ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Nakaseomyces bacillisporus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012621	ATTAT	3	385	400	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_012621	AAATT	3	2449	2464	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	22801542
3	NC_012621	ATTAT	4	5531	5550	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_012621	ATTTT	4	5599	5618	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_012621	ATTAT	7	6558	6592	35	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_012621	ATTAT	15	6563	6637	75	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_012621	TATAT	4	6638	6657	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_012621	TTATA	3	7417	7430	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_012621	ATTAT	5	7519	7541	23	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_012621	ATTAT	9	8278	8322	45	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012621	CCAAC	4	8568	8587	20	40 %	0 %	0 %	60 %	5 %	Non-Coding
12	NC_012621	ATTAT	3	10888	10902	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_012621	ATTTA	3	11946	11960	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_012621	ATTAT	4	12550	12569	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_012621	ATTAT	4	12658	12677	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_012621	TATAT	5	14159	14182	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_012621	TAATA	4	15086	15106	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_012621	AATAT	4	15477	15497	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_012621	AAATT	31	15608	15765	158	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_012621	TAATA	8	17134	17173	40	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_012621	TAATA	10	17194	17242	49	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_012621	ATTAT	4	19513	19531	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_012621	TAATA	3	20196	20209	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_012621	GAGGG	3	20273	20287	15	20 %	0 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012621	TAATA	9	21779	21820	42	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_012621	TAATA	5	21821	21844	24	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_012621	ATTAT	5	22438	22462	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_012621	ATATT	4	22485	22508	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_012621	TTTAT	3	22641	22655	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_012621	ATTAT	11	25858	25911	54	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_012621	ATATT	3	29417	29430	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_012621	TATAA	5	30941	30965	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_012621	ATAAA	7	31978	32012	35	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_012621	ATTTA	3	33919	33933	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012621	ATTAT	3	34247	34260	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_012621	TTTTA	3	34586	34600	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_012621	ATTAT	3	34824	34838	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012621	TATAT	5	35097	35120	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_012621	ATTAT	25	35306	35430	125	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_012621	TATAT	6	35423	35452	30	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_012621	TATAT	9	35478	35522	45	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_012621	TATAT	11	35513	35567	55	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_012621	TATAT	7	35614	35647	34	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_012621	ATATT	3	36068	36082	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	22801542
45	NC_012621	TATAT	8	36996	37035	40	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_012621	ATTAT	3	37338	37351	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_012621	ATATT	16	38285	38369	85	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_012621	AATTT	3	38836	38850	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_012621	AATAT	3	39913	39926	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_012621	AATAT	4	40343	40363	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_012621	TATAA	3	42370	42383	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_012621	TATAT	5	43126	43149	24	40 %	60 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
53	NC_012621	TATTT	6	43914	43948	35	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_012621	ATTAT	5	44711	44735	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_012621	ATTAT	5	44745	44769	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_012621	ATTAT	5	44779	44803	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_012621	TATAT	5	44935	44959	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_012621	TTTAT	4	45072	45090	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_012621	TATAT	10	47576	47626	51	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_012621	ATATA	3	48934	48947	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_012621	TATAA	5	49608	49632	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_012621	TAATT	3	49665	49679	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012621	TAATA	9	49760	49804	45	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_012621	TAATT	3	49805	49819	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_012621	TATAA	13	51089	51153	65	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_012621	TTTTA	3	51170	51184	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_012621	TAATA	3	51701	51714	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_012621	TTATA	3	52476	52490	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012621	AATTA	3	52556	52570	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_012621	ATTAT	4	53333	53351	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
71	NC_012621	AGATA	3	53465	53478	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_012621	ATTTT	3	56109	56123	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_012621	ATTAT	3	56124	56138	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_012621	TATAA	3	56168	56182	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_012621	TAATT	16	57330	57409	80	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_012621	ATTTA	10	57724	57772	49	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_012621	ATATA	11	58454	58507	54	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_012621	TATAT	4	60523	60542	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_012621	TTATA	3	60688	60701	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_012621	ATATA	5	60975	60999	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_012621	TATAA	5	61642	61665	24	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_012621	TAATT	5	62387	62411	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_012621	AATAT	4	62423	62442	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_012621	ATATA	3	62478	62492	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_012621	ATATA	5	62513	62537	25	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
86	NC_012621	ATATA	19	62543	62637	95	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_012621	TAAAA	8	65576	65615	40	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_012621	TAATA	4	67775	67798	24	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
89	NC_012621	ATATT	4	69144	69168	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_012621	ATTAT	3	69286	69299	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_012621	TAATA	6	69766	69796	31	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_012621	TATTT	5	72159	72183	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_012621	TATAT	11	73746	73798	53	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_012621	AATAT	3	73864	73878	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_012621	AATAT	3	74181	74195	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_012621	ATAAT	3	74196	74209	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_012621	ATATT	3	77585	77598	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_012621	TATAT	7	81218	81251	34	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_012621	ATTAT	9	81752	81799	48	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_012621	TATAA	3	82217	82230	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_012621	ATATT	6	82753	82781	29	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
102	NC_012621	TATAA	11	84838	84891	54	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_012621	AATAT	29	84841	84983	143	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_012621	ATATA	5	84982	85005	24	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_012621	TAATA	4	87966	87986	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_012621	TAATC	15	88129	88203	75	40 %	40 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
107	NC_012621	TAAAT	5	88821	88845	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_012621	TTATT	4	90413	90431	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
109	NC_012621	AATAT	4	95524	95544	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_012621	ATATT	3	96352	96365	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_012621	TATAT	7	96998	97032	35	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_012621	ATATA	10	98969	99018	50	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_012621	ATTAA	9	100483	100527	45	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_012621	TTATA	3	101600	101615	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_012621	ATTAT	7	101627	101661	35	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_012621	AATAT	5	102088	102110	23	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_012621	AATAT	5	103871	103895	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_012621	TAAAT	11	104583	104636	54	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Nakaseomyces bacillisporus mitochondrion