ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Orius niger mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012429	CTT	4	190	201	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_012429	ATA	6	230	247	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	226463842
3	NC_012429	TTAA	3	470	480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226463842
4	NC_012429	ATA	4	782	793	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463842
5	NC_012429	AAT	4	815	825	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226463842
6	NC_012429	AT	6	972	984	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	226463842
7	NC_012429	AAT	5	991	1005	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226463842
8	NC_012429	AAT	4	1048	1059	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463842
9	NC_012429	AAAC	3	1091	1102	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	226463842
10	NC_012429	GAG	4	2017	2027	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	226463843
11	NC_012429	AGTA	3	2731	2741	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	226463843
12	NC_012429	ATA	4	4697	4708	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463847
13	NC_012429	ATTAAT	3	6135	6152	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_012429	AT	6	6255	6265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	226463849
15	NC_012429	ATA	4	6509	6520	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463849
16	NC_012429	AAT	4	6552	6563	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463849
17	NC_012429	AAATA	4	6749	6767	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	226463849
18	NC_012429	TTA	4	7046	7057	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	226463849
19	NC_012429	AAG	4	7292	7303	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	226463849
20	NC_012429	TTA	4	8286	8298	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	226463850
21	NC_012429	AATA	3	8537	8548	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	226463850
22	NC_012429	AAAT	3	8564	8575	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226463850
23	NC_012429	ATA	4	9421	9431	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	226463851
24	NC_012429	TAAAA	3	9520	9533	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	226463851
25	NC_012429	TTA	4	9941	9951	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	226463852
26	NC_012429	TAA	4	9972	9983	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463852
27	NC_012429	AAAT	3	10034	10044	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	226463852
28	NC_012429	ATA	4	10130	10141	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463852
29	NC_012429	AAT	4	10748	10759	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463853
30	NC_012429	ATTT	3	10762	10772	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	226463853
31	NC_012429	AAT	4	10868	10879	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463853
32	NC_012429	ATA	5	11402	11416	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	226463854
33	NC_012429	TAAA	4	11426	11442	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	226463854
34	NC_012429	ATAA	3	11642	11653	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	226463854
35	NC_012429	AAAC	3	11782	11793	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	226463854
36	NC_012429	AACT	3	11825	11835	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	226463854
37	NC_012429	A	13	12001	12013	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	226463854
38	NC_012429	AAATAA	3	12272	12289	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	226463854
39	NC_012429	TTAAAA	4	12290	12313	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	226463854
40	NC_012429	AT	6	12744	12754	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_012429	TAAA	3	12854	12864	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_012429	TAAA	4	13165	13180	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_012429	TAAAA	3	13277	13290	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_012429	AATTA	3	13316	13330	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012429	ATT	4	13586	13597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_012429	TAA	4	13605	13616	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_012429	ATAA	3	14247	14258	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012429	TAA	5	14360	14373	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_012429	TAAT	3	14406	14416	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Orius niger mitochondrion