ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Macroscytus subaeneus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012457	TAAGC	3	152	165	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012457	TAT	5	411	425	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226464037
3	NC_012457	TAA	4	600	612	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464037
4	NC_012457	AT	6	840	850	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226464037
5	NC_012457	AT	6	990	1000	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226464037
6	NC_012457	ATA	5	1070	1083	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464037
7	NC_012457	TAT	4	1883	1894	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464038
8	NC_012457	TAT	4	1966	1977	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464038
9	NC_012457	GAG	4	2051	2061	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	226464038
10	NC_012457	ATA	4	3111	3122	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464039
11	NC_012457	TA	6	3238	3248	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226464039
12	NC_012457	TTA	4	4044	4054	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226464041
13	NC_012457	TAA	4	4504	4514	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464041
14	NC_012457	ATTT	3	4522	4532	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226464041
15	NC_012457	ATTAT	3	4541	4556	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	226464041
16	NC_012457	AAT	4	5094	5105	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464042
17	NC_012457	TAT	4	5771	5782	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464043
18	NC_012457	ATAA	3	6822	6833	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	226464044
19	NC_012457	TAAC	3	6959	6970	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	226464044
20	NC_012457	AAG	4	7349	7359	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	226464044
21	NC_012457	TAA	4	7637	7649	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464044
22	NC_012457	GAA	4	7885	7895	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	226464044
23	NC_012457	TA	7	7934	7947	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226464044
24	NC_012457	TAAA	3	7961	7973	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_012457	TAAA	3	8023	8034	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226464045
26	NC_012457	TAA	4	8051	8062	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226464045
27	NC_012457	AAAT	3	8166	8177	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	226464045
28	NC_012457	TAAT	3	8832	8844	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226464045
29	NC_012457	TATTAA	3	9063	9080	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	226464045
30	NC_012457	ATT	4	9102	9113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226464045
31	NC_012457	ATA	4	9547	9557	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226464046
32	NC_012457	TTTA	3	9771	9781	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226464047
33	NC_012457	ATTT	3	10836	10846	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226464048
34	NC_012457	ATT	4	11147	11157	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226464048
35	NC_012457	ATT	4	11237	11247	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226464048
36	NC_012457	TCAAA	3	11607	11620	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	226464049
37	NC_012457	ATA	4	11623	11635	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	226464049
38	NC_012457	AAACTA	4	11917	11940	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	226464049
39	NC_012457	GTAA	3	12376	12387	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	226464049
40	NC_012457	ATA	4	12462	12472	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_012457	TAA	5	12500	12514	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_012457	AAAT	3	12788	12798	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_012457	TAC	4	13165	13175	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012457	TAA	4	13645	13655	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_012457	AAAT	3	13732	13742	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012457	AAAT	3	14354	14365	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_012457	ATA	4	14387	14398	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_012457	AAT	4	14402	14413	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Macroscytus subaeneus mitochondrion