ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Malcus inconspicuus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012458	TAT	5	213	228	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226464050
2	NC_012458	AATT	3	295	307	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226464050
3	NC_012458	TTA	4	395	409	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226464050
4	NC_012458	TA	6	594	604	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226464050
5	NC_012458	TAA	5	738	753	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226464050
6	NC_012458	AT	6	981	993	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226464050
7	NC_012458	TAT	4	994	1005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464050
8	NC_012458	ATTT	3	1129	1140	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	226464050
9	NC_012458	ATT	7	1925	1945	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	226464051
10	NC_012458	AGG	4	2018	2029	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	226464051
11	NC_012458	ATT	4	2754	2765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464051
12	NC_012458	TAA	5	2801	2814	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464051
13	NC_012458	AAT	4	3080	3092	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464052
14	NC_012458	AATT	3	3320	3331	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226464052
15	NC_012458	TAT	4	3802	3813	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464053
16	NC_012458	AATA	3	3841	3851	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226464053
17	NC_012458	TAAA	3	4079	4089	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226464054
18	NC_012458	TAA	7	4121	4141	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464054
19	NC_012458	AAC	4	4640	4651	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	226464055
20	NC_012458	AAT	4	4677	4687	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464055
21	NC_012458	ATT	4	4817	4829	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226464055
22	NC_012458	AAT	5	5457	5471	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226464056
23	NC_012458	ATA	4	6143	6154	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464057
24	NC_012458	TAA	4	6371	6381	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464057
25	NC_012458	ATAA	3	6705	6716	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	226464057
26	NC_012458	GAAA	3	6950	6961	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	226464057
27	NC_012458	CTAA	3	7001	7012	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	226464057
28	NC_012458	CAAC	3	7339	7349	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	226464057
29	NC_012458	AGA	4	7695	7707	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	226464057
30	NC_012458	TTTA	3	7886	7897	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_012458	ATAAAT	3	8707	8724	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	226464058
32	NC_012458	AAAAT	5	8911	8934	24	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	226464058
33	NC_012458	ATT	4	9175	9185	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226464058
34	NC_012458	TAT	8	9771	9792	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226464060
35	NC_012458	TAA	4	9860	9870	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464060
36	NC_012458	TAA	4	9877	9888	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464060
37	NC_012458	TTA	4	10445	10457	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226464061
38	NC_012458	ATA	4	11010	11020	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464061
39	NC_012458	TCAAA	3	11431	11444	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	226464062
40	NC_012458	ATAA	3	11550	11561	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464062
41	NC_012458	CAA	4	11672	11682	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	226464062
42	NC_012458	TAA	4	12213	12224	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464062
43	NC_012458	TAA	4	12292	12303	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_012458	AATA	4	12304	12319	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_012458	TA	6	12435	12445	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012458	AATT	3	12657	12669	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_012458	TAAA	3	12748	12758	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_012458	ATAAA	3	12763	12777	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_012458	TTA	4	12991	13002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_012458	AAAAT	3	13119	13134	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_012458	TA	6	13254	13265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_012458	TAAA	3	13586	13596	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_012458	ATA	4	13856	13867	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_012458	ATTT	3	13988	13999	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012458	TAAA	3	14384	14395	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_012458	TCC	4	14420	14431	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
57	NC_012458	ATA	4	14446	14456	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_012458	TTAA	3	15045	15056	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012458	AATT	4	15274	15289	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_012458	TAA	4	15445	15457	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_012458	ACAA	3	15505	15515	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

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