ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Trichophyton mentagrophytes mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012826	ATTT	3	162	173	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026645
2	NC_012826	TTCA	3	471	482	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	24026645
3	NC_012826	ATC	4	710	720	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	24026645
4	NC_012826	TTG	4	755	766	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	24026645
5	NC_012826	TAAA	3	1008	1019	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	24026645
6	NC_012826	AAT	4	2697	2709	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_012826	ATA	4	2830	2841	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_012826	GCAA	3	2939	2950	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_012826	TTAA	3	3183	3194	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_012826	ATT	4	3640	3652	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_012826	TTA	4	3676	3688	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_012826	T	17	4146	4162	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_012826	TTA	4	4195	4207	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_012826	TAAA	3	4254	4266	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	24026646
15	NC_012826	AAAT	5	4414	4433	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	24026646
16	NC_012826	A	14	5397	5410	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_012826	TTA	4	5902	5912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_012826	TAT	4	5996	6006	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_012826	TA	6	6061	6074	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_012826	TA	6	6076	6087	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_012826	AATT	3	6823	6834	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_012826	ATTAA	3	6849	6863	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_012826	ATT	4	6972	6984	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_012826	TAT	5	7855	7869	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026646
25	NC_012826	TGG	4	7943	7954	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	24026646
26	NC_012826	GTT	4	8299	8309	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	24026646
27	NC_012826	ATA	4	9225	9235	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_012826	TA	6	9489	9501	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_012826	T	14	9756	9769	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_012826	T	14	9784	9797	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_012826	ATT	4	9795	9806	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_012826	AT	11	9813	9836	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	24026645
33	NC_012826	ATTT	3	9845	9856	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	24026645
34	NC_012826	ATA	4	9977	9988	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026645
35	NC_012826	ATT	4	10170	10180	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026645
36	NC_012826	ATTA	4	10625	10640	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	24026645
37	NC_012826	TAA	5	10635	10650	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_012826	TA	6	10652	10662	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_012826	TA	7	10849	10861	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	24026646
40	NC_012826	TAT	4	11052	11063	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026645
41	NC_012826	ATA	4	11105	11115	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026645
42	NC_012826	TTTA	3	11290	11301	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026645
43	NC_012826	ATT	4	11961	11972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026645
44	NC_012826	TTTA	3	12307	12318	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026645
45	NC_012826	TTTA	3	12489	12499	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	24026645
46	NC_012826	TAAT	3	12546	12557	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	24026645
47	NC_012826	TTTA	3	12592	12604	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026645
48	NC_012826	TAT	6	12866	12882	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	24026645
49	NC_012826	TAT	4	12931	12945	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026645
50	NC_012826	TA	6	13393	13403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	24026645
51	NC_012826	TTAT	3	13451	13461	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	24026645
52	NC_012826	TTA	4	13941	13952	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026645
53	NC_012826	TTTA	3	14280	14291	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026645
54	NC_012826	ATTT	3	14576	14588	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026645
55	NC_012826	ATATA	3	14594	14608	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	24026645
56	NC_012826	A	13	14635	14647	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_012826	AATT	3	14708	14719	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	24026646
58	NC_012826	TATT	3	15375	15386	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026646
59	NC_012826	TAT	4	15768	15779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026646
60	NC_012826	ATA	4	15854	15864	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026646
61	NC_012826	ATATG	3	16487	16501	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_012826	T	13	17307	17319	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_012826	T	16	17387	17402	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	24026645
64	NC_012826	TAT	4	17438	17448	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026645
65	NC_012826	TTTA	3	17567	17579	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026645
66	NC_012826	TAA	4	17974	17985	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_012826	TTATAT	3	18942	18959	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	24026646
68	NC_012826	TAT	4	19190	19201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_012826	TTA	4	19232	19243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026646
70	NC_012826	TATT	4	19465	19479	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	24026646
71	NC_012826	TAA	4	19557	19568	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026646
72	NC_012826	TAT	4	19566	19577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026646
73	NC_012826	ATT	4	19615	19625	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026646
74	NC_012826	TTA	4	19655	19666	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026646
75	NC_012826	ATT	4	19834	19845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026646
76	NC_012826	TATAT	3	20332	20346	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	24026646
77	NC_012826	AT	6	20677	20690	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	24026646
78	NC_012826	TTAA	3	20807	20818	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_012826	TTAA	3	20860	20870	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_012826	TTAG	3	20917	20927	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_012826	ATA	4	21128	21138	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026646
82	NC_012826	TAAT	3	21741	21753	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_012826	TAATA	3	21897	21910	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_012826	TAA	7	21987	22006	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
85	NC_012826	TAAA	3	22261	22271	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_012826	GAAA	3	23324	23334	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_012826	GTTT	3	23522	23533	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_012826	TTCC	3	23581	23593	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
89	NC_012826	TA	6	23753	23765	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	24026646
90	NC_012826	TTTTA	3	23905	23918	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	24026646
91	NC_012826	TA	6	24004	24014	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	24026646
92	NC_012826	AAT	4	24023	24035	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	24026646
93	NC_012826	AAATA	3	24278	24292	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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