ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Panonychus ulmi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012571	ATAA	3	502	512	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226968600
2	NC_012571	ACTTT	3	535	548	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	226968600
3	NC_012571	GAG	4	659	670	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	226968600
4	NC_012571	T	12	1388	1399	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	226968600
5	NC_012571	TTTA	3	1473	1483	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226968600
6	NC_012571	T	12	1633	1644	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	226968601
7	NC_012571	AAAT	3	1958	1968	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_012571	AT	6	1986	1997	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_012571	TA	7	2156	2169	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_012571	AAAT	4	2170	2184	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_012571	TAAA	3	2237	2247	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_012571	TAAT	3	2496	2511	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_012571	AATTT	3	2559	2573	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_012571	TAAAT	4	2734	2752	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_012571	A	15	2840	2854	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012571	TAA	4	3248	3260	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226968602
17	NC_012571	ATA	4	3283	3294	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226968602
18	NC_012571	TAAT	3	3455	3466	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012571	TTAA	3	3541	3551	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_012571	ATTAAA	3	3760	3777	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	226968603
21	NC_012571	TAAA	3	3811	3822	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226968603
22	NC_012571	ATA	4	3908	3919	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226968603
23	NC_012571	AAAT	5	4077	4096	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	226968603
24	NC_012571	TTTTC	3	4110	4124	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	226968603
25	NC_012571	A	13	4186	4198	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	226968603
26	NC_012571	ATT	4	4211	4222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226968603
27	NC_012571	A	14	4265	4278	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	226968603
28	NC_012571	TA	6	4287	4297	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226968603
29	NC_012571	TTAAA	3	4308	4321	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	226968603
30	NC_012571	ATAA	4	4424	4439	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	226968604
31	NC_012571	TAAA	4	4869	4884	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	226968604
32	NC_012571	AATA	3	4885	4896	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226968604
33	NC_012571	A	13	4918	4930	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	226968604
34	NC_012571	ATAA	5	5018	5038	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226968605
35	NC_012571	TTA	4	5394	5405	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226968606
36	NC_012571	AATAT	3	5536	5549	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	226968606
37	NC_012571	TTCAT	3	5612	5625	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	226968606
38	NC_012571	TAA	4	5690	5700	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226968606
39	NC_012571	ATTAA	4	6058	6076	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_012571	AT	6	6081	6091	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_012571	TAATTT	3	6223	6241	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_012571	ATA	4	6963	6973	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226968607
43	NC_012571	A	12	7133	7144	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	226968607
44	NC_012571	AATT	3	7219	7231	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226968607
45	NC_012571	ATT	4	7259	7270	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226968607
46	NC_012571	TTAA	3	7637	7648	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226968608
47	NC_012571	TAT	4	7886	7898	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226968608
48	NC_012571	TATC	3	8062	8072	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	226968608
49	NC_012571	ATA	6	8310	8326	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	226968608
50	NC_012571	T	27	8325	8351	27	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	226968608
51	NC_012571	TAAA	3	8567	8578	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226968608
52	NC_012571	ATA	4	8811	8821	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226968609
53	NC_012571	ATATAA	3	8888	8904	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	226968609
54	NC_012571	TA	6	9017	9028	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226968609
55	NC_012571	T	20	9027	9046	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	226968609
56	NC_012571	TTTA	3	9247	9258	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	226968610
57	NC_012571	TAT	4	9410	9421	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226968610
58	NC_012571	ATT	4	9695	9706	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226968610
59	NC_012571	T	14	9783	9796	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	226968610
60	NC_012571	T	12	10077	10088	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	226968610
61	NC_012571	TAA	4	10176	10186	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226968610
62	NC_012571	ATTT	3	10187	10198	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	226968610
63	NC_012571	T	15	10439	10453	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	226968611
64	NC_012571	TAT	5	10465	10479	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226968611
65	NC_012571	TAT	5	10499	10513	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226968611
66	NC_012571	TAG	4	10600	10610	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	226968611
67	NC_012571	ATA	4	10792	10803	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226968611
68	NC_012571	TAAA	3	10834	10844	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226968611
69	NC_012571	ATT	4	10857	10868	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226968611
70	NC_012571	T	23	11069	11091	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	226968611
71	NC_012571	T	12	11093	11104	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	226968611
72	NC_012571	AT	11	11479	11499	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226968611
73	NC_012571	T	13	11497	11509	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	226968611
74	NC_012571	ATTT	3	11640	11651	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	226968611
75	NC_012571	AAT	4	11660	11672	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226968611
76	NC_012571	ATT	4	11703	11717	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226968611
77	NC_012571	TAA	4	11728	11739	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226968611
78	NC_012571	AT	9	12032	12049	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	226968612
79	NC_012571	TTTG	3	12058	12069	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	226968612
80	NC_012571	T	16	12119	12134	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	226968612
81	NC_012571	T	12	12471	12482	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	226968612
82	NC_012571	TA	6	12558	12570	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226968612
83	NC_012571	TAA	4	12597	12608	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226968612
84	NC_012571	TAA	4	12734	12745	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226968612
85	NC_012571	ATTT	3	12746	12756	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226968612
86	NC_012571	TA	7	12784	12797	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226968612
87	NC_012571	T	16	12798	12813	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	226968612
88	NC_012571	T	18	12885	12902	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	226968612
89	NC_012571	TTCT	3	13012	13023	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_012571	TA	8	13025	13040	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Panonychus ulmi mitochondrion