ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Jatropha curcas chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012224	AT	6	2147	2157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_012224	AT	11	4650	4670	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_012224	TA	6	4674	4685	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_012224	TA	6	5189	5200	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_012224	AT	7	7687	7700	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_012224	TA	6	8239	8249	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_012224	TA	7	8278	8290	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_012224	TA	7	8295	8309	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_012224	TA	9	8385	8401	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_012224	TA	12	8400	8424	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012224	AT	6	8425	8435	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_012224	AT	6	9705	9715	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_012224	TA	16	10209	10242	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_012224	AT	9	10243	10260	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_012224	AT	11	10312	10334	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_012224	AT	6	10343	10353	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_012224	AT	8	10359	10374	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_012224	AT	7	10381	10394	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_012224	AT	8	10610	10624	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_012224	TA	6	10671	10682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_012224	TA	8	14045	14060	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_012224	TA	8	14072	14087	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_012224	TA	7	14121	14133	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_012224	TA	6	14160	14170	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_012224	TA	6	15465	15475	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_012224	AT	6	16823	16833	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	225544112
27	NC_012224	CT	6	17812	17823	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
28	NC_012224	AT	6	21478	21488	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	225544114
29	NC_012224	AT	6	29150	29161	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_012224	TA	6	32989	32999	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_012224	TA	6	33209	33219	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_012224	AT	6	34639	34649	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_012224	TA	8	36400	36414	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_012224	AG	6	39863	39873	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_012224	TC	6	40507	40517	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	225544121
36	NC_012224	TG	6	45623	45633	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	225544124
37	NC_012224	TA	6	51495	51505	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_012224	AT	6	55378	55388	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	225544129
39	NC_012224	AT	6	55636	55646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_012224	TA	8	56185	56201	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_012224	TA	7	56340	56352	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_012224	AT	6	64484	64494	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_012224	TA	6	64548	64558	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_012224	TA	7	66167	66179	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_012224	TA	6	67674	67684	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	225544137
46	NC_012224	TA	6	88804	88814	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	225544147
47	NC_012224	TA	12	88877	88901	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	225544147
48	NC_012224	AG	6	115460	115470	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	225544147
49	NC_012224	TA	7	118941	118953	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	225544147
50	NC_012224	TA	6	118958	118969	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	225544147
51	NC_012224	AT	9	121459	121475	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	225544147
52	NC_012224	AT	9	121519	121535	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	225544147
53	NC_012224	AT	6	121589	121601	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	225544147
54	NC_012224	AT	8	121608	121622	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	225544147
55	NC_012224	AT	8	122263	122277	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	225544147
56	NC_012224	TA	27	122264	122319	56	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	225544147
57	NC_012224	AT	6	122350	122361	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	225544147
58	NC_012224	AT	7	122383	122396	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	225544147
59	NC_012224	AT	7	122401	122414	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	225544147
60	NC_012224	AT	17	126154	126184	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	225544147
61	NC_012224	CT	6	131973	131984	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	225544147
62	NC_012224	AT	7	133214	133226	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	225544147
63	NC_012224	CT	6	140119	140130	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	225544147

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Jatropha curcas chloroplast