ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aspidytes niobe mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012139	ATT	4	214	225	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224587991
2	NC_012139	TAA	5	224	239	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	224587991
3	NC_012139	TA	6	255	265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	224587991
4	NC_012139	TAT	4	410	421	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224587991
5	NC_012139	AAT	4	717	729	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	224587991
6	NC_012139	TTAA	3	1085	1096	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_012139	TAT	5	1828	1842	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	225347345
8	NC_012139	GAAA	3	2035	2046	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	225347345
9	NC_012139	TATT	3	2624	2636	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	225347345
10	NC_012139	TAT	4	2639	2649	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	225347345
11	NC_012139	CATTA	3	3132	3145	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	224587993
12	NC_012139	ATT	4	3759	3771	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	225347346
13	NC_012139	AAAT	3	3818	3829	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	225347346
14	NC_012139	TTAAT	3	4072	4086	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	224587995
15	NC_012139	ATA	4	4378	4388	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	224587995
16	NC_012139	TAT	4	4424	4435	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224587995
17	NC_012139	AAT	4	5596	5607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	224587997
18	NC_012139	CTTT	3	5948	5958	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_012139	TTTATA	3	5974	5991	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_012139	ATTT	3	6032	6042	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_012139	ATAAAA	4	6117	6140	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	224587998
22	NC_012139	TTA	4	6176	6187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224587998
23	NC_012139	TAT	4	6223	6233	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	224587998
24	NC_012139	AATT	3	6385	6396	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	224587998
25	NC_012139	TAATG	3	6604	6617	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	224587998
26	NC_012139	AAAT	3	6690	6700	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	224587998
27	NC_012139	TTA	4	6987	6998	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224587998
28	NC_012139	TAA	4	7096	7107	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	224587998
29	NC_012139	AAG	4	7233	7244	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	224587998
30	NC_012139	TAA	4	7527	7539	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	224587998
31	NC_012139	ATA	4	7975	7987	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	224587999
32	NC_012139	GAA	4	8004	8015	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	224587999
33	NC_012139	AT	7	8699	8712	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	224587999
34	NC_012139	A	13	8732	8744	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	224587999
35	NC_012139	ATA	4	8765	8776	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	224587999
36	NC_012139	AAAT	4	8816	8830	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	224587999
37	NC_012139	A	15	8903	8917	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	224587999
38	NC_012139	TAA	4	8969	8979	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	224587999
39	NC_012139	A	12	9263	9274	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	225347347
40	NC_012139	ATAA	4	9387	9402	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	225347347
41	NC_012139	TAA	9	9927	9953	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	225347348
42	NC_012139	AATTAT	3	10105	10123	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	225347348
43	NC_012139	TAT	4	10755	10766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224588002
44	NC_012139	TTA	4	10786	10797	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224588002
45	NC_012139	AATTTT	3	11088	11105	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	224588002
46	NC_012139	TAAATA	3	11451	11468	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	224588003
47	NC_012139	TCTA	3	11854	11865	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	224588003
48	NC_012139	AAT	4	12125	12135	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	224588003
49	NC_012139	TAA	4	12426	12437	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_012139	TTAA	3	12492	12503	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_012139	TAAA	3	12733	12743	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_012139	AAAT	3	12797	12808	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012139	AAAT	3	13133	13144	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012139	ATTAA	3	13232	13246	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012139	TTAA	3	13338	13348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_012139	AATT	3	13527	13538	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_012139	ACAA	3	13572	13582	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_012139	TAA	4	13594	13605	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_012139	ATA	4	13954	13965	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_012139	TTAA	3	14011	14021	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aspidytes niobe mitochondrion