ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Trichophyton rubrum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012824	ATTT	3	162	173	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026669
2	NC_012824	TTCA	3	471	482	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	24026669
3	NC_012824	ATC	4	710	721	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	24026669
4	NC_012824	TTG	4	755	766	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	24026669
5	NC_012824	TAAA	3	1009	1020	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	24026670
6	NC_012824	AAT	4	2701	2713	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_012824	ATA	4	2833	2844	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_012824	A	13	2906	2918	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_012824	GCAA	3	2944	2955	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_012824	TTAA	3	3188	3199	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012824	ATT	4	3645	3657	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_012824	TTA	4	3681	3693	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_012824	TAT	4	3758	3768	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_012824	TTA	4	3790	3802	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_012824	T	15	4153	4167	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_012824	TTA	4	4200	4212	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_012824	AAAT	5	4416	4435	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	24026669
18	NC_012824	ATA	4	5388	5399	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026669
19	NC_012824	A	14	5396	5409	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_012824	TTA	4	5895	5905	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_012824	TAT	4	5989	5999	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_012824	TA	6	6054	6065	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_012824	TA	6	6069	6080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_012824	TTATA	3	6372	6386	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_012824	AAT	4	6696	6706	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026670
26	NC_012824	GAA	4	6759	6769	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	24026670
27	NC_012824	TTTAAA	3	6820	6838	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	24026670
28	NC_012824	ATT	4	7047	7058	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_012824	ATA	5	7249	7263	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_012824	ATT	4	7641	7652	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_012824	ATTT	5	7666	7686	21	25 %	75 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
32	NC_012824	TTA	4	7901	7911	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_012824	TAA	4	7910	7922	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_012824	ATT	4	7969	7979	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_012824	A	13	8025	8037	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_012824	TAAA	3	8371	8382	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	24026670
37	NC_012824	TATCA	3	8786	8799	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	24026670
38	NC_012824	ATT	4	9618	9629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_012824	TAT	5	10525	10539	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026670
40	NC_012824	TGG	4	10613	10624	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	24026670
41	NC_012824	ATTA	3	11585	11595	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_012824	ATA	4	11899	11909	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_012824	TTA	4	12356	12366	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012824	TTAA	3	12410	12420	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_012824	T	15	12462	12476	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_012824	AT	11	12492	12515	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	24026669
47	NC_012824	ATTT	3	12524	12535	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	24026669
48	NC_012824	ATA	4	12656	12667	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026669
49	NC_012824	ATT	4	12849	12859	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026669
50	NC_012824	ATTA	4	13304	13319	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	24026669
51	NC_012824	TAA	5	13314	13329	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_012824	TA	6	13331	13341	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_012824	TA	7	13528	13540	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	24026670
54	NC_012824	ATA	4	13784	13794	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	24026670
55	NC_012824	TTTA	3	13969	13980	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026670
56	NC_012824	TTTA	3	14986	14997	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	24026670
57	NC_012824	TTTA	3	15168	15178	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	24026670
58	NC_012824	TAAT	3	15225	15236	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	24026670
59	NC_012824	TTTA	3	15271	15283	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026670
60	NC_012824	TAT	6	15545	15561	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	24026670
61	NC_012824	TAT	4	15610	15624	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	24026670
62	NC_012824	TA	6	16072	16082	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	24026670
63	NC_012824	TTA	4	16620	16631	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026670
64	NC_012824	TTTA	3	17008	17018	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	24026670
65	NC_012824	ATTT	3	17252	17264	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026670
66	NC_012824	ATATA	3	17270	17284	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	24026670
67	NC_012824	A	15	17311	17325	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_012824	AATT	3	17386	17397	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	24026671
69	NC_012824	TAT	4	18446	18457	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
70	NC_012824	AGT	4	19388	19398	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_012824	AAT	4	19659	19669	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_012824	T	16	20093	20108	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	24026671
73	NC_012824	TAT	4	20144	20154	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026671
74	NC_012824	TTTA	3	20273	20285	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026671
75	NC_012824	TTTA	3	20606	20616	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_012824	ATATT	3	20618	20632	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_012824	A	13	20662	20674	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_012824	TAA	4	20680	20691	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_012824	TAT	4	21889	21900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_012824	TTA	4	21930	21941	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
81	NC_012824	TTAA	3	22026	22036	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	24026671
82	NC_012824	ATTT	3	22058	22070	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	24026671
83	NC_012824	TTA	4	22170	22181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
84	NC_012824	TAA	4	22255	22266	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24026671
85	NC_012824	TAT	4	22264	22275	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
86	NC_012824	ATT	4	22313	22323	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026671
87	NC_012824	ATT	4	22532	22543	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24026671
88	NC_012824	TATAT	3	23030	23044	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	24026671
89	NC_012824	TAAA	4	23376	23391	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_012824	TTAA	3	23505	23516	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_012824	TTAG	3	23632	23642	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_012824	AATA	3	23848	23859	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	24026670
93	NC_012824	TAAA	3	24956	24966	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_012824	GAAA	3	26012	26022	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_012824	GTTT	3	26211	26222	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_012824	TTCC	3	26270	26282	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
97	NC_012824	TTTTA	3	26593	26606	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	24026671
98	NC_012824	AAT	4	26711	26723	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	24026671
99	NC_012824	TTA	4	26890	26900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	24026671
100	NC_012824	TAAAA	3	26965	26978	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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