ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Geisha distinctissima mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012617	AAT	4	217	228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	228015377
2	NC_012617	AATT	3	301	313	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	228015377
3	NC_012617	TAA	4	474	484	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	228015377
4	NC_012617	ACA	4	598	610	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	228015377
5	NC_012617	AAT	5	787	807	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	228015377
6	NC_012617	ACAGGA	3	1702	1719	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	228015378
7	NC_012617	A	13	3873	3885	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	228015380
8	NC_012617	A	16	3898	3913	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	228015380
9	NC_012617	ATA	4	4239	4250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	228015381
10	NC_012617	AAT	4	5439	5450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	228015383
11	NC_012617	TAA	4	5471	5482	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	228015383
12	NC_012617	A	17	5487	5503	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	228015383
13	NC_012617	AAAAAT	3	5649	5667	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	228015383
14	NC_012617	TTAA	3	5884	5895	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_012617	A	44	6152	6195	44	100 %	0 %	0 %	0 %	9 %	228015384
16	NC_012617	A	12	6414	6425	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	228015384
17	NC_012617	A	15	6531	6545	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	228015384
18	NC_012617	A	18	6559	6576	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	228015384
19	NC_012617	A	13	6622	6634	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	228015384
20	NC_012617	A	23	6699	6721	23	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	228015384
21	NC_012617	AAAT	3	6987	6997	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	228015384
22	NC_012617	CAAA	3	7275	7285	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	228015384
23	NC_012617	A	14	7552	7565	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	228015384
24	NC_012617	CAAA	3	7639	7650	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	228015384
25	NC_012617	ATAA	3	7655	7665	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	228015384
26	NC_012617	A	12	7770	7781	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	228015384
27	NC_012617	A	12	7883	7894	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	228015385
28	NC_012617	A	12	8008	8019	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	228015385
29	NC_012617	AGAAA	3	8037	8051	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	228015385
30	NC_012617	AAAT	3	8648	8658	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	228015385
31	NC_012617	AAAT	3	8692	8703	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	228015385
32	NC_012617	A	16	8856	8871	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	228015385
33	NC_012617	AAAT	4	9010	9025	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	228015385
34	NC_012617	A	35	9086	9120	35	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	228015385
35	NC_012617	CAAA	3	9139	9150	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	228015385
36	NC_012617	A	29	9323	9351	29	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	228015386
37	NC_012617	CAA	4	9637	9647	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	228015387
38	NC_012617	TAA	4	9850	9861	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	228015387
39	NC_012617	ATA	4	9870	9884	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	228015387
40	NC_012617	TAA	4	9980	9990	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	228015387
41	NC_012617	ATA	4	10005	10016	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	228015387
42	NC_012617	AATA	3	10995	11005	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	228015388
43	NC_012617	CAAA	3	11011	11022	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	228015388
44	NC_012617	AAT	4	11052	11064	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	228015388
45	NC_012617	A	15	11445	11459	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	228015389
46	NC_012617	A	12	11479	11490	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	228015389
47	NC_012617	A	13	11702	11714	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	228015389
48	NC_012617	A	12	12180	12191	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	228015389
49	NC_012617	AAAT	3	12308	12318	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_012617	A	14	12552	12565	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_012617	A	13	12609	12621	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_012617	AAAT	3	12631	12642	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012617	AATT	3	13283	13294	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_012617	A	16	13346	13361	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012617	A	30	13431	13460	30	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012617	AAAT	3	13646	13656	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_012617	ATAAA	4	13678	13696	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_012617	CTAA	3	13754	13766	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
59	NC_012617	AAAT	3	13930	13940	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_012617	TAAAA	3	13996	14009	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_012617	AAAAT	3	14169	14182	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_012617	AAAATC	3	14246	14264	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
63	NC_012617	ATT	4	14982	14993	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_012617	TAT	4	15162	15173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_012617	TTATAT	3	15260	15277	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_012617	TAA	4	15286	15296	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_012617	TA	6	15304	15315	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_012617	TA	8	15425	15439	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_012617	TAA	5	15448	15462	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_012617	TA	7	15489	15503	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_012617	AATAT	3	15543	15557	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_012617	TAT	4	15609	15620	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Geisha distinctissima mitochondrion