 mitochondrion