ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aeschyntelus notatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012446	TAT	4	62	74	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012446	TCT	4	186	198	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_012446	TAT	5	226	241	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226463985
4	NC_012446	AAAT	3	341	351	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226463985
5	NC_012446	AAT	5	473	487	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226463985
6	NC_012446	ATTA	3	491	501	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226463985
7	NC_012446	TAT	4	751	763	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226463985
8	NC_012446	AT	6	1232	1242	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_012446	ATT	7	1951	1971	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226463986
10	NC_012446	ATT	4	2768	2778	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226463986
11	NC_012446	TAT	4	2779	2790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226463986
12	NC_012446	ATTT	3	3225	3237	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	226463987
13	NC_012446	TATTTT	3	3837	3854	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	226463988
14	NC_012446	TATAAT	4	3849	3872	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	226463988
15	NC_012446	TAA	4	3906	3917	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463988
16	NC_012446	AATT	3	3924	3935	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	226463988
17	NC_012446	CTAT	3	4039	4049	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	226463989
18	NC_012446	TAA	4	4504	4515	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463989
19	NC_012446	AAT	4	4520	4531	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463989
20	NC_012446	ATA	4	6211	6225	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226463992
21	NC_012446	TAT	4	6263	6274	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226463992
22	NC_012446	AAT	5	6362	6376	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226463992
23	NC_012446	AAAT	4	6448	6463	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	226463992
24	NC_012446	ATA	4	6605	6616	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463992
25	NC_012446	AAAT	3	6770	6780	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226463992
26	NC_012446	ATAA	3	6786	6797	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	226463992
27	NC_012446	AAG	4	7310	7321	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	226463992
28	NC_012446	TAA	4	7595	7606	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463992
29	NC_012446	AAAAT	3	7625	7640	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	226463992
30	NC_012446	TAAAA	4	7863	7883	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	226463992
31	NC_012446	AT	6	8043	8053	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226463993
32	NC_012446	AT	6	8350	8360	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226463993
33	NC_012446	TAA	4	8404	8415	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463993
34	NC_012446	AAACAA	3	8750	8768	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	226463993
35	NC_012446	TAT	4	8805	8816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226463993
36	NC_012446	AAAT	3	8869	8879	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226463993
37	NC_012446	AAAAT	3	8958	8971	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	226463993
38	NC_012446	AAAAT	3	9395	9409	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	226463994
39	NC_012446	AAATAA	4	9435	9458	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	226463994
40	NC_012446	ATA	4	9723	9734	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463995
41	NC_012446	TAT	5	10551	10566	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	226463996
42	NC_012446	TAA	4	11122	11132	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226463996
43	NC_012446	AATA	4	11158	11173	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	226463996
44	NC_012446	ATT	4	11195	11205	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226463996
45	NC_012446	AATT	5	11411	11429	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	226463997
46	NC_012446	TCAAA	3	11553	11566	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	226463997
47	NC_012446	TAAAAA	3	11873	11890	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	226463997
48	NC_012446	ATT	5	12437	12451	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_012446	ATT	4	13088	13098	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_012446	TTA	4	13121	13132	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_012446	AAAT	3	13258	13268	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_012446	TAA	4	13295	13306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012446	AATT	3	13309	13319	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_012446	AAAAT	3	13320	13333	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_012446	AATT	3	13483	13494	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_012446	AAAAT	4	13643	13662	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_012446	ATTAA	3	13986	13999	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_012446	TAT	4	14158	14169	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_012446	TAA	4	14181	14192	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_012446	AAATA	3	14294	14307	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aeschyntelus notatus mitochondrion