ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Candida castellii mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012620	TAATAT	3	517	535	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
2	NC_012620	TAATAT	3	569	587	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
3	NC_012620	TATTTA	4	1565	1588	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012620	AATATT	5	1592	1621	30	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_012620	TATTAA	4	1631	1654	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_012620	AATTAT	3	2382	2400	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_012620	ATTAAT	3	2658	2676	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_012620	AAATAT	4	3418	3440	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_012620	TAATTA	3	6227	6245	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_012620	ATTAAT	4	8333	8356	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012620	TATTAA	3	10485	10502	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_012620	TATAAA	3	10988	11006	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_012620	ATATAA	3	11073	11090	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_012620	TATAAA	3	11323	11341	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_012620	GTAATT	3	11547	11564	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_012620	ATTTAT	3	11852	11869	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_012620	ATTATA	3	12806	12823	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_012620	AAAAAT	3	12968	12985	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_012620	ATTTAT	4	13061	13085	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_012620	TATAAT	4	13490	13513	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_012620	TAAATA	3	13563	13581	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_012620	TTATAT	4	14032	14054	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_012620	TATAAT	4	14065	14088	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_012620	ATATTA	4	14084	14106	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_012620	TTATAT	3	14309	14326	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_012620	TTATAT	3	14380	14397	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012620	TTTTAT	3	15916	15933	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_012620	TATTAA	3	16871	16888	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	22801541
29	NC_012620	ATAATT	3	18040	18057	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	22801541
30	NC_012620	AAAATA	5	19486	19515	30	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	6 %	22801541
31	NC_012620	TTAAAA	3	19791	19808	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	22801541
32	NC_012620	AATATA	3	21069	21086	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_012620	TAAATA	3	21133	21150	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_012620	TAATTA	5	21251	21281	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_012620	ATTAAT	3	21608	21626	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
36	NC_012620	GTAATA	3	21731	21748	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_012620	TATTAA	3	22169	22185	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_012620	TAATAT	3	22574	22591	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_012620	TATATT	3	22805	22822	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_012620	TATTAA	3	23262	23279	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_012620	AATTTG	3	23342	23360	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_012620	TATTAA	4	25661	25684	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012620	ATATTT	9	25705	25758	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012620	TTATAT	4	25751	25774	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_012620	TATTTA	5	25779	25810	32	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012620	TAATTA	3	27760	27778	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_012620	ATAAAT	4	28552	28575	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
48	NC_012620	TATAAT	4	28679	28702	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_012620	AATTAT	3	28703	28720	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_012620	TATAAT	4	28992	29015	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
51	NC_012620	ATTAAT	4	29043	29066	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_012620	TAATTA	3	29258	29276	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_012620	TATAAA	5	29654	29683	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_012620	ATTATA	4	29818	29840	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_012620	ATATTA	4	30142	30165	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_012620	ATATTA	3	31992	32009	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	22801541
57	NC_012620	AATATA	4	32733	32755	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22801541
58	NC_012620	AAAATA	3	34201	34219	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	22801541
59	NC_012620	TAATAT	3	35462	35479	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	22801541
60	NC_012620	TATAAA	7	35480	35521	42	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22801541
61	NC_012620	TATTTA	3	36710	36726	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	22801541
62	NC_012620	AAATAT	3	37674	37692	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
63	NC_012620	ATAATT	6	37857	37890	34	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_012620	ATTTAT	4	38592	38615	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_012620	ATATTA	4	38614	38637	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_012620	ATTAAT	3	40788	40806	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	22801541
67	NC_012620	AAATAT	3	41613	41631	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_012620	AATATA	3	42094	42111	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_012620	ATAATC	9	44885	44937	53	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	7 %	Non-Coding
70	NC_012620	ATAATC	21	44885	45009	125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
71	NC_012620	TAAAAT	3	46759	46776	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_012620	TATAAT	4	47880	47902	23	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
73	NC_012620	ATATAA	3	48155	48173	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
74	NC_012620	TAATAT	7	49319	49360	42	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_012620	TATAAT	4	49395	49418	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_012620	TAATAT	3	50093	50109	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Candida castellii mitochondrion