ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Paraplea frontalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012822	TTATAT	3	215	232	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	240266411
2	NC_012822	TAA	4	230	244	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266411
3	NC_012822	TAT	4	246	257	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266411
4	NC_012822	ATA	4	355	365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266411
5	NC_012822	ATT	4	391	401	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266411
6	NC_012822	AT	6	830	840	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266411
7	NC_012822	ATTT	3	992	1003	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	240266411
8	NC_012822	GAG	4	2032	2042	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	240266412
9	NC_012822	ATAA	3	2799	2810	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266412
10	NC_012822	AAT	4	4038	4050	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	240266415
11	NC_012822	TAT	4	4137	4147	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266415
12	NC_012822	TTA	4	4489	4500	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266415
13	NC_012822	ATTAT	3	4507	4522	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	240266415
14	NC_012822	TTTC	3	4876	4887	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	240266416
15	NC_012822	AAT	7	5467	5487	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266417
16	NC_012822	ATT	4	5657	5668	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266417
17	NC_012822	ATT	7	5723	5743	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266417
18	NC_012822	AAAT	3	6192	6203	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	240266418
19	NC_012822	AATAAA	4	6204	6226	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	240266418
20	NC_012822	TAT	4	6244	6258	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	240266418
21	NC_012822	ATA	4	6461	6472	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266418
22	NC_012822	ATA	4	6622	6633	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266418
23	NC_012822	ATAG	3	6747	6758	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	240266418
24	NC_012822	GAAA	3	7012	7023	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	240266418
25	NC_012822	AAG	4	7294	7304	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	240266418
26	NC_012822	TAATA	4	7381	7399	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	240266418
27	NC_012822	ATAAAT	3	7893	7911	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	240266418
28	NC_012822	TAA	5	8544	8558	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266419
29	NC_012822	AATA	3	8814	8824	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266419
30	NC_012822	ATA	5	9000	9014	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266419
31	NC_012822	AAAAG	3	9241	9255	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	240266419
32	NC_012822	AGAGAA	3	9431	9448	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	240266420
33	NC_012822	AT	7	9542	9554	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	240266420
34	NC_012822	AAAT	3	9560	9571	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266420
35	NC_012822	ATA	4	9748	9759	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266421
36	NC_012822	TAT	4	9987	9997	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266421
37	NC_012822	ATTT	3	10809	10819	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	240266423
38	NC_012822	TTA	4	11118	11129	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266423
39	NC_012822	AATT	3	11343	11354	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	240266423
40	NC_012822	TAAAA	3	12044	12057	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	240266422
41	NC_012822	TAAA	3	12067	12078	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266422
42	NC_012822	TAA	4	12332	12342	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266422
43	NC_012822	AAATT	3	12349	12362	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	240266422
44	NC_012822	AAAT	3	13130	13140	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_012822	ATA	4	13250	13260	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012822	AAAT	3	13322	13332	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_012822	AAAT	4	13475	13490	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_012822	AATAA	3	13635	13649	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_012822	TAATA	3	14194	14207	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_012822	AAAT	3	14473	14483	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_012822	TA	6	14622	14634	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_012822	TTATT	3	15054	15067	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_012822	TTTA	3	15114	15125	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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