ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Diadegma semiclausum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012708	AT	43	254	338	85	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237869071
2	NC_012708	TTTCAA	3	411	428	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	237869071
3	NC_012708	TTAA	5	554	573	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	237869071
4	NC_012708	AAT	4	664	676	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	237869071
5	NC_012708	TAT	4	775	785	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	237869071
6	NC_012708	AATC	3	812	822	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	237869071
7	NC_012708	TTAT	4	922	937	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	237869071
8	NC_012708	TTAATT	3	1019	1036	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	237869071
9	NC_012708	TTA	5	1133	1147	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	237869071
10	NC_012708	ATTA	4	1370	1386	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_012708	GGA	4	2192	2202	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	237869072
12	NC_012708	GAAA	5	2303	2321	19	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	237869072
13	NC_012708	TTTA	4	2552	2567	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	237869072
14	NC_012708	AT	6	3753	3763	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_012708	TTA	4	4673	4685	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	237869073
16	NC_012708	TAT	4	4702	4712	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	237869073
17	NC_012708	ATTA	3	4714	4724	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237869073
18	NC_012708	ATA	4	4992	5002	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	237869073
19	NC_012708	AATT	3	5110	5121	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237869073
20	NC_012708	ATT	4	5414	5426	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	237869074
21	NC_012708	TAA	4	5686	5697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	237869075
22	NC_012708	ATTT	3	5729	5740	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	237869075
23	NC_012708	TTCA	3	6149	6160	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	237869075
24	NC_012708	AAAAT	3	6214	6227	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_012708	TAA	4	6228	6239	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_012708	T	15	6524	6538	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	237869076
27	NC_012708	ATT	4	7104	7117	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	237869077
28	NC_012708	TAA	4	7156	7167	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237869077
29	NC_012708	ATT	4	7314	7325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237869077
30	NC_012708	TAT	4	7391	7402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237869077
31	NC_012708	ATTA	3	7486	7497	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012708	ATTTTT	3	7695	7712	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_012708	TAAAA	3	7892	7906	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	237869078
34	NC_012708	A	16	8078	8093	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	237869078
35	NC_012708	TAATTT	3	8828	8845	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	237869078
36	NC_012708	TAA	4	9229	9240	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237869078
37	NC_012708	TAAA	3	9269	9280	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	237869078
38	NC_012708	TAAA	3	9539	9549	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_012708	AT	6	9609	9619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237869079
40	NC_012708	AT	6	9736	9748	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237869079
41	NC_012708	AATTAA	3	9772	9789	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	237869079
42	NC_012708	TGA	4	9874	9885	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	237869079
43	NC_012708	A	15	10582	10596	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	237869079
44	NC_012708	ATT	4	10675	10687	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	237869079
45	NC_012708	CAAATT	3	10714	10732	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	237869079
46	NC_012708	TAA	4	10821	10832	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237869079
47	NC_012708	A	19	10828	10846	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	237869079
48	NC_012708	A	12	10849	10860	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	237869079
49	NC_012708	ATTT	3	10881	10892	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	237869079
50	NC_012708	ATATAA	3	10899	10916	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	237869079
51	NC_012708	TAAAA	3	11031	11044	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	237869080
52	NC_012708	ATA	6	11148	11164	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	237869080
53	NC_012708	TAAAT	4	11415	11434	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_012708	TTTA	3	11457	11468	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_012708	TAATTT	3	11632	11649	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	237869081
56	NC_012708	AAATT	3	11813	11827	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	237869081
57	NC_012708	ATTT	3	11850	11861	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	237869081
58	NC_012708	AAATTT	3	11900	11917	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	237869081
59	NC_012708	TATATT	3	11987	12003	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	237869081
60	NC_012708	AAAT	3	12037	12047	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237869081
61	NC_012708	T	13	12337	12349	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	237869082
62	NC_012708	TA	7	12351	12364	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237869082
63	NC_012708	TAA	4	12641	12652	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237869082
64	NC_012708	AT	6	13306	13316	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237869083
65	NC_012708	TAAAA	4	13513	13531	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	237869083
66	NC_012708	ATTTAA	3	13675	13692	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	237869083
67	NC_012708	TATTAA	4	13936	13959	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237869083
68	NC_012708	AAAT	3	14196	14206	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237869083
69	NC_012708	ATTAA	4	14651	14670	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
70	NC_012708	AATT	3	14933	14944	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_012708	TTTA	3	15032	15042	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_012708	AAAT	3	15244	15255	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_012708	T	13	15524	15536	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_012708	A	12	15583	15594	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_012708	TA	48	15587	15678	92	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_012708	ATAA	3	15776	15787	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_012708	TATTAA	3	16209	16226	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_012708	TA	6	16332	16343	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_012708	AT	52	16362	16462	101	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_012708	TAA	4	16522	16533	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_012708	AATTT	4	16930	16950	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_012708	TAATT	4	16996	17016	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_012708	TATT	3	17024	17035	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012708	TAATT	4	17129	17149	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_012708	A	13	17181	17193	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_012708	AAT	4	17215	17226	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_012708	ATTA	3	17337	17347	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_012708	TTTAA	3	17379	17394	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_012708	TTTTAA	3	17438	17454	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_012708	TTAAT	3	17532	17545	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_012708	AT	14	17547	17573	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_012708	TAT	4	17585	17596	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_012708	AATTT	4	17646	17665	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
94	NC_012708	ATTA	6	17711	17735	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_012708	TAA	7	17726	17750	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_012708	AT	66	17735	17861	127	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_012708	AAAT	3	17879	17889	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_012708	TAATT	4	18077	18097	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_012708	TAT	4	18165	18176	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_012708	AATT	3	18226	18238	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_012708	TAATT	4	18314	18334	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_012708	TTAA	3	18589	18599	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_012708	TTAA	3	18601	18611	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_012708	TTAA	3	18613	18623	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_012708	TTTA	3	18624	18635	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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