ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Yemmalysus parallelus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012464	TAA	4	202	213	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464128
2	NC_012464	ATA	4	234	245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464128
3	NC_012464	ATT	5	657	671	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226464128
4	NC_012464	TAA	5	766	781	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226464128
5	NC_012464	TAA	4	1124	1135	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464128
6	NC_012464	ATT	4	1146	1157	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464128
7	NC_012464	TCAT	3	1563	1574	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	226464129
8	NC_012464	TATAA	3	1671	1684	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	226464129
9	NC_012464	ATT	5	1959	1974	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226464129
10	NC_012464	AGG	4	2052	2062	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	226464129
11	NC_012464	ATT	4	2776	2786	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226464129
12	NC_012464	ATT	4	2824	2835	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464129
13	NC_012464	TCAT	3	4171	4181	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	226464132
14	NC_012464	TATTT	3	4894	4908	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	226464133
15	NC_012464	TTA	5	5413	5427	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_012464	TAA	4	5475	5486	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464134
17	NC_012464	TATT	3	6005	6016	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_012464	TAT	4	6288	6299	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464135
19	NC_012464	TAAA	3	6319	6330	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	226464135
20	NC_012464	AATTT	3	6383	6397	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	226464135
21	NC_012464	ATTATA	3	6496	6513	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	226464135
22	NC_012464	ATAA	5	6794	6814	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226464135
23	NC_012464	TTA	4	6822	6833	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464135
24	NC_012464	AAAT	3	7197	7208	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464135
25	NC_012464	AAT	5	7401	7415	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226464135
26	NC_012464	CATT	3	7440	7450	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	226464135
27	NC_012464	AATT	3	7828	7839	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226464135
28	NC_012464	AAAG	3	8212	8222	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	226464136
29	NC_012464	TAT	4	8466	8477	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464136
30	NC_012464	AT	7	8823	8836	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226464136
31	NC_012464	AAT	5	9073	9087	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226464136
32	NC_012464	AAT	4	9851	9862	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464138
33	NC_012464	TAT	4	9937	9948	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464138
34	NC_012464	ATT	4	10035	10047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226464138
35	NC_012464	AAT	4	10056	10067	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464138
36	NC_012464	ATTT	3	10507	10517	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226464139
37	NC_012464	TAT	4	10593	10604	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464139
38	NC_012464	TAA	4	11161	11171	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464139
39	NC_012464	TCAAA	3	11586	11599	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	226464140
40	NC_012464	ATAA	3	11705	11716	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464140
41	NC_012464	ATAA	4	12161	12175	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	226464140
42	NC_012464	TAA	4	12368	12379	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464140
43	NC_012464	TAT	4	12472	12483	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_012464	ATTAAT	3	12743	12761	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
45	NC_012464	TAAA	4	12809	12824	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_012464	TATT	3	13022	13033	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_012464	TTTAAT	3	13174	13192	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_012464	ATAA	4	13209	13224	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012464	TTAA	3	13387	13397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_012464	TCAA	3	14239	14250	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_012464	ATA	4	14261	14272	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_012464	GATG	3	14606	14617	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012464	TA	6	14882	14893	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_012464	T	16	15061	15076	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_012464	ATT	4	15182	15193	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_012464	TAT	4	15302	15312	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_012464	TAT	4	15358	15368	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_012464	TAT	4	15414	15424	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_012464	TAT	4	15470	15480	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_012464	TAT	4	15526	15536	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_012464	TAT	4	15582	15592	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_012464	TAT	4	15638	15648	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_012464	TAT	4	15694	15704	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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