ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phaenacantha marcida mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012460	CTT	4	186	197	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_012460	AAAAT	3	344	358	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	226464076
3	NC_012460	TTAA	3	421	431	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226464076
4	NC_012460	TAAA	3	1231	1242	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_012460	TGAA	3	1396	1407	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	226464077
6	NC_012460	TTA	4	1968	1979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	226464077
7	NC_012460	ATT	4	2781	2791	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226464077
8	NC_012460	TAT	4	2792	2803	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464077
9	NC_012460	AAT	4	4159	4170	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464080
10	NC_012460	AAAT	3	4477	4489	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	226464080
11	NC_012460	ATT	5	4763	4776	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226464081
12	NC_012460	TTC	4	4895	4906	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	226464081
13	NC_012460	TCATAA	3	5488	5505	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	226464082
14	NC_012460	ATT	5	5688	5702	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226464082
15	NC_012460	AATT	3	6227	6238	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226464083
16	NC_012460	AAT	4	6322	6332	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464083
17	NC_012460	AATA	3	6772	6783	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464083
18	NC_012460	ATAA	4	6793	6808	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	226464083
19	NC_012460	TAAA	4	7204	7219	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	226464083
20	NC_012460	AAG	4	7320	7331	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	226464083
21	NC_012460	AAAAT	3	7631	7644	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	226464083
22	NC_012460	AAAT	3	7902	7913	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464083
23	NC_012460	AAAT	3	8086	8096	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226464084
24	NC_012460	AAAT	3	8197	8208	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	226464084
25	NC_012460	AACA	3	8788	8798	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	226464084
26	NC_012460	TA	6	8893	8904	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226464084
27	NC_012460	AAAAT	3	9036	9049	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	226464084
28	NC_012460	AAAG	4	9507	9522	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	226464085
29	NC_012460	AATA	3	9600	9610	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226464085
30	NC_012460	TAA	4	9778	9789	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464086
31	NC_012460	AATT	3	9836	9848	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226464086
32	NC_012460	TTAT	3	10138	10149	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	226464086
33	NC_012460	AATT	3	11345	11356	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226464087
34	NC_012460	TCAAA	3	11561	11574	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	226464088
35	NC_012460	ATAA	3	11680	11691	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464088
36	NC_012460	CT	7	11738	11750	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	226464088
37	NC_012460	AAAT	3	12325	12337	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	226464088
38	NC_012460	AAATT	4	12876	12894	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
39	NC_012460	TAAA	3	13312	13323	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_012460	ATAA	6	13484	13508	25	75 %	25 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
41	NC_012460	TAAA	3	13619	13630	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_012460	TTA	4	13631	13642	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_012460	ATA	4	13665	13675	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012460	AAAT	3	13988	13999	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012460	ATA	4	14230	14240	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phaenacantha marcida mitochondrion