ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida castellii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012620	ATT	6	942	959	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_012620	ATT	5	963	977	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_012620	TTA	4	1034	1044	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_012620	TAT	5	1130	1143	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_012620	TAT	12	1192	1226	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_012620	TAT	12	1301	1336	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_012620	ATT	7	1770	1790	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_012620	ATA	4	2013	2023	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_012620	TAT	5	2042	2056	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_012620	ATT	5	2085	2100	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_012620	TAA	4	2286	2297	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_012620	TAT	4	2454	2464	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_012620	ATT	4	2576	2588	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_012620	ATT	8	2608	2631	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_012620	ATT	16	2608	2654	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_012620	TAT	5	2814	2829	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_012620	ATT	8	2852	2876	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_012620	TAT	4	3083	3095	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_012620	ATT	8	3135	3159	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_012620	TAT	5	3162	3176	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_012620	TAT	9	3200	3226	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_012620	TAT	5	3243	3257	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_012620	TAT	4	3266	3277	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_012620	ATA	6	3349	3365	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_012620	TAT	5	3678	3692	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_012620	ATT	5	3820	3834	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_012620	ATT	5	3839	3853	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_012620	ATT	5	3861	3876	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_012620	TTA	7	3895	3916	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_012620	ATT	10	3979	4009	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_012620	ATT	15	4029	4072	44	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_012620	ATA	4	4081	4092	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_012620	TTA	6	4165	4181	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_012620	ATT	4	4338	4350	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_012620	ATA	4	5000	5010	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_012620	TTA	4	5008	5019	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_012620	AAT	4	5020	5030	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_012620	ATA	4	5083	5095	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_012620	ATT	4	5279	5290	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_012620	ATA	4	5288	5299	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_012620	ATA	5	5566	5579	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_012620	ATT	5	6069	6083	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_012620	ATA	5	6198	6211	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_012620	AAT	4	6558	6570	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_012620	ATA	11	7405	7436	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012620	ATA	4	7481	7495	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_012620	AAT	7	7506	7527	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_012620	ATA	5	7552	7566	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_012620	ATA	5	7577	7591	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_012620	ATA	5	7618	7632	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_012620	TAA	4	7753	7767	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_012620	ATA	12	7814	7849	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012620	AAT	4	7850	7862	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_012620	ATA	4	7941	7951	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_012620	AAT	5	7978	7993	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_012620	ATA	4	8096	8106	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_012620	ATA	4	8109	8119	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_012620	ATA	5	8139	8152	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_012620	ATA	7	8221	8242	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_012620	ATA	5	8246	8261	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_012620	TAA	4	8450	8460	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
62	NC_012620	TAA	4	8582	8593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22801541
63	NC_012620	ATA	4	8622	8634	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22801541
64	NC_012620	ATA	4	8684	8694	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
65	NC_012620	ATA	6	8755	8771	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	22801541
66	NC_012620	TTA	4	8772	8783	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22801541
67	NC_012620	ATA	7	8839	8859	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
68	NC_012620	TTA	4	8857	8868	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22801541
69	NC_012620	TAT	4	8913	8923	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22801541
70	NC_012620	ATA	7	8926	8947	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
71	NC_012620	TAA	4	8984	8994	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
72	NC_012620	TAA	12	9004	9037	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22801541
73	NC_012620	TTA	4	9065	9076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22801541
74	NC_012620	TAA	4	9185	9196	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22801541
75	NC_012620	TAA	4	9230	9241	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22801541
76	NC_012620	ATA	4	9292	9302	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
77	NC_012620	TAA	4	9306	9316	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
78	NC_012620	TAA	4	9479	9489	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22801541
79	NC_012620	TAA	4	9566	9577	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22801541
80	NC_012620	TAA	8	9683	9708	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_012620	TTA	4	9755	9765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_012620	TAT	5	9769	9782	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_012620	TAA	5	9806	9821	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_012620	ATA	4	9849	9861	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_012620	TAT	5	9938	9953	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_012620	ATT	4	10093	10104	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_012620	TAA	4	10107	10118	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_012620	TAA	5	10151	10165	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_012620	TAA	5	10173	10187	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_012620	ATA	4	10286	10296	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_012620	TAA	5	10314	10328	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_012620	TAA	4	10379	10390	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_012620	ATT	4	10446	10458	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_012620	TAA	11	10674	10707	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_012620	TAA	18	10730	10783	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_012620	ATT	4	10797	10807	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_012620	TAT	4	10947	10958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_012620	AAT	4	10956	10968	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_012620	TAA	4	11060	11072	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_012620	TAA	16	11101	11148	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_012620	ATA	5	11273	11288	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_012620	ATA	5	11307	11321	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_012620	ATA	4	11343	11357	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_012620	ATA	4	11455	11466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_012620	AAT	4	11499	11511	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_012620	ATA	8	11528	11552	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_012620	TAA	4	11575	11589	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_012620	ATA	4	11601	11612	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_012620	TAA	4	11623	11637	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_012620	ATA	4	11932	11942	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_012620	TAT	4	11985	11996	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22801541
112	NC_012620	ATT	4	12305	12317	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_012620	ATA	4	12360	12372	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_012620	TAA	4	12407	12418	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_012620	ATA	8	12560	12582	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_012620	TTA	4	12666	12676	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_012620	TAA	8	12677	12701	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_012620	TAA	5	12704	12718	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_012620	TAA	5	12730	12744	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_012620	ATA	4	12761	12772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_012620	ATA	4	12794	12805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_012620	ATT	4	13181	13192	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_012620	ATT	4	13232	13243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_012620	TAT	4	13314	13324	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_012620	AAT	4	13687	13698	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_012620	TAA	5	13775	13789	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_012620	ATA	8	13930	13953	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_012620	TAA	5	14300	14314	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_012620	TAA	4	14399	14410	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_012620	TAA	12	14465	14501	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_012620	TAA	5	14537	14551	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_012620	AAT	5	14587	14601	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_012620	AGT	6	14671	14687	17	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
134	NC_012620	TAT	4	14783	14794	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_012620	TAA	7	14985	15008	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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261	NC_012620	TAA	6	31548	31565	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	22801541
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372	NC_012620	ATT	6	49825	49845	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
373	NC_012620	ATT	4	49994	50005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
374	NC_012620	ATA	22	50230	50295	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida castellii mitochondrion