ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Trichophyton rubrum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012824	ATC	4	710	721	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	24026669
2	NC_012824	TTG	4	755	766	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	24026669
3	NC_012824	AAT	4	2701	2713	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_012824	ATA	4	2833	2844	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_012824	ATT	4	3645	3657	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_012824	TTA	4	3681	3693	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_012824	TAT	4	3758	3768	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_012824	TTA	4	3790	3802	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_012824	TTA	4	4200	4212	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_012824	ATA	4	5388	5399	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026669
11	NC_012824	TTA	4	5895	5905	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_012824	TAT	4	5989	5999	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_012824	AAT	4	6696	6706	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026670
14	NC_012824	GAA	4	6759	6769	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	24026670
15	NC_012824	ATT	4	7047	7058	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_012824	ATA	5	7249	7263	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_012824	ATT	4	7641	7652	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_012824	TTA	4	7901	7911	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_012824	TAA	4	7910	7922	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_012824	ATT	4	7969	7979	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_012824	ATT	4	9618	9629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_012824	TAT	5	10525	10539	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026670
23	NC_012824	TGG	4	10613	10624	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	24026670
24	NC_012824	ATA	4	11899	11909	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_012824	TTA	4	12356	12366	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_012824	ATA	4	12656	12667	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026669
27	NC_012824	ATT	4	12849	12859	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026669
28	NC_012824	TAA	5	13314	13329	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_012824	ATA	4	13784	13794	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026670
30	NC_012824	TAT	6	15545	15561	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	24026670
31	NC_012824	TAT	4	15610	15624	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026670
32	NC_012824	TTA	4	16620	16631	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026670
33	NC_012824	TAT	4	18446	18457	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
34	NC_012824	AGT	4	19388	19398	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_012824	AAT	4	19659	19669	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_012824	TAT	4	20144	20154	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026671
37	NC_012824	TAA	4	20680	20691	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_012824	TAT	4	21889	21900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_012824	TTA	4	21930	21941	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
40	NC_012824	TTA	4	22170	22181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
41	NC_012824	TAA	4	22255	22266	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026671
42	NC_012824	TAT	4	22264	22275	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
43	NC_012824	ATT	4	22313	22323	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026671
44	NC_012824	ATT	4	22532	22543	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
45	NC_012824	AAT	4	26711	26723	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	24026671
46	NC_012824	TTA	4	26890	26900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026671

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Trichophyton rubrum mitochondrion