ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Orussus occidentalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012689	AT	6	126	136	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_012689	TTAA	3	410	421	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237515458
3	NC_012689	CTTATT	3	562	580	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	237515458
4	NC_012689	ATT	4	976	987	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237515458
5	NC_012689	TATAA	3	1675	1688	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	237515459
6	NC_012689	TACT	3	2007	2017	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	237515459
7	NC_012689	AATT	3	2842	2852	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237515459
8	NC_012689	ATT	4	3089	3099	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	237515460
9	NC_012689	TA	6	3246	3256	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237515460
10	NC_012689	TATT	4	3896	3911	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	237515461
11	NC_012689	TAA	6	4211	4229	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	237515462
12	NC_012689	AAT	4	4674	4684	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	237515463
13	NC_012689	ATT	5	5815	5829	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	237515464
14	NC_012689	AAATA	5	6313	6335	23	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	237515465
15	NC_012689	ATA	4	6357	6368	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237515465
16	NC_012689	TAAA	3	6459	6469	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237515465
17	NC_012689	ATT	4	6613	6624	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237515465
18	NC_012689	A	12	6830	6841	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237515465
19	NC_012689	TAAA	3	7049	7059	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237515465
20	NC_012689	ATC	4	7513	7523	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	237515465
21	NC_012689	TAA	4	7655	7666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237515465
22	NC_012689	TAAA	3	8043	8054	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	237515466
23	NC_012689	AAAT	3	8065	8076	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	237515466
24	NC_012689	AAT	4	8205	8216	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237515466
25	NC_012689	ATT	4	8262	8273	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237515466
26	NC_012689	AT	6	8408	8418	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237515466
27	NC_012689	AATT	3	8816	8827	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237515466
28	NC_012689	AAAT	3	9639	9649	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237515467
29	NC_012689	ATC	4	9943	9954	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	237515468
30	NC_012689	AT	7	10679	10691	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237515469
31	NC_012689	ATCT	3	10818	10828	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	237515469
32	NC_012689	TTAA	3	11075	11087	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237515469
33	NC_012689	AGTT	3	11580	11591	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_012689	A	22	11840	11861	22	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	237515470
35	NC_012689	ATAA	3	12062	12072	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237515470
36	NC_012689	AT	7	12095	12108	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237515470
37	NC_012689	TAA	4	12209	12221	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	237515470
38	NC_012689	TAAT	3	12635	12646	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_012689	TAA	4	12689	12700	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_012689	TAA	4	13747	13758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_012689	TA	6	14523	14533	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_012689	TTTAAT	3	14582	14599	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_012689	TA	7	14826	14839	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_012689	AATTAA	3	14864	14882	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_012689	TAAA	3	14992	15002	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012689	ATA	4	15035	15046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_012689	ATT	4	15082	15092	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_012689	TC	6	15170	15181	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
49	NC_012689	TTTC	3	15396	15406	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_012689	A	36	15408	15443	36	100 %	0 %	0 %	0 %	2 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Orussus occidentalis mitochondrion