ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Eriogyna pyretorum mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012727	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_012727	AATT	3	790	800	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	238563961
3	NC_012727	TAA	4	1047	1059	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	238563961
4	NC_012727	ATT	4	1100	1111	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563961
5	NC_012727	TTTA	3	1255	1266	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	238563961
6	NC_012727	TAAT	3	1715	1726	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	238563962
7	NC_012727	AGG	4	2147	2158	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	238563962
8	NC_012727	GAAA	3	2266	2277	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	238563962
9	NC_012727	ATT	4	2882	2894	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	238563962
10	NC_012727	ATT	4	3332	3342	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	238563963
11	NC_012727	TTAA	3	3366	3378	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	238563963
12	NC_012727	AATT	3	3752	3762	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	238563963
13	NC_012727	AT	6	3918	3928	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_012727	TAT	4	3982	3993	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563964
15	NC_012727	ATT	4	4014	4024	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	238563964
16	NC_012727	ATTT	3	4217	4228	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	238563965
17	NC_012727	AATT	3	4446	4456	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	238563965
18	NC_012727	TTAA	3	4760	4771	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	238563965
19	NC_012727	TAA	4	4765	4777	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	238563965
20	NC_012727	ATT	4	5416	5427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563966
21	NC_012727	TATTTA	3	5568	5586	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_012727	ATTT	4	5861	5876	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	238563967
23	NC_012727	ATTT	3	5887	5898	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	238563967
24	NC_012727	TAT	4	5921	5932	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563967
25	NC_012727	TAA	4	6410	6420	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	238563968
26	NC_012727	TAAA	3	6451	6462	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	238563968
27	NC_012727	TAT	4	6758	6769	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563968
28	NC_012727	A	12	6988	6999	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	238563968
29	NC_012727	TTA	4	7276	7287	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563968
30	NC_012727	ATA	5	7381	7395	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	238563968
31	NC_012727	AAT	4	7416	7426	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	238563968
32	NC_012727	TAA	4	7819	7831	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	238563968
33	NC_012727	AAAT	3	8032	8043	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	238563968
34	NC_012727	TAT	4	8078	8090	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	238563968
35	NC_012727	ATC	4	8510	8521	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	238563969
36	NC_012727	TA	6	8997	9007	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	238563969
37	NC_012727	AAT	4	9004	9016	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	238563969
38	NC_012727	AAAAT	3	9206	9219	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	238563969
39	NC_012727	AAT	4	9395	9405	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	238563969
40	NC_012727	TAT	4	9528	9539	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563969
41	NC_012727	AT	7	9667	9681	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	238563970
42	NC_012727	ATT	5	9955	9968	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_012727	ATT	4	10009	10019	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	238563971
44	NC_012727	ATTTT	4	10131	10150	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	238563971
45	NC_012727	TTA	4	10168	10179	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563971
46	NC_012727	TAT	4	10257	10268	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	238563971
47	NC_012727	AAAT	3	10303	10314	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	238563971
48	NC_012727	ATTT	4	10438	10453	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	238563971
49	NC_012727	T	14	10796	10809	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	238563972
50	NC_012727	ATT	4	10881	10894	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	238563972
51	NC_012727	ATTT	3	11090	11100	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	238563972
52	NC_012727	ATTT	3	11225	11235	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	238563972
53	NC_012727	TAAT	4	11666	11681	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	238563972
54	NC_012727	ATT	4	11721	11731	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_012727	ATA	5	11789	11802	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	238563973
56	NC_012727	AATTAA	3	12194	12212	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	238563973
57	NC_012727	A	15	12359	12373	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	238563973
58	NC_012727	TA	6	12675	12686	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	238563973
59	NC_012727	TAAA	3	12795	12806	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_012727	T	12	13000	13011	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_012727	TTTA	3	13123	13134	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_012727	ATTT	3	13167	13177	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_012727	A	16	13196	13211	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012727	AAATT	4	13579	13599	21	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
65	NC_012727	AATA	3	13737	13747	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_012727	TAT	4	13750	13760	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_012727	ATTA	3	13871	13882	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012727	TAT	4	14093	14104	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_012727	TAATT	3	14131	14144	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_012727	ATAA	3	14359	14370	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_012727	AATTT	3	14720	14734	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_012727	ATTA	3	14743	14754	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012727	AATTT	3	14762	14776	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012727	T	24	14993	15016	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_012727	TA	6	15030	15043	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_012727	TA	14	15200	15226	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_012727	TTAA	3	15232	15244	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Eriogyna pyretorum mitochondrion