ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Micromonas sp. RCC299 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012643	ACA	4	1094	1106	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	22931589
2	NC_012643	GAACC	3	2207	2220	14	40 %	0 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
3	NC_012643	TA	6	2256	2266	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_012643	TTAT	3	3778	3788	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22931589
5	NC_012643	TGA	4	3999	4010	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	22931589
6	NC_012643	TA	6	4124	4135	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_012643	TA	6	4156	4166	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_012643	ATTTT	3	4592	4605	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_012643	A	17	4697	4713	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_012643	AG	6	4814	4825	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012643	TAAATA	3	4884	4900	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_012643	TACA	3	5134	5145	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_012643	CATG	3	6355	6366	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_012643	TATT	3	6883	6893	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_012643	TGT	4	9537	9548	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_012643	AATA	3	9882	9893	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22931589
17	NC_012643	TCA	4	9997	10008	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	22931589
18	NC_012643	TAA	4	10246	10258	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22931589
19	NC_012643	TAA	4	10706	10717	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22931589
20	NC_012643	GAA	4	11548	11558	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	22931589
21	NC_012643	ACA	4	12669	12681	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	22931589
22	NC_012643	TATT	3	12722	12732	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22931589
23	NC_012643	TGG	4	14799	14809	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	22931590
24	NC_012643	AGAA	3	15512	15523	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	22931590
25	NC_012643	ATTCT	3	16416	16429	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
26	NC_012643	ACAA	3	17638	17649	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	22931590
27	NC_012643	ATC	4	18548	18558	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	22931590
28	NC_012643	TGAA	3	18935	18946	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	22931590
29	NC_012643	AT	7	20006	20019	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22931590
30	NC_012643	CTT	4	20131	20141	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
31	NC_012643	A	12	20164	20175	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_012643	ATTT	3	20956	20967	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	22931590
33	NC_012643	TGTGT	3	23253	23266	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_012643	TTG	4	23624	23636	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	22931590
35	NC_012643	ATT	4	26051	26062	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22931591
36	NC_012643	CAA	5	26759	26772	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
37	NC_012643	AAAT	3	29412	29422	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_012643	AT	7	31156	31169	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_012643	ATATTT	3	31405	31421	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_012643	TC	6	31482	31493	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
41	NC_012643	T	19	31600	31618	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_012643	TA	6	32171	32182	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012643	TCA	4	32296	32307	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	22931591
44	NC_012643	AATA	3	32517	32527	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22931591
45	NC_012643	TGT	4	35200	35212	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	22931591
46	NC_012643	GATA	3	35489	35499	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	22931591
47	NC_012643	GAAA	4	36603	36617	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	22931591
48	NC_012643	AT	6	37973	37984	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22931591
49	NC_012643	AAATT	3	38456	38470	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_012643	ATGT	3	39297	39307	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	22931591
51	NC_012643	TTAT	3	40238	40248	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_012643	ACA	4	40495	40506	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	22931592
53	NC_012643	TA	6	43234	43245	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22931592
54	NC_012643	AT	6	44512	44523	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22931592
55	NC_012643	GTT	4	45489	45499	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	22931592
56	NC_012643	ATC	4	46441	46451	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	22931593
57	NC_012643	AAT	4	47105	47116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Micromonas sp. RCC299 mitochondrion