ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cephus cinctus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012688	AT	13	63	89	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012688	TAA	8	89	111	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_012688	AT	7	228	240	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_012688	TAT	5	372	385	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	237515448
5	NC_012688	AAT	4	390	402	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	237515448
6	NC_012688	TA	6	837	849	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237515448
7	NC_012688	ATT	4	935	946	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237515448
8	NC_012688	ATT	4	954	965	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237515448
9	NC_012688	TAA	4	1163	1174	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237515448
10	NC_012688	TTAA	3	1211	1222	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237515448
11	NC_012688	TTAT	3	1279	1291	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	237515448
12	NC_012688	GAAA	3	2334	2345	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	237515444
13	NC_012688	ATTT	4	2575	2590	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	237515444
14	NC_012688	ATTTAT	3	2785	2802	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	237515444
15	NC_012688	TTAA	3	3236	3246	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237515445
16	NC_012688	TTTA	3	4103	4114	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	237515449
17	NC_012688	TTAC	3	4699	4709	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	237515446
18	NC_012688	AATTTT	3	5022	5039	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	237515447
19	NC_012688	TA	7	5108	5121	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237515447
20	NC_012688	ATTTA	3	5664	5677	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	237515447
21	NC_012688	ATT	4	5685	5696	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_012688	TA	7	5697	5709	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_012688	TAT	4	5827	5837	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	237515450
24	NC_012688	A	12	5839	5850	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	237515450
25	NC_012688	TA	7	6184	6196	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_012688	AAATAA	3	6572	6590	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	237515451
27	NC_012688	AT	6	6672	6684	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237515451
28	NC_012688	AAATAT	3	7105	7123	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	237515451
29	NC_012688	TAAA	3	7327	7337	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237515451
30	NC_012688	TTA	4	7537	7548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237515451
31	NC_012688	TTA	4	7927	7938	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	237515451
32	NC_012688	A	15	8198	8212	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237515451
33	NC_012688	AT	7	8242	8254	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_012688	TAA	4	8477	8487	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	237515452
35	NC_012688	TAT	4	8591	8602	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	237515452
36	NC_012688	TAAAC	3	8834	8847	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	237515452
37	NC_012688	AT	8	9139	9153	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	237515452
38	NC_012688	AAAT	3	9433	9444	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	237515452
39	NC_012688	ATA	4	9701	9712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237515453
40	NC_012688	AAAT	3	9797	9808	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	237515453
41	NC_012688	TAAAT	3	9984	9999	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_012688	AT	6	10098	10109	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237515454
43	NC_012688	TTAA	3	10188	10198	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237515454
44	NC_012688	TTAT	3	10226	10237	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	237515454
45	NC_012688	TAT	4	10244	10254	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	237515454
46	NC_012688	TTAA	3	10506	10516	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237515454
47	NC_012688	T	14	10942	10955	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	237515455
48	NC_012688	TAAA	3	11809	11819	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237515455
49	NC_012688	ATAA	4	12069	12083	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	237515456
50	NC_012688	TAAA	3	12136	12146	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	237515456
51	NC_012688	ATA	4	12310	12320	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	237515456
52	NC_012688	TAAA	3	12371	12382	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	237515456
53	NC_012688	TAA	4	12521	12532	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237515456
54	NC_012688	TTAATA	3	12595	12612	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	237515456
55	NC_012688	AAAT	3	12619	12631	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	237515456
56	NC_012688	ATTA	4	13003	13017	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_012688	ATA	6	13232	13248	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_012688	TAAT	4	13345	13360	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_012688	ATTC	3	13485	13496	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_012688	TTA	4	13714	13725	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_012688	AATT	3	13734	13745	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_012688	AAATT	3	14291	14304	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_012688	ATA	4	15178	15189	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_012688	AAATT	3	15262	15276	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_012688	TA	17	15465	15497	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_012688	AAT	4	15498	15509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_012688	TTA	4	15599	15609	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_012688	ATA	8	15613	15636	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_012688	ATT	4	15665	15675	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_012688	AAT	4	15676	15687	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_012688	TAT	4	15762	15772	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_012688	ATA	4	15917	15928	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_012688	ATT	4	15963	15973	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_012688	AAT	4	15974	15985	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_012688	TAT	4	16060	16070	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_012688	ATA	4	16215	16226	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_012688	ATT	4	16261	16271	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_012688	AAT	4	16272	16283	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_012688	TAT	4	16358	16368	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_012688	AAATA	3	16491	16506	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_012688	ATA	4	16522	16533	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_012688	TAATA	3	16562	16576	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_012688	T	16	16703	16718	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012688	AT	6	16755	16768	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_012688	TTAA	7	16794	16821	28	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
86	NC_012688	TAT	4	16858	16869	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_012688	TAAT	3	16901	16912	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_012688	TA	6	16945	16958	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_012688	TA	7	16981	16993	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_012688	TTAA	3	17046	17056	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_012688	TAA	4	17182	17194	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_012688	TA	8	17219	17233	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_012688	TTA	4	17239	17249	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_012688	TAA	4	17295	17306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_012688	TA	6	17340	17350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_012688	TATTT	3	17371	17385	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012688	ATT	4	17445	17456	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_012688	AAT	4	17451	17462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_012688	A	14	17543	17556	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_012688	AAAATA	3	17654	17672	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
101	NC_012688	AATTT	4	18056	18074	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
102	NC_012688	TTTAAT	3	19303	19320	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

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