ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Alsophila spinulosa chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012818	CAAA	3	507	518	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_012818	AAAT	3	2139	2151	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	242910149
3	NC_012818	TAAA	3	3280	3292	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	242910149
4	NC_012818	AATC	3	3664	3674	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	242910149
5	NC_012818	ATTT	3	4593	4603	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242910149
6	NC_012818	GAAC	3	5679	5689	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	242910149
7	NC_012818	AATT	3	7138	7148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
8	NC_012818	AGAA	3	9345	9356	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
9	NC_012818	AAGA	3	9531	9542	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
10	NC_012818	AATT	3	11144	11154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
11	NC_012818	GAAA	3	11674	11685	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
12	NC_012818	CATT	3	20380	20390	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	242910149
13	NC_012818	CTAT	4	28914	28929	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	242910149
14	NC_012818	AATA	3	28950	28961	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242910149
15	NC_012818	GATT	3	28990	29000	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	242910149
16	NC_012818	ACCT	3	30807	30819	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	242910149
17	NC_012818	TCAA	3	31718	31730	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	242910149
18	NC_012818	TTGA	3	31908	31919	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	242910149
19	NC_012818	TTGA	3	32813	32823	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	242910149
20	NC_012818	ATCT	4	33593	33608	16	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	242910149
21	NC_012818	ATAG	5	33611	33630	20	50 %	25 %	25 %	0 %	5 %	242910149
22	NC_012818	AAGC	3	34319	34329	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	242910149
23	NC_012818	CTTT	3	36518	36529	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
24	NC_012818	TCAA	3	36567	36578	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	242910149
25	NC_012818	CTTT	3	36790	36801	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
26	NC_012818	TTAA	3	37183	37194	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242910149
27	NC_012818	ATAA	3	37339	37350	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242910149
28	NC_012818	TCAA	3	37538	37549	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	242910149
29	NC_012818	TTTC	3	37968	37978	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242910149
30	NC_012818	TTTC	3	38767	38777	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242910149
31	NC_012818	ATTT	3	38905	38915	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242910149
32	NC_012818	CCTG	3	40294	40304	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	242910149
33	NC_012818	CTGA	3	49452	49462	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	242910149
34	NC_012818	CTTT	3	49869	49880	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
35	NC_012818	CTGC	3	56412	56422	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	242910149
36	NC_012818	TATT	3	58017	58032	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	242910149
37	NC_012818	AAAG	3	58039	58050	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
38	NC_012818	TTGT	3	58864	58875	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	242910149
39	NC_012818	ATGA	3	61302	61313	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	242910149
40	NC_012818	GATG	3	62556	62567	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	242910149
41	NC_012818	ATTA	3	64346	64357	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242910149
42	NC_012818	AATT	3	64673	64683	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
43	NC_012818	TTTC	3	67613	67624	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
44	NC_012818	TATC	3	69219	69230	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	242910149
45	NC_012818	GATA	3	69237	69248	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	242910149
46	NC_012818	TTCT	3	71720	71731	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
47	NC_012818	TTAT	3	81050	81061	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	242910149
48	NC_012818	ATCT	3	81815	81826	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	242910149
49	NC_012818	CCTC	3	82063	82074	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	242910149
50	NC_012818	AACC	3	94141	94151	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	242910149
51	NC_012818	TTAT	3	97719	97730	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	242910149
52	NC_012818	TCTT	3	97952	97963	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	242910149
53	NC_012818	CTTA	4	98709	98724	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	242910149
54	NC_012818	TTAG	3	98725	98736	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	242910149
55	NC_012818	GAAA	4	98776	98791	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	242910149
56	NC_012818	GAAA	3	103230	103240	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	242910149
57	NC_012818	TTTA	3	104958	104969	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	242910149
58	NC_012818	ATCC	3	106168	106179	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	242910149
59	NC_012818	AGAA	3	108199	108210	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	242910149
60	NC_012818	CATA	3	111049	111061	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	242910149
61	NC_012818	TCAA	3	112272	112283	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	242910149
62	NC_012818	ACGA	3	112873	112884	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	242910149
63	NC_012818	TTAA	3	114454	114465	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242910149
64	NC_012818	TGAT	3	119904	119915	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	242910149
65	NC_012818	AGAT	3	121663	121674	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	242910149
66	NC_012818	TTTC	3	124189	124199	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242910149
67	NC_012818	TTTC	3	125441	125451	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242910149
68	NC_012818	TAAA	3	127010	127021	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242910149
69	NC_012818	ACCA	4	129071	129086	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	242910149
70	NC_012818	TTTC	3	134759	134770	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	242910149
71	NC_012818	GGAT	3	136791	136802	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	242910149
72	NC_012818	CAAT	3	137941	137951	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	242910149
73	NC_012818	TAAA	3	138001	138012	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242910149
74	NC_012818	TTTC	3	139730	139740	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242910149
75	NC_012818	GGGA	3	141743	141754	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	242910149
76	NC_012818	CTTT	4	144178	144193	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	242910149
77	NC_012818	GTAA	3	144249	144260	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	242910149
78	NC_012818	ATAA	3	145240	145251	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242910149
79	NC_012818	GAGG	3	151072	151083	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	242910149
80	NC_012818	AGGT	3	151284	151295	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	242910149
81	NC_012818	ATTA	3	155805	155817	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242910149

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Alsophila spinulosa chloroplast