ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Arthroderma uncinatum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012828	ATCACC	3	51	68	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	5 %	24026648
2	NC_012828	TTTA	3	163	174	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026648
3	NC_012828	TAT	4	431	442	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026648
4	NC_012828	ATC	4	710	721	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	24026648
5	NC_012828	TTG	4	755	766	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	24026648
6	NC_012828	TAA	4	808	819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026648
7	NC_012828	A	14	815	828	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_012828	AAAAT	3	866	880	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_012828	AAAT	3	1013	1024	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	24026649
10	NC_012828	TA	7	1701	1713	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_012828	GAAGT	3	1817	1831	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_012828	AAT	4	2720	2732	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_012828	ATTT	3	2857	2867	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_012828	GCAA	3	2951	2962	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_012828	TTAT	3	3610	3621	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_012828	ATT	4	3647	3659	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_012828	AT	7	4168	4181	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_012828	TTA	4	4184	4195	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_012828	AATTA	3	4248	4262	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012828	AATT	5	4453	4472	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	24026649
21	NC_012828	A	12	4538	4549	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	24026649
22	NC_012828	A	12	4667	4678	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	24026649
23	NC_012828	ATTT	3	4894	4905	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026649
24	NC_012828	ATT	4	4927	4938	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026649
25	NC_012828	TAT	4	5044	5055	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026649
26	NC_012828	TTA	4	5951	5961	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_012828	TAT	4	6045	6055	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_012828	ATT	4	7053	7064	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_012828	T	13	7060	7072	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_012828	AAAATT	3	7089	7107	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_012828	T	13	7374	7386	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_012828	ATT	4	7422	7432	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_012828	TAT	4	7868	7880	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	24026648
34	NC_012828	TAT	5	8120	8134	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026648
35	NC_012828	TGG	4	8211	8222	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	24026648
36	NC_012828	GTT	4	8567	8577	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	24026648
37	NC_012828	TTTA	4	9244	9259	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_012828	TATT	5	9273	9291	19	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_012828	ATT	7	9304	9325	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_012828	GAA	5	9467	9481	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_012828	ATA	4	9633	9643	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_012828	AAT	4	9944	9954	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_012828	ATA	4	9964	9975	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_012828	TTTTA	3	10290	10304	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012828	ATA	4	10711	10722	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_012828	TTA	4	10891	10901	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_012828	T	14	10986	10999	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_012828	A	14	11030	11043	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_012828	ATTT	3	11133	11144	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	24026649
50	NC_012828	ATA	4	11268	11279	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026649
51	NC_012828	ATT	4	11461	11471	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026649
52	NC_012828	AT	6	11952	11963	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012828	TA	7	12153	12165	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	24026648
54	NC_012828	ATA	4	12409	12419	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026649
55	NC_012828	TTTA	3	12594	12605	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026649
56	NC_012828	ATTA	3	13574	13585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	24026649
57	NC_012828	TTTA	3	13611	13622	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026649
58	NC_012828	ACTTTA	3	13803	13820	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	0 %	24026649
59	NC_012828	AATT	4	13852	13866	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	24026649
60	NC_012828	TTTA	3	13896	13908	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026649
61	NC_012828	AAT	4	14061	14072	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026649
62	NC_012828	ATA	4	14157	14169	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	24026649
63	NC_012828	TAT	6	14173	14189	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	24026649
64	NC_012828	T	13	14245	14257	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	24026648
65	NC_012828	TAT	4	14638	14649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026648
66	NC_012828	TA	6	14704	14714	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	24026648
67	NC_012828	TTAT	3	14762	14772	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	24026648
68	NC_012828	TTA	5	14939	14954	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026648
69	NC_012828	TTA	4	15355	15365	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026648
70	NC_012828	TAA	4	15395	15406	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026648
71	NC_012828	TTTA	3	15597	15608	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026648
72	NC_012828	ATT	4	16263	16273	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_012828	AGG	4	16501	16512	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_012828	ATAA	3	16731	16743	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_012828	TAAT	3	18234	18245	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_012828	TTAAA	4	18292	18312	21	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
77	NC_012828	T	12	18603	18614	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	24026648
78	NC_012828	ATT	4	19728	19739	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_012828	TA	6	20400	20412	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_012828	T	16	20441	20456	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	24026649
81	NC_012828	TAT	4	20944	20955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_012828	TAGT	3	21817	21827	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	24026648
83	NC_012828	TAA	4	21962	21973	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026648
84	NC_012828	TAAA	3	22054	22064	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	24026648
85	NC_012828	TAT	7	22076	22096	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026648
86	NC_012828	TAA	4	22091	22102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026648
87	NC_012828	TAAATC	4	22337	22360	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	24026648
88	NC_012828	TTTA	3	22699	22710	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026648
89	NC_012828	TAT	5	23033	23046	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_012828	TTAA	4	23279	23295	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_012828	TAA	4	23324	23334	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_012828	TTTA	3	23417	23427	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_012828	TAA	5	23729	23742	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	24026649
94	NC_012828	TAATT	3	23767	23780	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	24026649
95	NC_012828	TATTT	3	23794	23807	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	24026649
96	NC_012828	ATT	4	24050	24060	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026649
97	NC_012828	TATAT	3	24767	24781	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	24026649
98	NC_012828	TAT	4	25009	25020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026649
99	NC_012828	ATA	4	25395	25405	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026648
100	NC_012828	GTATT	3	25946	25959	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	24026648
101	NC_012828	AACA	3	26099	26109	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_012828	TAAATT	3	26150	26167	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_012828	A	25	26218	26242	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_012828	GTTT	3	27761	27772	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_012828	TTCC	3	27820	27832	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
106	NC_012828	ATTTT	4	28132	28151	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	24026649
107	NC_012828	AAAT	3	28331	28341	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	24026649
108	NC_012828	AAATAA	3	28512	28529	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

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