ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ochterus marginatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012820	GATA	3	31	43	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012820	CTT	4	186	197	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_012820	AT	6	368	378	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266383
4	NC_012820	AATT	3	872	882	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266383
5	NC_012820	TTTA	3	1055	1065	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	240266383
6	NC_012820	TAA	4	2835	2846	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266384
7	NC_012820	ATA	4	3109	3120	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266385
8	NC_012820	TTTA	6	3844	3865	22	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	240266386
9	NC_012820	AAAG	3	3919	3929	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	240266386
10	NC_012820	ATA	4	4053	4064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266387
11	NC_012820	TAA	5	5489	5503	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266389
12	NC_012820	ATA	4	5515	5526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266389
13	NC_012820	ATA	4	5542	5553	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266389
14	NC_012820	TTA	4	5705	5715	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266389
15	NC_012820	AAT	4	6275	6286	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266390
16	NC_012820	AAAG	3	6330	6341	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	240266390
17	NC_012820	AAAT	3	6799	6809	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266390
18	NC_012820	TAAA	3	6944	6954	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266390
19	NC_012820	TTA	4	7096	7107	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266390
20	NC_012820	AAG	4	8190	8202	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	240266391
21	NC_012820	TAAA	3	8561	8572	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266391
22	NC_012820	CAAA	3	9001	9011	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	240266391
23	NC_012820	TAAA	3	9012	9022	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266391
24	NC_012820	CAA	4	9137	9147	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	240266391
25	NC_012820	A	12	9315	9326	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	240266391
26	NC_012820	A	12	9612	9623	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	240266392
27	NC_012820	AAAT	3	9637	9647	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_012820	ATAG	3	9696	9708	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_012820	ATT	4	9950	9960	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266393
30	NC_012820	AAAC	3	10144	10155	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	240266393
31	NC_012820	ATT	4	10232	10243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266393
32	NC_012820	AC	6	10244	10254	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	240266393
33	NC_012820	TA	6	10572	10583	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	240266394
34	NC_012820	AAT	4	10866	10877	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266394
35	NC_012820	AAT	4	11349	11360	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266394
36	NC_012820	TAA	4	11393	11404	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266394
37	NC_012820	GAAAA	3	11902	11916	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	240266395
38	NC_012820	TAAAAA	3	11959	11976	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	240266395
39	NC_012820	AAT	5	12768	12783	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_012820	CAAAAA	4	12866	12890	25	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
41	NC_012820	TAAA	4	13114	13129	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_012820	TTA	4	13204	13215	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012820	TTAA	3	13449	13459	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012820	AAAT	3	13743	13753	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_012820	ATA	4	13800	13810	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012820	AAAAT	3	14124	14138	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_012820	ATA	4	14295	14305	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ochterus marginatus mitochondrion