ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ephemera orientalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012645	TA	6	130	140	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_012645	AAAT	3	392	402	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	229324790
3	NC_012645	ATT	4	456	466	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	229324790
4	NC_012645	ATT	4	888	898	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	229324790
5	NC_012645	ATT	4	1035	1046	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	229324790
6	NC_012645	CTT	4	2034	2046	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	229324791
7	NC_012645	AGG	4	2124	2135	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	229324791
8	NC_012645	TTTAA	3	3943	3957	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	229324793
9	NC_012645	ATT	4	3966	3978	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	229324793
10	NC_012645	TTAAT	3	4279	4293	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	229324794
11	NC_012645	CA	6	4405	4415	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	229324794
12	NC_012645	TTG	4	5452	5463	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	229324795
13	NC_012645	TTA	4	5815	5825	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	229324796
14	NC_012645	TTAT	4	6064	6079	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_012645	AT	22	6074	6116	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_012645	ATAA	3	6363	6374	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	229324797
17	NC_012645	ATT	4	6427	6437	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	229324797
18	NC_012645	TTA	4	6633	6644	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	229324797
19	NC_012645	TTGAT	3	6664	6677	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	229324797
20	NC_012645	AGAAA	4	6934	6952	19	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	229324797
21	NC_012645	CTA	4	7521	7532	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	229324797
22	NC_012645	AAAT	3	7577	7587	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	229324797
23	NC_012645	TAA	4	7776	7788	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	229324797
24	NC_012645	TAA	4	8103	8113	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_012645	TAAA	3	8707	8718	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	229324798
26	NC_012645	TTAA	3	8787	8798	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	229324798
27	NC_012645	AAAT	3	9070	9080	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	229324798
28	NC_012645	TAA	4	9123	9135	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	229324798
29	NC_012645	AAAAT	3	9159	9172	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	229324798
30	NC_012645	ATT	4	9760	9771	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	229324799
31	NC_012645	CTAT	3	10340	10350	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	229324800
32	NC_012645	ATTT	3	11149	11159	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	229324801
33	NC_012645	CCAA	3	11411	11422	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	229324801
34	NC_012645	TTA	4	11494	11504	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	229324801
35	NC_012645	ATTA	3	11590	11601	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012645	TAA	4	13037	13047	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_012645	AAAT	5	13744	13764	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_012645	TAAATA	3	13912	13928	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_012645	TAAA	3	14710	14721	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_012645	TA	9	14927	14944	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_012645	AAAT	3	14956	14967	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_012645	TA	6	15067	15080	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_012645	TAT	4	15128	15138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012645	TA	12	15143	15166	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_012645	TA	16	15176	15207	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012645	TAA	4	15262	15274	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_012645	ATT	4	15485	15495	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_012645	TA	6	15495	15505	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_012645	AAAAAT	3	15990	16008	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_012645	AATAA	3	16212	16226	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ephemera orientalis mitochondrion